Interazioni non covalenti - Structural Biology

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Interazione elettrostatica tra NH 3 + e COO - in Ala che diminuisce all’aumentare della distanza (Ala) 4 Ala + + Ala - Ala - NH 3 + -CH(CH3)-COOH NH 3 + -CH(CH3)-COO - Ala + + Ala - Ala - NH 2 -CH(CH3)-COO - pK 1 pK 2 2.34 9.69 + Ala-Ala + Ala-Ala - Ala-Ala - 3.12 8.30 + Ala-Ala-Ala + Ala-Ala-Ala - Ala-Ala-Ala - 3.39 8.03 + Ala-Ala-Ala-Ala + Ala-Ala-Ala-Ala - Ala-Ala-Ala-Ala - 3.42 7.94
In un sistema <strong>non</strong> perturbato pK α = ΔG o /2.303 RT ΔG c = 2.303 RT (pK’ α - pK α ) i.e. Alanina pK α imperturbato COO - (Ala) 4 3.42 pK’ α perturbato COO - Ala 2.34 => ΔG c = 2.303 · 0.6 (2.34-3.42) = -2.5 kcal/mole Interazione elettrostatica abbassa l’energia libera della molecola di 2.5 kcal/mole => dissociazione piu’ facile pK α piu’ basso
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