Morphologische und DNA-analytische Untersuchungen am - OPUS ...

Einleitung____________________________________________________________19
1.4.1 Tandem-Sequenzwiederholungen
Gegenstand der Untersuchungen in dieser Arbeit sind repetitive Sequenzen, die in den
nichtcodierenden DNA-Abschnitten (Introns) entweder verstreut zwischen anderen
DNA-Sequenzen liegen oder als hintereinandergekettete Tandemwiederholungen
auftreten. Je nach Länge der Tandemwiederholungen unterscheidet man zwischen:
1. Satelliten-DNA
2. Variable number of tandem repeats (VNTRs)
Satelliten-DNA:
Minisatelliten-DNA
Mikrosatelliten-DNA
Satelliten-DNA ist im Chromosom im Centromerbereich lokalisiert und besteht aus
hochrepetitive Sequenzen, deren Länge von 5 bp bis maximal 171 bp beschrieben wird
[20]. Die Gesamtlänge des Bereiches, in der die Wiederholungseinheiten auftreten, kann
von 100 Kilobasen bis zu einigen Megabasen variieren. Ihre Allele sind für die
Spurenanalyse nicht nur zu groß, sie sind sogar ungeeignet, da ihre einzelnen Repeats
nicht identisch, sondern nur zu 95 % homolog sind.
Variable number of tandem repeats (VNTRs):
Im Gegensatz zur Satelliten-DNA sind die Anzahlen der Wiederholungen wesentlich
kürzer, sie bestehen in der Regel aus bis zu 50 Wiederholungen. Diese Wiederholungen
sind außerdem hochvariabel. Durch falsche Zusammenlagerung beim Crossover
während der meiotischen Rekombination haben sich im Verlauf der Evolution viele
verschiedene Allele gebildet, die aus jeweils einer anderen Zahl von Wiederholungen
bestehen.
Minisatelliten-DNA:
Als Minisatelliten-DNA werden DNA-Bereiche bezeichnet, bei denen Kernsequenzen
von 9 – 100 bp hintereinander geschaltet sind und die theoretisch mehrere tausend
Wiederholungen bilden können. Die Lokalisation im Chromosom liegt im
Telomerbereich [59], [62], [104].