10 1 Full Volume (PDF)(jcmb.halic.edu.tr) - Journal of Cell and ...

More documents

Recommendations

Info

Journal of Cell and Molecular Biology <strong>10</strong>(1):27-32, 2012 Research Article 27 Haliç University, Printed in Turkey. http://<strong>jcmb</strong>.<strong>halic</strong>.<strong>edu</strong>.tr Survivin geni -625G/C polimorfizminin Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanseri ile ilişkisinin araştırılması Engin AYNACI 1 , Ender COŞKUNPINAR 2 , Ayşe EREN 2 , Onur KUM 1 , Yasemin MÜŞTERİ OLTULU 2 , Nergiz AKKAYA 2 , Akif TURNA 3 , İlhan YAYLIM 2 , Pınar YILDIZ *1 . 1 Yedikule Chest Diseases and Thoracic Surgery Training Hospital, Istanbul, Turkey 2 Department of Molecular Medicine, Institute of Experimental Medicine, Istanbul University, Istanbul, Turkey 3 Cerrahpaşa Medicine Faculty, Department of Thoracic Surgery, Istanbul University, Istanbul, Turkey (*author for correspondence; pinary70@yahoo.com) Received: 14 February 2012; Accepted: 21 May 2012 Özet Akciğer kanseri tüm kanser türleri arasında görülme sıklığı olarak ikinci sırada, kanser sebepli ölümler arasında ise ilk sırada gelmektedir. Survivin geni 17q25 kromozomal bölgesinde lokalizedir ve 142 amino asitten oluşan bir protein kodlar. Survivin (BIRC5) apoptozu düzenleyen önemli bir protein ailesi olan apoptoz proteinlerinin inhibitörü (IAPs) olarak ilk bulunan inhibitörlerden biridir ve özellikle kanser hücrelerinde ifadesi gerçekleşir. Survivin genindeki polimorfizm survivin üretimi ve aktivitesine etki edebilir, bu nedenle akciğer kanserine hassasiyet sağlar. Survivin genindeki aşırı ifadenin çok çeşitli maligniteleri içeren kanser türlerinde hastalık gelişimi, nüksü ve prognozu ile ilişkili olduğu bilinmektedir. Bu çalışmada bir Türk popülasyonunda survivin geni promotör bölgesi üzerinde bulunan -625G/C gen polimorfizmi ile küçük hücreli dışı akciğer kanseri arasında, hastalığın gelişimi ile ilgili olası ilişkilerin araştırılması amaçlandı. Çalışmaya 146 hasta, 98 kontrol olgu dahil edildi. Yöntem olarak PCR-RFLP tekniği kullanıldı. Sonuç olarak survivin -625G/C genotip dağılımları incelendiğinde hasta ve kontrol grupları arasında istatistiksel olarak anlamlı fark olmadığı tespit edilmiştir. Anahtar kelimeler: Küçük hücreli dışı akciğer kanseri, survivin, gen polimorfizmi, PCR-RFLP, biyobelirteç. Investigation of the association of survivin gene -625G/C polymorphism in non-small cell lung cancer Abstract Lung cancer is the second most common cancer type diagnosed and first in cancer related deaths among all cancers worldwide. The survivin gene is located on human chromosome 17q25, encoding a protein consisting of 142 amino acids. Survivin is one of the first reported inhibitors of apoptosis proteins, which is an important family of proteins that regulate apoptosis. Survivin gene polymorphism may affect the survivin production and activity, thus providing sensitivity for the development of lung cancer. The overexpression of survivin gene was found to be associated with disease development, recurrence and prognosis in various malignancies, including cancers. In this study the demonstration of the prognosis related associations between the -625G/C gene polymorphism located on the survivin promoter region and non small cell lung cancer in a Turkish population was aimed. 146 patients and 98 control subjects included to the study. PCR- RFLP technique was used as the method. According to survivin -625G/C genotype distribution analysis, no statistically significant difference between patients and controls were found. Keywords: Non small cell lung cancer, survivin, gene polymorphism, PCR-RFLP, biomarker.
