07.11.2014 Views

iv. mezioborové setkênè mladðch biologů ... - Chemické listy

iv. mezioborové setkênè mladðch biologů ... - Chemické listy

iv. mezioborové setkênè mladðch biologů ... - Chemické listy

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

Chem. Listy 98, 271 – 314 (2004) IV. Amerika 2004.<br />

currently known. Only L. monocytogenes has been recognized<br />

as an important foodborne pathogen causing infections in both<br />

man and animal. L. <strong>iv</strong>anovii is primarily pathogenic for cattle<br />

and sheep. The other Listeria spp. are considered to be<br />

avirulent, although L. innocua may occasionally cause disease<br />

in ruminants and L. seeligeri has been implicated in at least<br />

one case of human listeriosis. Listeria spp. can be isolated<br />

from a d<strong>iv</strong>ersity of environmental sources, including soil,<br />

water, effluents, a large variety of foods, and the feces of<br />

humans and animals.<br />

The aim of our work was to develop rapid and simple<br />

method for general detection of genus Listeria and specific<br />

determination of Listeria monocytogenes. Two polyclonal<br />

antisera had previously been developed. With these antisera<br />

ELISAs had been set up, one specific for Listeria spp., and the<br />

other specific for L. monocytogenes. In the present study these<br />

antibodies were used to develop easy-to-use Lateral Flow<br />

ImmunoAssays that only require the addition of culture<br />

supernatant into the sampling window.<br />

This work was supported by the Grant Agency of the Czech<br />

Republic, No. 525/03/0350.<br />

PA-IIL LEKTIN Z HUMÁNNÍHO PATOGENU<br />

Pseudomonas aeuruginosa A JEHO INTERAKCE S<br />

OLIGOSACHARIDY<br />

MARTINA BUDOVÁ a , CHARLES SABIN b , EDWARD P.<br />

MITCHELL c , NECHAMA GILBOA-GARBER d , ANNE<br />

IMBERTY b , and MICHAELA WIMMEROVÁ a,e<br />

a National Centre for Biomolecular Research and e Department<br />

of Biochemistry, Masaryk Un<strong>iv</strong>ersity, Kotlarska 2, 611 37<br />

Brno, Czech Republic, b CERMAV-CNRS, 601 rue de la<br />

Chimie, BP 53, 38041 Grenoble, France, c ESRF, Experiments<br />

D<strong>iv</strong>ision, BP 220, 38043 Grenoble, France, d Bar Ilan<br />

Un<strong>iv</strong>ersity, Faculty of Life Sciences, Ramat Gan 52900, Israel<br />

