Alineamiento de secuencias biolÃ³gicas (pdf).

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HMMs y motivosEste es el más usado. Corresponde a un alineamiento contres estados (m 1 , m 2 , m 3 ) con 20 probabilidades de ser unresiduo (barras) cuatro estados de inserción (i 0 , i 1 , i 2 , i 3 ) ytres estados de delección (d 1 , d 2 , d 3 ). Las flechas representanlas probabilidades de transición entre estadosTodos o algunosde los parámetrospueden serestimados de losdatosPaulino Gomez-PuertasBioinformática.
Bases de datosPROSITE:BLOCKS:PRINTS:Pfam:Expresiones regulares y perfiles.Basada en motivos conocidos (SwissProt)Perfiles. Basada en PROSITE.Perfiles. Basada en motivos conocidosPerfiles HMM.Generación automática de motivos.SwissProt + SP-TrEMBLPaulino Gomez-PuertasBioinformática.
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Alineamiento de SecuenciasINTRODUCC
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