27.07.2013 Views

Hele bladet i pdf-format - Gamma - Niels Bohr Institutet

Hele bladet i pdf-format - Gamma - Niels Bohr Institutet

Hele bladet i pdf-format - Gamma - Niels Bohr Institutet

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

<strong>Gamma</strong> 150 Peter Bjødstrup Jensen<br />

dienten. Dette giver mulighed for gruppering af mange celler i hver somit.<br />

Der findes forskellige variationer af denne model, men gennemg˚aende er<br />

sammenspillet imellem en gradient og et intracellulært ur [1].<br />

Oscillerende gen-udtryk<br />

Det er idag vist eksperimentelt, at der findes morphogen gradienter i<br />

PSM, samt at cellerne i de bageste 2/3 af PSM har oscillerende genudtryk.<br />

De første af disse oscillerende gener var medlemmer af hes familien<br />

samt lunatic fringe (lfng) og blev opdaget i slutningen af 1990’erne. Disse<br />

gener reguleres alle af det samme signaleringssystem i cellen, nemlig Notch<br />

signalvejen. De har nogle interessante egenskaber som inhibitorer af<br />

deres egen og hinandens ekspression. Man mente derfor længe, at segmenteringsurets<br />

mekanisme skulle findes i feedback netværk i Notch signalvejen.<br />

Det har imidlertid vist sig mere kompliceret end som s˚a, efterh˚anden<br />

som man har vist at andre signalveje og komponenter er involveret. Det<br />

drejer sig f.eks. om Wnt signalering, en vigtig signalvej der er aktiv i et<br />

hav af processer i b˚ade fosterudviklingen og den voksne krop. Flere gener,<br />

hvis ekspression reguleres af Wnt signalering, har vist sig at oscillere<br />

i PSM-væv med samme periode som de Notch regulerede gener. En af<br />

disse gener er axin2 [2]. Den er særlig interessant, fordi man ved at Axin2<br />

proteinet kan inhibere ekspressionen af Wnt regulerede gener, herunder<br />

alts˚a ogs˚a sin egen ekspression.<br />

Med udgangspunkt i det, var det primære form˚al med projektet, at<br />

konstruere en intracellulær oscillator baseret p˚a Wnt signalvejen og Axin2<br />

autoinhibering.<br />

Modellering af biologiske systemer<br />

I modelleringen af et molekylærbiologisk system, som f.eks. et signalsystem,<br />

ønsker man at opskrive dynamikken, der udspiller sig imellem de<br />

involverede komponenter (gener, proteiner, receptorer), p˚a matematisk<br />

form.<br />

Det forudsætter naturligvis, at der eksisterer en detaljeret molekylærbiologisk<br />

beskrivelse af systemet. Man skal vide hvilke proteiner der kan<br />

33

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!