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Analyse spatiale de la diversité en vue de planifier la conservation<br />

Par exemple, une zone présentant la diversité alpha la plus élevée est habituellement choisie<br />

en priorité comme premier site de conservation in situ (si l’on fait abstraction des contraintes<br />

logistiques) mais le choix de la zone de seconde priorité est une question plus complexe à<br />

résoudre, dans le cas où il reste des ressources disponibles. La zone de seconde priorité ne<br />

doit pas nécessairement être celle qui présente le deuxième plus haut niveau de diversité<br />

alpha, car il se peut qu’une grande part de cette diversité soit déjà conservée dans la première<br />

zone. Dans ce cas, il faut prendre en compte la diversité beta et se focaliser sur les zones où<br />

l’espèce ou la composition allélique est différente de celle trouvée dans la première zone.<br />

Cette notion de complémentarité est prise en compte dans DIVA-GIS. Les activités de<br />

conservation cherchent généralement à traiter le plus grand nombre possible d’espèces, mais<br />

elles peuvent aussi cibler la conservation d’une espèce particulière. Dans ce cas, les allèles<br />

sont utilisés comme unité de diversité observée pour la définition des zones de conservation<br />

in situ des gènes. Ce concept est présentée dans l’analyse suivante consacrée au cherimoya.<br />

PROGRAMMES ET FICHIERS DE DONNEES A UTILISER DANS CETTE SECTION<br />

Programmes :<br />

• DIVA-GIS<br />

• Excel<br />

Fichiers de données :<br />

Répertoire 5.4 Conservation Strategies (Stratégies<br />

de conservation)<br />

• SSR cherimoya rand column (shp, shx, dbf)<br />

• Latin America Countries (shp, shx, dbf)<br />

• Protected Areas Latin America (shp, shx, dbf)<br />

5.4.1. Comment identifier les zones prioritaires pour la conservation in situ ou<br />

pour la collecte de matériel génétique<br />

Avec cette analyse, vous apprendrez à utiliser l’option Analysis (Point to Grid et Reserve<br />

Selection) de DIVA-GIS pour aider à définir des zones de conservation prioritaires. La procédure<br />

Reserve Selection utilise un algorithme d’optimisation qui a été développé à l’origine<br />

pour minimiser la surface nécessaire pour conserver la diversité des plantes à fleurs en Afrique<br />

du Sud (voir Rebelo et Siegfried, 1992). Dans cette analyse, nous utiliserons cet algorithme<br />

pour définir le nombre minimum d’unités géographiques nécessaires pour conserver toute la<br />

diversité génétique (mesurée au moyen de marqueurs moléculaires) et pour identifier, par ordre<br />

d’importance, les unités géographiques prioritaires pour la conservation. Les données utilisées<br />

dans l’analyse précédente le seront ici aussi. Le même type d’analyse peut être conduit également<br />

au niveau espèces.<br />

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