28 Engin AYNACI et al. Giriş Akciğer kanseri tüm dünyada kansere bağlı ölümlerin önde gelen sebebi olarak bilinmektedir. Bununla birlikte özellikle Amerika’da kansere bağlı ölüm oranları arasında akciğer kanseri sıklığı gitgide azalmakta, fakat Çin gibi sigara tüketiminin özellikle son 20 yılda arttığı bazı ülkelerde akciğer kanseri sebepli ölüm oranının arttığı gözlenmektedir. Amerika’da 2008 yılında 215.020 yeni vaka belirlenirken, 161.840 kişinin bu hastalık sebebiyle öldüğü, kayıtlarda yer almaktadır. Akciğer kanserinin küçük hücreli (KHAK) ve küçük hücreli dışı (KHDAK) olmak üzere iki tipi vardır. Son 60 yıldır akciğer kanserinde hastalık gelişiminin kalıtsal bir temele oturduğu belirtilmektedir. (Julian et al., 2008). Programlanmış hücre ölümü olarak bilinen apoptoz, önemli bir hücre büyüme kontrol mekanizmasıdır (Yuan-Hung et al., 2009; Thompson, 1995). Survivin (BIRC5 olarak da bilinir) apoptozu düzenleyen önemli bir protein ailesi olan apoptoz proteinlerinin inhibitörü (IAP) olarak ilk bulunan inhibitörlerden biridir ve özellikle kanser hücrelerinde ifadesi gerçekleşir (Reed,1997). Survivin terminal tetikleyici kaspaz-3 ve kaspaz-9 aktivitesini inhibe ederek her iki apoptoz yolunun baskılanmasını bloke eder (Nicholson and Thornberry, 1997). Ayrıca survivin apoptotik uyarıcıyla indüklenen interlökin (IL-3), Fas (CD95), Bax, tümör nekroz faktörü α, kaspazlar ve antikanser ilaçlarınının etkisini yok eder (Chan et al., 2009; Yun-Hong et al., 2004). Mitozda düzenleyici rol oynadığı da çeşitli yayınlarda (Chan et al., 2009) bildirilmiş olan survivin geni 17q25 kromozomal bölgesinde lokalizedir ve 142 amino asitten oluşan bir protein kodlar (Chiou et al., 2003; Deveraux et al., 1997; Uren et al., 1998). Survivin ayrıca mikrotübül dinamiklerinin düzenlenmesinde de önemli rol oynar (Li et al., 1998; Li and Altieri, 1999; Altieri, 2006; Giodini et al., 2002). Survivin geni promotör bölgesindeki polimorfizmler genin transkripsiyonuna etki ettiği için gen aktivitesini ve ekspresyonunu değiştirerek akciğer kanserine yatkınlık sağlayabilir (Jin Sung et al., 2008). Survivin hücre döngüsünde G2/M fazında bol miktarda eksprese olur ve G1 fazında hızlı regülasyon sergiler (Li et al., 1998). Bu durum transkripsiyonel basamakta kontrol edilir ve hücre döngüsüne bağlı elementler (CDE) ve hücre döngüsü homoloji bölgeleri (CHR) survivin promotörünün proksimal bölgesinde lokalize olur (Masayuki et al., 2000; Li and Altieri, 1999). Survivin geni ekspresyon düzeylerindeki artışın bazı hastalıklar için prognostik belirteç olabileceği düşünülmektedir (Chun-Hua et al., 20<strong>10</strong>). Survivin genellikle embriyonik dokularda ifade olur ve görülen homozigot mutasyonların erken embriyonik dönemde ölümle sonuçlanması bu gen ailesinin hücre gelişimi, farklılaşması ve homeostaz sürecinde çok önemli rol oynadığını göstermektedir (Chan et al., 2009). Çeşitli tek-nükleotit polimorfizmleri survivin gen bölgesi promotöründe tespit edilmiştir. Bunlardan en çok bilineni ve literatürde en fazla çalışması yapılmış olan CDE/CHR reseptör bağlayıcı bölgede lokalize olan -31G/C gen polimorfizmidir. Survivin geninin promotör bölgesindeki bu mutasyon sonucu hücre döngüsünden bağımsız