Interazioni non covalenti - Structural Biology

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Effetto dell’ambiente su alcuni gruppi di alcune proteine Lys Acetato-decarbossilasi 6.0 10.4 Glu Carbossi-peptidasi Cys Papaina 7.0 4.5 3.3 9.5
Subtilisina Proteasi a serina His 64 Agisce da base durante la catalisi accettando un protone da Ser 221 Enzima attivo a pH alcalino quando His 64 <strong>non</strong> e’ protonata => Attivita’ catalitica varia con il grado di ionizzazione di questo residuo Strategia: Mutagenesi sito-diretta su residui carichi Osservare influenza su pk di His 64 Puo’ questo essere previsto da un modello elettrostatico? Elimino Asp Ser 99 Glu Ser156 Abbassano il pK
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Page 5 and 6: Legge di Coulomb ΔE = 1 ε q 1 ·
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Page 14 and 15: Dipendenza di k cat /k M dal pH Asp
Page 23 and 24: -le interazioni elettrostatiche son
Page 25: Paragone tra melting e boiling poin
Page 28 and 29: Affinche’ due molecole in soluzio
Page 30 and 31: CH 3 C = O HN NMA N-MethylAcetamide
Page 33: ΔG O TR = -RT ln SH 2 O CH 4 benze
Page 36 and 37: Creazione di cavita’ T4 Lisozima
Page 38 and 39: 1) Creare cavita’ nel solvente. 2
Page 43: Hydrogen Bonds
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Page 48 and 49: ΔG T # = ΔGB + ΔG # Cinetica enz
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Page 54 and 55: Delezione di un gruppo che forma un
Page 56: Alcune caratteristiche delle catene

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