Akademischer Bericht 2001 - Institut für Klinische Pathologie ...

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1 Forschung
Studien über die Expression und Funktion extrazellulärer Matrix Proteoglycane der
Versican-Familie während der Embryogenese und im Verlaufe der Tumorentstehung
und –Progression
Diese langfristigen Studien erlauben uns Einblicke in die Funktion von Versicanen in der
Kontrolle von Zelladhäsion und Migration zu gewinnen. Unsere in vitro Untersuchungen
haben den Verdacht erhärtet, dass Versicane Zell-Matrix Interaktionen negativ beeinflussen.
Wir vermuten, dass die Expression von Versicanen sowohl in Barrierengeweben der
embryonalen Entwicklung als auch in der desmoplastischen Matrix in der Umgebung von
Tumoren die Einwanderung migrierender Zellen verhindern. Nach dieser Hypothese kann
die Zellmigration erst nach der Entstehung Versican-freier Zonen durch Proteolyse erfolgen.
Zurzeit befassen wir uns intensiv mit der Herstellung und Charakterisierung von
Knockout-Mäusen (Spleissvarianten- spezifische und konditionelle Geninaktivierung),
welche wir als Modelle für normale und neoplastische Zelladhäsions, Proliferations-, Migrationsstudien
einsetzen können. Zudem sind wir am Erarbeiten von Protokollen zur biochemischen
Aufreinigung der V0 und V1 Spleissvarianten für weitere in vitro Untersuchungen.
Daneben haben wir ein Projekt zur Untersuchung der Versican-degradierenden Enzyme
der ADAMTS Familie während der Embryonalentwicklung und der Tumorprogression
initiiert.
Genaue Charakterisierung der Bruchstellen der t(14;18) Translokation bei follikulären
Non-Hodgkin-Lymphomen (NHL)
Unsere Untersuchungen mittels Long-Distance-PCR haben gezeigt, dass die Bruchstellen
t(14;18) viel häufiger als bisher angenommen ausserhalb der in der Literatur beschriebenen
Major Breakpoint (MBR) und Minor Cluster Regionen (mcr) auftreten und somit der Detektion
mittels Standard-PCR entgangen sind. Wir haben deshalb einen bisher unbekannten
circa 25 kb langen genomischen Abschnitt zwischen MBR und mcr sequenziert. In einer
grösseren Studie mit Proben von Patienten mit follikulären NHL haben wir die Bruchstellen
detailliert analysiert und neue Protokolle für molekularpathologische Diagnostik ausgearbeitet.
Die Arbeit ist im American Journal of Pathology im Druckprozess. Die Untersuchung
wird nun für die Routinediagnostik eingesetzt.
Erweiterung des molekularpathologischen Instrumentariums zur Diagnose von
Ewing- und Synovialsarkomen
RT-PCR-basierte Protokolle zum Nachweis Tumor-spezifischer Translokationen werden für
molekularbiologische Untersuchungen an Frischgewebe und nach Möglichkeit auch an
formalin-fixierten und Paraffin-eingebetteten Biopsieproben etabliert. Die Untersuchungen
sollen in die molekularpathologische Diagnostik überführt werden.
Erweiterung der zytologischen Tumordiagnostik durch Einsatz von Mikrosatelliten-Analysen
zur Detektion von "Loss of Heterozygosity" spezifischer Genabschnitte.
Charakteristische Chromosomenabschnittverluste bei Tumoren (z.B. Blasenkarzinom)
sollen als diagnostische Marker bei zytologischen Krebsuntersuchungen eingesetzt werden.
Dazu werden Untersuchungen von Mikrosatelliten mittels Fluoreszenzfragmentanalyse
auf ihre Reproduzierbarkeit und Tauglichkeit für den diagnostischen Einsatz getestet.