Hele bladet i pdf-format - Gamma - Niels Bohr Institutet
Hele bladet i pdf-format - Gamma - Niels Bohr Institutet
Hele bladet i pdf-format - Gamma - Niels Bohr Institutet
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
<strong>Gamma</strong> 150 Peter Bjødstrup Jensen<br />
dienten. Dette giver mulighed for gruppering af mange celler i hver somit.<br />
Der findes forskellige variationer af denne model, men gennemg˚aende er<br />
sammenspillet imellem en gradient og et intracellulært ur [1].<br />
Oscillerende gen-udtryk<br />
Det er idag vist eksperimentelt, at der findes morphogen gradienter i<br />
PSM, samt at cellerne i de bageste 2/3 af PSM har oscillerende genudtryk.<br />
De første af disse oscillerende gener var medlemmer af hes familien<br />
samt lunatic fringe (lfng) og blev opdaget i slutningen af 1990’erne. Disse<br />
gener reguleres alle af det samme signaleringssystem i cellen, nemlig Notch<br />
signalvejen. De har nogle interessante egenskaber som inhibitorer af<br />
deres egen og hinandens ekspression. Man mente derfor længe, at segmenteringsurets<br />
mekanisme skulle findes i feedback netværk i Notch signalvejen.<br />
Det har imidlertid vist sig mere kompliceret end som s˚a, efterh˚anden<br />
som man har vist at andre signalveje og komponenter er involveret. Det<br />
drejer sig f.eks. om Wnt signalering, en vigtig signalvej der er aktiv i et<br />
hav af processer i b˚ade fosterudviklingen og den voksne krop. Flere gener,<br />
hvis ekspression reguleres af Wnt signalering, har vist sig at oscillere<br />
i PSM-væv med samme periode som de Notch regulerede gener. En af<br />
disse gener er axin2 [2]. Den er særlig interessant, fordi man ved at Axin2<br />
proteinet kan inhibere ekspressionen af Wnt regulerede gener, herunder<br />
alts˚a ogs˚a sin egen ekspression.<br />
Med udgangspunkt i det, var det primære form˚al med projektet, at<br />
konstruere en intracellulær oscillator baseret p˚a Wnt signalvejen og Axin2<br />
autoinhibering.<br />
Modellering af biologiske systemer<br />
I modelleringen af et molekylærbiologisk system, som f.eks. et signalsystem,<br />
ønsker man at opskrive dynamikken, der udspiller sig imellem de<br />
involverede komponenter (gener, proteiner, receptorer), p˚a matematisk<br />
form.<br />
Det forudsætter naturligvis, at der eksisterer en detaljeret molekylærbiologisk<br />
beskrivelse af systemet. Man skal vide hvilke proteiner der kan<br />
33