Alineamiento de secuencias biolÃ³gicas (pdf).

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Alineamientos múltiplesSi alinear 2 secuencias de 300 residuos tardase 1 segundo:Entonces:alinear 3 secuencias tardaría 300 segundosalinear 10 secuencias aprox 300 8 segs (+ que la edad del universo)Paulino Gomez-PuertasBioinformática.
CLUSTAL-W:Clustal-W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignmentthrough sequence weighting position specific gap penalties and weight matrix choice.Thomson JD, Higgins DG, Gibson TJ (1994)Nucleid Acids Research 22, 4673-4680.T-COFFEE:T-Coffee: a novel method for fast and accurate multiple sequence alignment.Notredame C, Higgins DG & Heringa J. (2000)Journal of Molecular Biology. 302, 205-217.Formación de clusters de secuencias (Clustal-W):La pareja más parecida se alinea para formar un único cluster.Este cluster se toma ahora como una sola secuencia y el procesose repite hasta tener un solo cluster con todas las secuenciasalineadas.Paulino Gomez-PuertasLos alineamientos múltiples permiten:Inferir filogenias.Construir perfiles.Bioinformática.
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