Revista Batata Show - Ano 9 - n° 25 - dezembro de 2009

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batata semente
são facilmente reproduzíveis e de distribuição
frequente e aleatória, permitindo
uma cobertura ampla do genoma.
Estudos de caracterização molecular de
coleções distintas de batata, contendo
variedades comerciais, podem sugerir
a presença de possíveis duplicatas e de
possíveis parentais para uso nos programas
de melhoramento. Apesar da ampla
variabilidade genética detectada pelos
SSR, alguns acessos tendem a se agruparem
dentro das coleções. Para a caracterização
molecular dos indivíduos, o DNA é
extraído a partir de folhas jovens, através
da metodologia baseada em CTAB 3%. A
quantificação (concentração de DNA de
cada indivíduo) pode ser estimada em gel
de agarose (0,8%) (Figura 1)
Figura 1 - Quantificação de amostras de DNA em
gel de agarose (0,8%).
Os produtos de amplificação são obtidos
utilizando primers específicos e PCR (reação
da polimerase em cadeia), após esta
reação são visualizados em gel de poliacrilamida
(6%), proporcionando alto nível
de resolução (Figura 2).
Figura 2 – Padrões de bandas de SSR, (1 - 15: Pedro
Hayashi; 16 - 38: EPAMIG); pb 100 e 10; primer STM
0037). (primers descritos por Guislain et al., 2006).
Para as análises, matrizes com dados binários
são construídas, de acordo com a
nitidez das bandas (1 para presença de
bandas e zero para ausência) e, através
destes dados, é calculada uma matriz de
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similaridade utilizando o coeficiente de
similaridade de Jaccard. Com este coeficiente
e com o método aglomerativo
UPGMA, são realizadas análises de agrupamento
(NTSYSpc) e reamostragens
(Bootstraps), Para facilitar a visualização
dos resultados são construídos dendrogramas
que permitem a distinção genética
entre os acessos (Figura 3).
O coeficiente de similaridade de Jaccard
variou de 0,41 a 0,93 (Figura 3), apresentou
grande variabilidade genética entre
os acessos, entretanto é possível observar
uma possível duplicata para ‘Atlantic’
(Canadá) e ‘Atlantic’ (Chile). A variedade
HPC-7B (Figura 4) mostrou-se como o
acesso mais divergente, comparado com
os demais, visto que, este material é derivado
do cruzamento de Solanum phureja
e Solanum chacoense. Esta divergência
genética é devido ao material ser diplóide,
sendo usado como parental em cruzamentos.
Entretanto, apesar de a batata
possuir uma base genética estreita, os
SSR podem detectar ampla variabilidade
genética. Os altos níveis de polimorfismo
sugerem que os SSR podem ser uma ferramenta
útil para detectar as diferenças
genéticas entre variedades e auxiliar em
programas de melhoramento genético de
batata.
Figura 3 - Dendrograma obtido para 38 acessos da coleção de variedades comerciais.
Figura 4 – Ilustração dos tubérculos das variedades
HPC-7B.
Literatura Citada: consulte autora
Notas de rodapé
(1) Acesso: termo utilizado para denominar toda a amostra de germoplasma que representa a variação genética de uma população ou de um
indivíduo propagado clonalmente. (2) Banco de Germoplasma: local onde estão armazenados os recursos genéticos de uma espécie. (3) Poli
morfismo: ocorrência de variação (diferença) na natureza genética. (4) Germoplasma é o conjunto de genótipos que podem doar genes
para determinada espécie.