系统发生分析小结 - abc

最 大 似 然 法 (ML) 选 取 一 个 特 定 的 替 代 模 型 来 分 析 给 定 的 一 组 序 列 数 据 , 使 得 获 得的 每 一 个 拓 扑 结 构 的 似 然 率 都 为 最 大 值 , 然 后 再 挑 出 其 中 似 然 率最 大 的 拓 扑 结 构 作 为 最 优 树 。 最 大 似 然 法 的 建 树 过 程 是 个 很 费 时 的 过 程 , 因 为 在 分 析 过 程 中 有很 大 的 计 算 量 , 每 个 步 骤 都 要 考 虑 内 部 节 点 的 所 有 可 能 性 。 最 大 似 然 法 也 是 一 个 比 较 成 熟 的 参 数 估 计 的 统 计 学 方 法 , 具 有 很好 的 统 计 学 理 论 基 础 , 在 当 样 本 量 很 大 的 时 候 , 似 然 法 可 以 获 得参 数 统 计 的 最 小 方 差 。 只 要 使 用 了 一 个 合 理 的 、 正 确 的 替 代 模 型 , 最 大 似 然 法 可 以 推 导出 一 个 很 好 的 进 化 树 结 果 。对 于 模 型 的 巨 大 依 赖 性 是 最 大 似 然 法 的 特 征