Lsamp geeni promootoriteâ1a ja 1bâekspressiooni kvantitatiivne ...

More documents

Recommendations

Info

KOKKUVÕTE Käesoleva töö eesmärk oli kvantiteerida Lsamp promootorite ekspressioon metsikut tüüpi hiire ajus. Välja valiti 14 ajuosa, mis kvantiteeriti reaalaja-PCRi kasutades. Kvantiteeriti ka kahe organi ekspressioon ja nelja organi korral saadi mitte kvantitatiivsed tulemused. Läbi viidud pluss-puuri käitumiskatse andmed korreleeriti temporaalsagara ja ventraalse striaatumi promootorite—1a ja 1b—ekspressiooni tasemega. Töös arutleti Lsamp geeni promootorite ekspressiooni varieeruvuse üle eri aju osades. Arutelu käigus püüti seletada Lsamp geeni keerukat struktuuri ja funktsiooni kehas. Töö tulemused saab kokku võtta järgnevalt Lsamp geen ekspresseerub: primaarses somatosensoorses koores, otsmikukoores, ventraalses striaatumis, taalamuses, hüpofüüsis, hippokampuses, septumis, haistesibulas, temporaalsagaras, keskajus, ajusillas, väikeajus, piklikajus, seljaajus, silmas, südames, kopsus, maksas, neerus ja testises. Eri aju osades on Lsamp promootorite aktiivsus erinev ja esineb erinev ekspresiooni suhe promootorite vahel Inimesel võib Lsamp geeni esimene ning närilisel esimene ja teine intron sisaldada regulatoorseid motiive, mis tagavad koespetsiifilise avaldumise. Varem teada olnud Lsamp geeni tuumoreid mahasuruv toime avaldub väga madalas konsentratsioonis. Lsamp geen omab olulist rolli neuronite adhesioonis ja ilmselt ka vähkkasvajate inhibitsioonis. Geeni järjestus ja struktuur on kõrgelt konserveerunud intronites, mis viitab keerukale regulatoorsele kontrollile. Samas kahe promootori esinemine tagab paindliku ekspressiooni arenevas ja arenenud organismis. LSAMP roll avaldub koostöös teiste IgLONitega heterofiilsete dimeeride ehk Diglonite kujul. Edasised uuringud peaksid keskenduma IgLONite kvantiteerimisele eri aju osades ja organites. Samuti on vaja uurida lähemalt Lsamp geeni võimalikku tuumor-supressori rolli. 28
Quantitative analysis of Lsamp promoters—1a and 1b Taavi Vanaveski Summary Various cells of the body are kept to together by cell-cell interactions. Some of these interactions are constant and some short-lived. Long-termed constant interactions cause cells to adhere and by doing so create the bases of tissue. Current work emphasizes on one of these cell adhesion molecules of the Ig superfamily named Lsamp. Lsamp gene codes for limbicsystem associated membrane protein or LSAMP and interacts heterophilically with other IgLONs. IgLONs are a family of four CAMs, LSAMP was the first member to be identified, followed by opioid-binding CAM (OBCAM), Neurotrimin (NTM)/CEPU-1 and Kilon/Neurotractin. IgLON family members are found in cell surface cholesterol-rich lipid rafts. IgLONs function predominantly as subunits of heterodimeric proteins named Diglons. Four IgLONs can form up to six Diglons. Diglons are believed to modulate neurite outgrowth. Recent experiments report that IgLONs are expressed beyond the nervous system and may have potential roles beyond the development of the nervous system to include development of other tissues and organs, and oncogenesis. In current work Lsamp gene expression was examined by quantitative real-time and both exons where amplified separately. In this approach two forward primers were used, one for 1a exon and another for 1b exon. Universal reverse primer was placed on the junction of exons 1a and 1b, on the universal part of the transcript. Real-time results were analysed and converted to 2 -∆CT . For additional data elevated plus-maze test was performed preceding realtime PCR. The expression of temporal lobe and ventral striatum were viewed in correlation with elevated plus-maze test results. Data showed that 1b promoter of temporal lobe is associated with anxiety behaviour and 1a promoter of ventral striatum is associated with risk-taking behaviour. Real-time PCR results of different brain structures showed that Lsamp is not limbic system specific and expression is also found in organs. Though expression in organs is mostly too low for quantitative approach and both promoters are not always expressed. 29
Page 1 and 2: TARTU ÜLIKOOL LOODUS- JA TEHNOLOOG
Page 3 and 4: KASUTATUD LÜHENDID CGC- väikeaju
Page 5 and 6: 1. KIRJANDUSE ÜLEVAADE 1.1 Immuuno
Page 7 and 8: protsendini. Perekonnasisene ja lii
Page 9 and 10: heterofiilsed interaktsioonid domin
Page 11 and 12: interaktsioonid on tunduvalt tugeva
Page 13 and 14: Joonis 3. Limbiline süsteem inimes
Page 15 and 16: 1.4 Lsamp promootorid Lsamp geen on
Page 17 and 18: 2. EKSPERIMENTAALOSA 2.1 Töö eesm
Page 19 and 20: 2.2.2 Tõstetud pluss-puuri test T
Page 21 and 22: Tabel 2. Reaalaja-PCRi praimerid. O
Page 23 and 24: 2.3 Töö tulemused ja arutelu 2.3.
Page 25 and 26: tingitud 129sv tüüpi hiirte vähe
Page 27: (Pimenta ja Levitt, 2004). Positiiv
Page 31 and 32: KASUTATUD KIRJANDUS Kasutatud artik
Page 33 and 34: 22. Must, A., Tasa, G., Lang, A., V
Page 35 and 36: 4. Franklin K., Paxinos G. (1997).
Page 37 and 38: TÄNUAVALDUSED Tänan oma juhendaja

Lsamp geeni promootoriteâ1a ja 1bâekspressiooni kvantitatiivne ...

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?

Lsamp geeni promootoriteâ1a ja 1bâekspressiooni kvantitatiivne ...