3. Relativamente ai marcatori microsatelliti 1, 2, 3, sulla base dello schema riportato nella sezione 3.3, quantisono i genotipi omozigoti e quali?Microsatellite 1 Microsatellite 2 Microsatellite 3N. genotipi omozigoti: ________Genotipi:________________________________________________________________________________________________________________________N. genotipi omozigoti: ________Genotipi:____________________________________________________________________________________________________________________________N. genotipi omozigoti: ________Genotipi:____________________________________________________________RispostaMicrosatellite 1 Microsatellite 2 Microsatellite 3N. genotipi omozigoti: 24N. genotipi omozigoti: 16N. genotipi omozigoti: 21Genotipi: 414,414; 417,417; 420,420;Genotipi: 224,224; 228,228; 232,232; 236,236; Genotipi: 102,102; 106,106; 110,110;423,423; 426,426; 429,429; 432,432;240,240; 244,244; 248,248; 252,252; 256,256; 114,114; 118,118; 122,122; 126,126;435,435; 438,438; 441,441; 444,444;260,260; 264,264; 268,268; 272,272; 276,276; 130,130; 134,134; 138,138; 142,142;447,447; 450,450; 453,453; 456,456;280,280; 284,284146,146; 150,150; 154,154; 158,158;459,459; 462,462; 465,465; 471,471;162,162; 166,166; 170,170; 174,174;474,474; 477,477; 480,480; 483,483;178,178; 182,1824.Relativamente al marcatore microsatellite 1 sulla base dello schema riportato nella sezione 3.3, in<strong>di</strong>carealmeno 5 possib<strong>il</strong>i genotipi eterozigoti. Identificare gli alleli in base al numero <strong>di</strong> ripetizioni (ad es, 5,9; ve<strong>di</strong>§1.8).Genotipo eterozigote 1 _______________Genotipo eterozigote 2 _______________Genotipo eterozigote 3 _______________Genotipo eterozigote 4 _______________Genotipo eterozigote 5 _______________Risposta:per scrivere un genotipo eterozigote, bisogna abbinare un allele con un determinato peso molecolare, ossia con un dato numero <strong>di</strong>ripetizioni, con un altro allele <strong>di</strong> peso molecolare <strong>di</strong>verso dello stesso microsatellite, ad esempio 7,12 oppure 4,5.5. Scrivere un possib<strong>il</strong>e genotipo <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo eterozigote per tutti e tre i marcatori microsatelliti analizzati.Identificare gli alleli in base al numero <strong>di</strong> ripetizioni (ad es. 5, 9; ve<strong>di</strong> §1.8).Risposta:marcatore microsatellite 1: due alleli <strong>di</strong>versi, ad esempio 2,9marcatore microsatellite 2: due alleli <strong>di</strong>versi, ad esempio 4,16marcatore microsatellite 3: due alleli <strong>di</strong>versi, ad esempio 8,156. Scrivere un possib<strong>il</strong>e genotipo <strong>di</strong> un in<strong>di</strong>viduo omozigote per <strong>il</strong> marcatore microsatellite 1 ed eterozigote per imarcatori microsatelliti 2 e 3. Identificare gli alleli in base al numero <strong>di</strong> ripetizioni (ad es. 5, 9; ve<strong>di</strong> §1.8).______________________Risposta:marcatore microsatellite 1: due alleli uguali, ad esempio 3,3marcatore microsatellite 2: due alleli <strong>di</strong>versi, ad esempio 5,10marcatore microsatellite 3: due alleli <strong>di</strong>versi, ad esempio 1,97. Si consideri l’in<strong>di</strong>viduo <strong>il</strong> cui genotipo è stato scritto nel problema 6, ossia un in<strong>di</strong>viduo omozigote per <strong>il</strong>microsatellite 1 ed eterozigote per i microsatelliti 2 e 3. Si supponga <strong>di</strong> aver prelevato un campione <strong>di</strong> cellule daquesto in<strong>di</strong>viduo, ad esempio un prelievo <strong>di</strong> sangue, <strong>di</strong> aver estratto <strong>il</strong> DNA, <strong>di</strong> aver tipizzato questo in<strong>di</strong>viduome<strong>di</strong>ante PCR per i microsatelliti 1, 2 e 3 e <strong>di</strong> aver fatto migrare i prodotti <strong>di</strong> PCR su gel <strong>di</strong> agarosio.Disegnare che tipo <strong>di</strong> bande <strong>di</strong> DNA ci si aspetta <strong>di</strong> osservare sul gel e in che posizione, rispetto ad un marcatore<strong>di</strong> peso molecolare.14
isposta8. Si considerino tre in<strong>di</strong>vidui, A, B e C.Relativamente al marcatore 1, si supponga che l’in<strong>di</strong>viduo A sia omozigote per l’allele 6, l’in<strong>di</strong>viduo Beterozigote per gli alleli 10 e 15 e l’in<strong>di</strong>viduo C omozigote per l’allele 11.Relativamente al marcatore 2, si supponga che l’in<strong>di</strong>viduo A sia eterozigote per gli alleli 3, 8, l’in<strong>di</strong>viduo Beterozigote per gli alleli 1 e 12 e l’in<strong>di</strong>viduo C omozigote per l’allele 4.Relativamente al marcatore 3, si supponga che l’in<strong>di</strong>viduo A sia omozigote per l’allele 9, l’in<strong>di</strong>viduo Beterozigote per gli alleli 10 e 12 e l’in<strong>di</strong>viduo C eterozigote per gli alleli 16 e 21.Disegnare le bande <strong>di</strong> DNA che ci si aspetta <strong>di</strong> osservare sul gel e in che posizione, rispetto ad un marcatore <strong>di</strong>peso molecolare.risposta15