系统发生分析小结 - abc

Permuting species within characters方 法 : 对 “ 列 ” 进 行 “ 序 列 改 变 ”, 结 果 产 生 的 序 列 组 表 面 上看 起 来 和 原 来 一 样 , 但 本 来 所 含 的 分 类 关 系(taxonomic structure ) 信 息 已 被 破 坏 。 如 果 这 样 做 并 不 明 显 改 变 那 些 分 类 相 关 的 统 计 量 ( 如 树的 总 分 支 长 度 ), 则 我 们 认 为 原 来 的 序 列 组 不 含 有 意 义的 分 类 关 系 信 息 。 如 果 这 种 统 计 量 明 显 变 大 , 则 可 认 为 原 来 的 序 列 组 含有 明 显 的 分 类 关 系 信 息 , 以 此 为 基 础 构 建 的 树 是 有 意义 的 。 这 种 方 法 的 思 路 和 前 两 种 完 全 不 同 , 类 似 于 “ 反 证 法 ”。