budova@chemi.muni.cz<br />

Pseudomonas aeruginosa je gram-negat<strong>iv</strong>ní potenciálně<br />

patogenní bakterie, která je schopna infikovat téměř každou<br />

lidskou tkáň a např. u pacientů s cystickou fibrosou způsobuje<br />

těžkou infekci plic. Nejčastější příčinou úmrtí pacientů s<br />

cystickou fibrosou jsou právě důsledky kolonizace plic touto<br />

bakterií. P. aeruginosa produkuje významné množství lektinů<br />

vázajících D-galaktosu a L-fukosu, PA IL (LecA) a PA IIL<br />

(LecB), které jsou pravděpodobně odpovědné za primární<br />

rozpoznání hostitele a následnou adhezi bakterie a jsou úzce<br />

spjaty s virulencí tohoto patogenu 1 .<br />

Na rozdíl od většiny lektinů, jež vykazují relat<strong>iv</strong>ně<br />

nízkou afinitu k monomerním cukerným ligandům, interakce<br />

PA-IIL s fukosou je charakterizována afinitní konstantou v<br />

mikromolární oblasti. Strukturní analýza prokázala, že PA-IIL<br />

lektin je tetramer složený ze čtyř identických podjednotek,<br />

každá z nich obsahuje vazebné místo se dvěma Ca 2+ ionty,<br />

které se přímo podílí na vazbě sacharidu a jsou pravděpodobně<br />

příčinou neobvykle silné interakce mezi proteinem a cukerným<br />

zbytkem 2 . Význam četných aminokyselin především kyselého<br />

charakteru zapojených do interakce se sacharidy a jejich podíl<br />

na vazbě nám pomáhá odhalit jejich cílená mutagenese a<br />

následná charakterizace mutantů. Zvláštností vazebného místa<br />

je i zapojení C-terminálního glycinu sousedního monomeru do<br />

přímé interakce se sacharidem.<br />

Krystaly PA-IIL lektinu se daří připravit v dostatečné<br />

velikosti, což nám otevřelo novou možnost řešení kvartérní<br />

struktury proteinu na atomární úrovni neutronovou difrakcí. V<br />

současné době probíhá příprava plně deuterovaného proteinu,<br />

jež by měl umožnit pohled především na vodíkové atomy,<br />

které jsou přímo zapojeny do interakce, ať už kyselých<br />

aminokyselin ve vazebném místě či hydroxylových skupin<br />

sacharidu.<br />

LITERATURA<br />

1. Imberty A., Wimmerová M., Mitchell E. P., Gilboa-<br />

Garber N.: Microb. Infect, 6, 222 (2004).<br />

2. Mitchell E., Houles C., Sudakevitz D., Wimmerová M.,<br />

Gautier C., Pérez S., Wu A. M., Gilboa-Garber N.,<br />

Imberty A.: Nature Struct. Biol. 9, 918 (2002).<br />

ANTENNA RING AROUND TRIMERIC<br />

PHOTOSYSTEM I IN A PHOTOSYNTHETIC<br />

PROKARYOTE Prochlorothrix hollandica<br />

L. BUMBA a,b , M. HUŠÁK b , and F. VÁCHA b,c<br />

a Faculty of Biological Sciences; b Institute of Plant Molecular<br />

Biology, Czech Academy of Sciences; c Institute of Physical<br />

Biology, Un<strong>iv</strong>ersity of South Bohemia, Branišovská 31, 370 05<br />

České Budějovice<br />

bumba@umbr.cas.cz<br />

Three known species of prochlorophytes (Prochloron<br />

didemni, Prochlorothrix hollandica and Prochlorococcus<br />

marinus) are an unusual group of prokaryotes which perform<br />

oxygenic photosynthesis 1 . They are apparently related to<br />

cyanobacteria but they lack water-soluble phycobilisomes<br />

while they synthesize chlorophyll (chl) b and to form an<br />

intrinsic chla/b light-harvesting antenna. The chla/b-binding<br />

proteins (encoded by pcb genes) are not closely related to the<br />

lhc genes encoding a superfamily of the light-harvesting<br />

antenna proteins of green plastids, but instead are similar to the<br />

iron-stress induced isiA gene of cyanobacteria and to CP43, a<br />

chla-antenna protein of photosystem II (cf. 2 ). In P. holandica<br />

three Pcb antenna proteins (pcbA-C gene products) have been<br />

detected 3 . Here we show how the antenna proteins structurally<br />

interact with the photosystem I (PSI) reaction center in P.<br />

holandica. The isolated thylakoid membranes of P. hollandica<br />

were solubilized by mild detergent dodecyl-β-D-maltoside and<br />

subjected to a sucrose density gradient centrifugation. On the<br />

basis of protein composition and spectroscopic data the lowest<br />

green fraction of sucrose gradient contained polypeptides of<br />

the PSI reaction center complex associated with the Pcb<br />

proteins. In order to reveal how the PSI complex interact with<br />

the Pcb proteins the fraction was negat<strong>iv</strong>ely stained with<br />

uranyl acetate, subjected to electron microscopy and obtained<br />

images processed with SPIDER image analysis package 4 .<br />

Single particle analysis showed a Pcb-PSI supercomplex to be<br />

a more circular particle with a diameter of about 32 nm. This<br />

275

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!