Hele bladet i pdf-format - Gamma - Niels Bohr Institutet

More documents

Recommendations

Info

En model for rygradens dannelse <strong>Gamma</strong> 150 feedback mekanismer. De 12 variable som systemet best˚ar af, beskrives ved følgende sæt af differentialligninger, som dog ikke vil blive diskuteret yderligere her: dC dt = cfCB[GA] − cbCC − αC dG dt = −c f[GA]GA + c b[GA][GA] − c f[NG]NG + c b[NG][NG] + γ[NG] dB dt = S − cfCB[GA] + cbCC dA dt = −c f[GA]GA + c b[GA][GA] + ctlAAm − cA dAm dt = ctsAB h − Am d[GA] τAm dt dN dt ks N = SN − ks + L τN dHm dt hN N = ctsH kN + N hN · kH kH + HhH dH dt = ctlHHm − H τH dLm dt hN N = ctsL kN + N hN · kH kH + HhH dL dt = ctlLLm − L d[NG] dt τL A kA + A = c f[GA]GA − c b[GA][GA] − cfCB[GA] + cbCC + αC − c f[NG]NG + c b[NG][NG] − H τHm − Lm = c f[NG]NG − c b[NG][NG] − γ[NG] Simulation af systemet viser, at Wnt oscillatoren er i stand til at inducere oscillationer i Notch systemet, og at disse oscillationer har en lille faseforskel. Dette fremg˚ar af figur 8. I det viste eksempel er de to negative feedback loops i Notch meget svage. Ved kraftig inhibering dæmpes Notch svingningerne betydeligt, hvilket - ihvertfald til dels - skyldes, at dynamikken, som den beskrives af de brugte ligninger, er for hurtig. Der mangler en forsinkelse af det negative feedback. En udvidelse eller ændring af Notch ligningssystemet kan muligvis udbedre dette. 40 τLm
<strong>Gamma</strong> 150 Peter Bjødstrup Jensen (c) Axin2 mAxin2 GSK3 LRP5/6 Axin2 Wnt Frizzled GSK3 GSK3 Axin2 catenin Yderligere kompleksitet GSK3 N icd N icd catenin mLfng Hes7 mHes7 Figur 7: Det samlede Wnt-Notch system. Notch Kompleksiteten bag segmenteringsuret og somitogenesen generelt vokser hele tiden, efterh˚anden som nye aktører og signalveje impliceres i processen [3]. Hertil kommer forskelle imellem forskellige dyr samt en vis grad af redundans. At b˚ade Notch og Wnt signalvejen er involveret synes sikkert, men præcist hvordan det foreg˚ar, og hvem der styrer hvem er stadig uklart. Den foresl˚aede Wnt oscillator kan forklare oscillerende Wnt target gener, men er af forskellige grunde en usandsynlig kandidat som kernen i segmenteringsuret. Interessen for kvantitative modeller for somitogenese og andre morphogenetiske processor er stærk stigende, og det er ikke mindst iblandt fysikere med kendskab til komplekse systemer og ikke-lineær dynamik. Der er stadig visse faglige barrierer imellem biologien og fysikken og matematikken, men biokompleksitet er et ekstremt spændende felt med stort behov for teoretiske tilgangsvinkler. Noget man som fysiker har rigtig gode forudsætninger for. Lfng Dll 41
Page 1 and 2: Gamma Γ Tidsskrift for fysik • S
Page 3 and 4: Fortale Kære læser Sommeren har s
Page 5 and 6: Gamma 150 Nyheder og meddelelser Ud
Page 7 and 8: Gamma 150 Nyheder og meddelelser de
Page 9 and 10: Gamma 150 Stephan Schwarz Figur 1:
Page 11 and 12: Gamma 150 Stephan Schwarz from the
Page 13 and 14: Gamma 150 Stephan Schwarz ment, alt
Page 15 and 16: Gamma 150 NOTES helpful comments on
Page 17 and 18: Gamma 150 NOTES [5] George de Heves
Page 19 and 20: Gamma 150 Rebecca B. Ettlinger og P
Page 31 and 32: Gamma 150 Peter Bjødstrup Jensen F
Page 33 and 34: Gamma 150 Peter Bjødstrup Jensen d
Page 35 and 36: Gamma 150 Peter Bjødstrup Jensen W
Page 37 and 38: Gamma 150 Peter Bjødstrup Jensen A
Page 39: Gamma 150 Peter Bjødstrup Jensen A
Page 43 and 44: —Paradokser og Opgaver Katrine Ru
Page 45 and 46: Gamma 150 Paradokser og opgaver n +
Page 48: Afsender: Returneres ved varig adre

Hele bladet i pdf-format - Gamma - Niels Bohr Institutet

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?