Cahier d'Exercices en Biochimie - FacultÃ© de mÃ©decine Saint-Antoine

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Cahier d'Exercices en Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 10TABLEAU IIAcide aminé Nombre Acide aminé Nombreala Alanine leu Leucinearg Arginine lys Lysineasn Asparagine met Méthionineasp Acide Aspartique phe Phénylalaninecys Cystéine pro Prolinegln Glutamine ser Sérineglu Acide Glutamique thr Thréoninegly Glycocolle trp Tryptophanehis Histidine tyr Tyrosineile Isoleucine val ValineIV. Une propriété biologique de la protéineLa protéine codée par le gène spo II G interagit avec l’ADN. Ce fait est-il compatible avec lacomposition en acides aminés du fragment analyse ? Pourquoi ?V. Les nucléotides modifiés chez quelques mutants.Cette protéine peut-être purifiée à partir de la souche sauvage et de 3 mutants affectés dansle gène spo II G. Elle est soumise à une électrophorèse en conditions non dénaturantes;dans ces conditions la migration s’effectue selon la charge électrique.a. Quel nucléotide doit-on trouver en position 71 chez les mutants pour obtenir les profilsd’électrophorèse présentés dans le figure I ?FIGURE I+Sauvage Mutant 1 Mutant 2 Mutant 3-Nucléotiden°71GFaculté de Médecine Saint-Antoine
Cahier d'Exercices en Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 11VI. En résumé :Le tableau III concerne 18 des 120 nucléotides de la séquenceTABLEAU IIIADN . . . CAT ATA . . .DOUBLE-BRIN . . . GAA . . .ARNm . . . GUC . . .ANTICODONCAGdes ARNtACIDEAMINElystrpa. Déterminer le sens de transcription. Justifier.b. Orienter l’ARNm, les deux brins de la molécule d’ADN et compléter le tableau III.c. Schématiser par un trait la chaîne polypeptidique en l’orientant et en donnant laposition relative des acides aminés déterminés.3.9 Soit la séquence d’un brin d’un fragment d’ADN isolé à partir d’E.Coli :5’-GTAGCCTACCCATAGG-3’a. On suppose qu’un ARNm est transcrit à partir de cet ADN, en utilisant comme brinmatrice le brin complémentaire. Quelle sera la séquence de cet ARNm ?b. Quel peptide obtiendrait-on si la traduction commençait précisément à l’extrémité 5’ decet ARNm. ? (On admettra ici qu’aucun codon de départ n’est nécessaire, comme cela seprésente in vitro dans certaines conditions expérimentales). Quel ARNt se liera au ribosomeaprès le départ de l’ARNt Ala ? Quelles sont, s’il y en a, les liaisons rompues lorsque legroupement amine de l’alanine s’engage dans une liaison peptidique, et qu’arrive-t-il àl’ARNt Ala ?c. Combien de peptides différents cet ARNm code-t-il ? Obtiendrait-on les mêmes peptidessi, pour la transcription, c’était l’autre brin de l’ADN qui servait de matrice ?d. Cette portion d’ADN est transcrite comme indiqué en (a), mais vous ne savez pas quelleest la phase de lecture utilisée ; cet ADN peut-il provenir du début d’un gène ?3.10 Après qu’elle a été synthétisée, on enlève quelques acides aminés à l’extrémité C-terminale de la béta-lactamase de B. lichenformis. On peut déduire la séquence C-terminale de cette enzyme en la comparant à celle d’un mutant pour lequel la phase delecture a été décalée à la suite de l’insertion ou de la délétion d’un nucléotide ; Ondonne ci-dessous les séquences en acides aminés, du résidu 263 à l’extrémité C-terminale, de l’enzyme sauvage purifiée et du mutant frameshift (décalage de la phasede lecture) :sauvage : N M N G Kmutant : N M I W Q I C V M K Da. Quel évènement mutationnel a donné naissance au mutant frameshift ?b. En déduire le nombre d’acides aminés et si possible la séquence C-terminale de l’enzymesauvage.3.11 Compléter les propositions suivantes.a. _____________________________ copie une portion d’ADN en ARN lors d’un processus appelé_____________________________ .b. La synthèse d’ARN débute à un _____________________________ dans l’ADN et finit à un________________________________ .Faculté de Médecine Saint-Antoine
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