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Biodiversité - Société Audubon Haiti

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78<br />

IdentIfIcatIon des esPèces<br />

et noMenclature suIvIe<br />

Chaque espèce observée pour la première fois est récoltée,<br />

au moins une fois. Afin de garantir l’identification de<br />

morpho-espèces, on a constitué au jour le jour un herbier<br />

de poche où sont reprises toutes les espèces observées et<br />

leurs caractères distinctifs. Presque toutes les morpho-espèces<br />

ont été identifiés, sauf 3 espèces sont restées entièrement<br />

indéterminées. Certains individus ne sont identifiés<br />

qu’au niveau du genre ou parfois de la famille seule. Quand<br />

l’identification ne se fait pas jusqu’à l’espèce, plusieurs cas<br />

de figure peuvent se présenter:<br />

- si l’espèce en question est complètement inconnue, du<br />

moins par les chercheurs concernés, et qu’on ne sait<br />

pas s’il s’agit d’une ou plusieurs espèces, on fait suivre<br />

l’épithète générique de spp.;<br />

- s’il y a similitudes (flagrantes ou pas) avec une espèce<br />

connue, mais dont on n’est pas sûr, alors on fait précéder<br />

le nom de cette espèce par «cf.» (si la ressemblance est<br />

flagrante) ou par «aff.» (si elle ne l’est pas).<br />

On obtient ainsi des noms de morpho-espèces tels que:<br />

Piper aff. samanense, Psychotria sp.1, Passiflora cf. sexflora.<br />

Les identifications de terrain ont été vérifiées<br />

à l’aide de la flore disponible: La flore d’Haïti (Baker and<br />

Dardeau 1930), Flora de la Española (Liogier 1981, 1983,<br />

1985, 1986), Catalogus Florae Domingensis (Jiménez 1966;<br />

Moscoso 1943). La validité des noms a été vérifiée sur base<br />

d’IPNI (International Plant Names Index), de la base de<br />

données du Missouri Botanical Garden (MO) et de l’Index<br />

Kewensis.<br />

L’effort d’identification au niveau de l’espèce reste très<br />

superficiel à ce stade, bien que les morpho-espèces aient<br />

été scrupuleusement définies. Dans le cadre de cette<br />

étude préliminaire, axée sur les aspects de diversité, une<br />

identification au niveau de morpho-espèces est tout à fait<br />

satisfaisante.<br />

caractères structuraux<br />

et fonctIonnels<br />

Dans le but de mieux cerner le fonctionnement des types<br />

forestiers étudiés on a regroupé les espèces en «sousensembles»<br />

structuraux et/ou fonctionnels. Ces différents<br />

compartiments servent alors de base pour la réalisation de<br />

diagrammes qu’on appelle des «spectres».<br />

La catégorisation des espèces a été réalisée sur base des<br />

caractéristiques biologiques détaillées dans la littérature<br />

ou directement observées sur le terrain ou en herbier.<br />

tyPes bIologIques<br />

et enseMbles structuraux<br />

Le système suivi, dans cette étude, est repris de la<br />

field and are conserved at the National Herbarium of <strong>Haiti</strong><br />

(HE). They have been identified to species or morphospecies<br />

level at the Brussels herbaria (BR and BRLU), using the floras<br />

of the region (Baker and Dardeau 1930; Liogier 1981, 1983,<br />

1985, 1986; Moscoso 1943; Jiménez 1966). Spelling and<br />

synonymy of the taxa have been checked with IPNI (www.<br />

ipni.org) and the Missouri Botanical Garden databases<br />

(www.mobot.org). Many species are only identified to<br />

morphospecies but for this paper we just need to know<br />

the number of taxa. Further taxonomical studies will be<br />

necessary for phytosociological or phytogeographical<br />

purposes.<br />

data analysIs<br />

For every taxa, identified to species or morphospecies,<br />

the biological type has been defined based on commonly<br />

used classifications in tropical rainforests (Gentry and<br />

Dodson 1987; Poulsen and Balsley 1991; Senterre 2005b):<br />

canopy trees (codominant, dominant and emergent<br />

trees), shrubs, small suffrutex (perennial herbaceous plant<br />

with a ligneous base) and nano-shrubs, terrestrial herbs,<br />

herbaceous root climbers, herbaceous lianas, understory<br />

epiphytes (see also Ellenberg and Mueller-Dombois<br />

1965). Other common biological types were absent from<br />

the individuals sampled within our plots: hemiepiphytes,<br />

phanerophytic woody lianas, saprophytes and parasites.<br />

Diversity has been calculated using common diversity<br />

indexes: S = species richness; Is = Simpson index; H’ =<br />

Shannon-Wiener index; E = Pielou’s equitability; and Fα<br />

= Fisher alpha diversity (Frontier and Pichod-Viale 1993;<br />

Condit et al. 1998; Leigh and Loo de Lao 2000).<br />

Where fi is the relative abundance of a species i and N is<br />

the number of individuals represented by all the S species<br />

Some of these indexes are influenced by the sampling effort<br />

(S, H’) while others are relatively little influenced when<br />

more than 50 individuals are sampled (Is, Fα). The Simpson’s<br />

index is a non-parametric one and gives very low<br />

weight to rare species while Fisher alpha index depends<br />

on a distribution hypothesis and consider rare species,<br />

which are an important component of diversity in rainforests.<br />

This last index is easily calculated based just on the<br />

number of individuals and on the number of species, and<br />

is now widely used in tropical forest diversity studies.<br />

Species-individuals curves are another useful tool for comparing<br />

the diversity of different samples because it gives<br />

the index and its evolution with sampling effort. We calculated<br />

such curves by permuting 50 times the order of<br />

the individuals of a selected plot or subplot in order to<br />

get smoothed curves and confidence interval (rarefaction<br />

curves). For this, we used EstimateS (Colwell 2004) and<br />

considered individuals as «plots».

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