Rättsgenetikern Marie Allen - Mentoronline.se

Nu är Sangtec i Bromma det enda laboratoriet
i Europa som gör PCR-analyserna
på organismer i fuktskadade hus. Årligen
görs 15–20 000 analyser från Sverige,
Storbritannien, Norge och Finland.
PÅ MIKROBIOLOGISKA Konsultlaboratoriet,
Mikrolab hos Sangtec Molecular Diagnostics
ansvarar avdelningschef Lena
Sporrong för PCR-analyserna som utförs
på uppdrag av Anozona.
– Att diagnostisera mikroorganismer
VANLIGA SVAMPAR I FUKTSKADADE HUS
Aspergillus spp
Det finns cirka 180 arter av mögelsvampar
inom släktet Aspergillus.
Svampen är en vanligt förekommande saprofyt
som lever på dött organiskt material
i livsmedel, jord, växter, husdamm och
på fuktskadat byggnadsmaterial över hela
världen.
Flera Aspergillusarter kan producera ett stort
antal mykotoxiner (mögelgifter) som aflatoxin,
ochratoxin, sterigmatocystin.
Vissa arter kan orsaka allvarliga sjukdomar
som aspergillos och allergisk alveolit.
Aspergillus fumigatus påverkar immunsystemet
och kan infektera personer med nedsatt
immunförsvar som cancerpatienter och
transplanterade patienter.
Penicillium spp
Släktet Penicillium omfattar över 150 arter
och kallas på svenska penselmögel. De
vanligast förekommande arterna bildar blågröna
kolonier, ofta med vit kant och små
vätskedroppar på ytan.
Pencillium är en vanligt förekommande saprofyt
och ingår tillsammans med andra
mögelsvampar i det naturliga kretsloppet
genom att leva på och bryta ned dött, organiskt
material. Svampens naturliga miljö är
jord, grönsaker, frukt och ruttnande växtdelar.
Den är också en av de allra vanligaste
mögelsvamparna som hittas på fuktskadat
material inomhus.
FOTO: RAINER SAXÉN
Rishan Tesfamikael analyserar
mikroorganismer med
PCR-teknik i ett renrumslaboratorium
hos Mikrolab i
Stockholm.
med PCR-teknik är nytt för Mikrolab. Vi
började utveckla Q-PCR för mikroorganismer
som förekommer i fuktskadade
hus på uppdrag av Anozona i början av
detta år och har utfört analyserna i kommersiell
skala under några månader, säger
Lena Sporrong.
En analys med hjälp av Q-PCR tar några
timmar, och med provpreparering, skrivarbete
med mera får beställaren provsvaret
på tre dagar.
Analysen ställer höga krav på renrums-
Penicillium används inom läkemedelsindustrin
för framställning av penicillin och inom
livsmedelsindustrin vid osttillverkning.
Penicilliumsläktet innehåller inte patogener
i större utsträckning liknande de som
finns hos Aspergillus. Förgiftningar av mykotoxiner
kan dock ske hos människor och
djur vid förtäring av mögliga livsmedel och
mögelskadat foder.
Stachybotrys chartarum
Pappersmögel som är det svenska namnet
på Stachybotrys chartarum är en strikt cellulolytisk
mögelsvamp som kräver cellulosa
som näring och hög relativ fuktighet
vid tillväxt.
I byggnader växer pappersmögel på cellulosahaltigt
byggnadsmaterial som gipsskivor,
papperstapeter, målad väv, trä och träskivor.
På senare tid har svampen fått mycket
uppmärksamhet på grund av att den förekommer
så rikligt på fuktskadade gipsskivor
som ”svartmögel”. Tidigare har den ansetts
som harmlös.
Stachybotrys kan bilda mycket giftiga metaboliter
s k makrocykliska trichotecener.
Toxiner som bildas är bland annat satratoxin
G och H. Dessa finns i cellväggarna i sporerna
och även i svampens hyfer. Sporer och
fragment av cellväggarna med toxiner kan
bli luftburet och förorena inomhusluften.
Några toxiner påverkar immunsystemet och
orsakar en typ av lunginflammation.
Analyser med Q-
PCR-teknik ställer
höga krav på
renrumsmiljö i
laboratoriet för
att proverna inte
ska kontamineras
med mögelsporer
från luften, säger
avdelningschef
Lena Sporrong.
Biotechreportage
miljö i laboratoriet för att proverna inte
ska kontamineras med mögelsporer från
luften.
Det traditionella sättet att analysera mögelsvampar
och bakterier är odling på näringsmedier,
mikroskopering och biokemiska
tester. Det är en tidsödande metod
eftersom man måste vänta på att mikroorganismerna
först förökar sig i näringsmediet.
Det kan ta allt från 2 till 14 dagar,
därefter identifieras mikroorganismerna
med avseende på utseende, pigmentering,
mikroskopering med mera och dessutom
görs en del biokemiska tester.
– Det är ibland svårt att identifiera olika
bakterier i en odling eftersom de ofta är
väldigt lika, även genetiskt. PCR-metoden
är mer exakt än odlingar på platta.
Proven kommer till laboratoriet i form
av swabb, stickor med bomull i änden,
med vilka man har tagit prov från en viss
yta. Det kommer också prov i form av
isoleringsmaterial och dammprover från
fuktskadade hus.
– För att identifiera och kvantifiera mikroorganismer
i ett prov elueras eventuella
mikroorganismer från provmaterialet.
DNA isoleras från eluatet och den sekvens
som är specifik för en viss mikroorganism
multipliceras med PCR-teknik.
PROVET ANALYSERAS mot en standard (känt
antal kopior av specifik DNA-sekvens)
och därmed kvantifieras eventuella mikroorganismer.
Analyssvaret anger antalet
mikroorganismer i ett prov (per swabb)
eller per gram provmaterial.
– Vi har validerade Q-PCR analyser för
totalantal svamp, specifika svampar som
Aspergillus, Penicillum och Stachybotrys chartarum,
samt för bakterien Escherichia coli.
– För våra övriga kunder använder vi
konventionell mikrobiologisk analys med
odling av organismerna i skålar. Innan
PCR-analys av mikroorganismer kan användas
för analys i vår övriga verksamhet
måste analysen vara beskriven i farmakopéer
eller standarder, säger Lena
Sporrong.
BIOTECH . 9 . 2005 27
FOTO: RAINER SAXÉN