Alineamiento de secuencias biolÃ³gicas (pdf).

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Comparación por IdentidadesTCAGACGATTG (r=4)|| ||ATCGGAGCTGh 12345sH ACCGTsV CAGTv 1234D= h – vSi x halínea con y vDiagonal = desplazamientorelativo entre secuencias0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11┌───┬───┬───┬───┬───┬───┬───┬───┬───┬───┬───┬───┐0 │ │ T │ C │ A │ G │ A │ C │ G │ A │ T │ T │ G │├───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┤-1 │ A │ │ │ 1 │ │ 1 │ │ │ 1 │ │ │ │├───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┤-2 │ T │ 1 │ │ │ │ │ │ │ │ 2 │ 1 │ │├───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┤-3 │ C │ │ 2 │ │ │ │ 1 │ │ │ │ │ │├───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┤-4 │ G │ │ │ │ 1 │ │ │ 2 │ │ │ │ 3 │├───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┤-5 │ G │ │ │ │ 3 │ │ │ 1 │ │ │ │ 1 │├───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┤-6 │ A │ │ │ 1 │ │ 4 │ │ │ 2 │ │ │ │├───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┤-7 │ G │ │ │ │ 2 │ │ │ 2 │ │ │ │ 2 │├───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┤-8 │ C │ │ 1 │ │ │ │ 1 │ │ │ │ │ │├───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┤-9 │ T │ 1 │ │ │ │ │ │ │ │ 3 │ 1 │ │├───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┼───┤-10│ G │ │ │ │ 2 │ │ │ 3 │ │ │ │ 2 │└───┴───┴───┴───┴───┴───┴───┴───┴───┴───┴───┴───┘Paulino Gomez-PuertasBioinformática.
Comparación por IdentidadesACCGTCAGTACCGTCAGTACCGTCAGTACCGTCAGTACCGTCAGTACCGTCAGTACCGTCAGTACCGTCAGTCAGTA C C G TDesplazar una secuencia bajo la otra equivale a recorrer unamatriz por sus diagonales.Complejidad algorítmica O(N * M) O(N ) 2Paulino Gomez-PuertasBioinformática.
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