系统发生分析小结 - abc

最 大 简 约 法 (MP) 解 释 一 个 过 程 的 最 好 理 论 是 所 需 假 设 数 目 最 少 的 那 一 个 。 对 所 有 可 能的 拓 扑 结 构 进 行 计 算 , 并 计 算 出 所 需 替 代 数 最 小 的 那 个 拓 扑 结 构 , 作为 最 优 树 。 最 大 简 约 法 不 需 要 在 处 理 核 苷 酸 或 者 氨 基 酸 替 代 的 时 候 引 入 假 设 ( 替代 模 型 )。 此 外 , 最 大 简 约 法 对 于 分 析 某 些 特 殊 的 分 子 数 据 如 插 入 、缺 失 等 序 列 有 用 。 在 分 析 的 序 列 位 点 上 没 有 回 复 突 变 或 平 行 突 变 , 且 被 检 验 的 序 列 位 点数 很 大 的 时 候 , 最 大 简 约 法 能 够 推 导 获 得 一 个 很 好 的 进 化 树 。 在 分 析 序 列 上 存 在 较 多 的 回 复 突 变 或 平 行 突 变 , 而 被 检 验 的 序 列 位 点数 又 比 较 少 的 时 候 , 最 大 简 约 法 可 能 会 给 出 一 个 不 合 理 的 或 者 错 误 的进 化 树 推 导 结 果适 用 于 近 缘 序 列