系统发生分析小结 - abc

Phylip 是 一 个 免 费 的 系 统 发 生 (phylogenetics) 分 析 软 件 包 ,由 华 盛 顿 大 学 遗 传 学 系 开 发 。Phylip 主 要 包 括 一 下 几 个 程 序组 : 分 子 序 列 组 、 距 离 矩 阵 组 、 基 因 频 率 组 、 离 散 字 符 组 、进 化 树 绘 制 组 。 根 据 分 析 数 据 , 选 择 适 当 的 程 序 选 择 适 当 的 分 析 方 法 : 若 分 析 的 是 DNA 数 据 , 可 以 选 择 简 约法 (DNAPARS)、 似 然 法 (DNAML,DNAMLK)、 距 离法 (DNADIST) 等 。 进 行 分 析 : 选 择 好 程 序 后 , 执 行 , 读 入 分 析 数 据 , 选 择 适 当的 参 数 , 进 行 分 析 , 结 果 自 动 保 存 为 outfile、outtree。