olarak genin transkripsiyonu ve bunun sonucunda da aşırı ifadesi görülür (Xu et al., 2004). Bu çalışmada KHDAK hastalarında PCR-RFLP tekniği kullanılarak survivin geni promotör bölgesindekiki -625G/C (rs8073069) polimorfizminin bir Türk popülasyonunda KHDAK hastalığına yatkınlığı araştırılmıştır. Akciğer kanseri ile ilgili olarak eldeki verilerin doğru olarak kullanılması ve buna ek olarak hastalık oluşumu ya da gelişiminin anlaşılmasına yönelik belirteçlerin ve genetik mekanizmaların anlaşılması özellikle hastalığın erken tanısı ve tedavi sürecinde bu hastalar için anlamlı olacaktır. Materyal ve metod Örneklerin tanımı Çalışma ile ilgili olarak öncelikle İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi Etik Değerlendirme Komisyonu’ndan 09.06.20<strong>10</strong> tarih ve 20<strong>10</strong>/228-36 dosya numarası ile etik kurul onayı alındı. Çalışmaya Yedikule Göğüs Hastalıkları ve Göğüs Cerrahisi Eğitim ve Araştırma Hastanesi 3. Klinikte ve İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Göğüs Cerrahisi Kliniğinde tanı konulan toplam 146 KHDAK olgusu ile yine aynı kliniklerde tetkik edilen ve kronik hastalık veya malignite bulgusu saptanmayan 98 sağlıklı kontrol olgusu alındı. Çalışmaya girmeyi kabul edenlere gönüllü olur imzaladıktan sonra 1 adet EDTA’lı tüpe <strong>10</strong> ml kanları alınarak soğuk zincirle laboratuvara ulaştırıldı. DNA izolasyonu Gönüllülerden alınan kanlardan High Pure PCR Template Preparation Kit (Roche, Manheim) protokolüne uygun olarak genomik DNA
Page 1 and 2: Journal of Cell and Molecular Biolo
Page 3 and 4: Haliç University Faculty of Arts a
Page 6 and 7: Journal of Cell and Molecular Biolo
Page 8 and 9: Laccase has many applications in ot
Page 10 and 11: dimethoxyphenol (2, 6-DMP). Kinetic
Page 12 and 13: pharmaceutical importance that has
Page 14 and 15: Gianfreda L, Xu F, Bollag JM. Lacca
Page 16: isoforms by Pleurotus pulmonarius i
Page 19 and 20: 14 Tasnim FARASAT et al. practicing
Page 21 and 22: 16 Tasnim FARASAT et al. Figure 2.
Page 23 and 24: 18 Tasnim FARASAT et al. Noronha M,
Page 25 and 26: 20 Alexander V. ATAMAN et al. Intro
Page 27 and 28: 22 Alexander V. ATAMAN et al. Table
Page 29 and 30: 24 Alexander V. ATAMAN et al. In so
Page 31: 26 Alexander V. ATAMAN et al. Matar
Page 35 and 36: 30 Engin AYNACI et al. Tablo 2. Ha
Page 37 and 38: 32 Engin AYNACI et al. Yang X, Xion
Page 39 and 40: 34Ragini SHARMA et al. Introduction
Page 41 and 42: 36Ragini SHARMA et al. lymphocytes
Page 43 and 44: 38Ragini SHARMA et al. Discussion C
Page 45 and 46: 40Ragini SHARMA et al. Kosnett. Glo
Page 47 and 48: 42 Raziye MOHAMMADPOUR et al. Intro
Page 49 and 50: 44 Raziye MOHAMMADPOUR et al. Table
Page 51 and 52: 46 Raziye MOHAMMADPOUR et al. Figur
Page 53 and 54: 48 Raziye MOHAMMADPOUR et al. Caspa
Page 55 and 56: 50 Raziye MOHAMMADPOUR et al. Figur
Page 57 and 58: 52 Raziye MOHAMMADPOUR et al. promo
Page 59 and 60: 54 Raziye MOHAMMADPOUR et al. the c
Page 61 and 62: 56 Muhammad IRFAN et al. Introducti
Page 63 and 64: 58 Muhammad IRFAN et al. Effect of
Page 65 and 66: 60 Muhammad IRFAN et al. Figure 5.
Page 67 and 68: 62 Muhammad IRFAN et al. Figure 9.
Page 69 and 70: 64 Muhammad IRFAN et al. Nimkar MD,
Page 71 and 72: 66 Abstract: A brief, informative a
Page 73 and 74: 68 may ask one referee to comment o

10 1 Full Volume (PDF)(jcmb.halic.edu.tr) - Journal of Cell and ...

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?