Hele bladet i pdf-format - Gamma - Niels Bohr Institutet

En model for rygradens dannelse Gamma 150
feedback mekanismer.
De 12 variable som systemet best˚ar af, beskrives ved følgende sæt af
differentialligninger, som dog ikke vil blive diskuteret yderligere her:
dC
dt = cfCB[GA] − cbCC − αC
dG
dt = −c f[GA]GA + c b[GA][GA] − c f[NG]NG + c b[NG][NG] + γ[NG]
dB
dt = S − cfCB[GA] + cbCC
dA
dt = −c f[GA]GA + c b[GA][GA] + ctlAAm − cA
dAm
dt = ctsAB h − Am
d[GA]
τAm
dt
dN
dt
ks N
= SN −
ks + L τN
dHm
dt
hN N
= ctsH
kN + N hN
·
kH
kH + HhH dH
dt = ctlHHm − H
τH
dLm
dt
hN N
= ctsL
kN + N hN
·
kH
kH + HhH dL
dt = ctlLLm − L
d[NG]
dt
τL
A
kA + A
= c f[GA]GA − c b[GA][GA] − cfCB[GA] + cbCC + αC
− c f[NG]NG + c b[NG][NG]
− H
τHm
− Lm
= c f[NG]NG − c b[NG][NG] − γ[NG]
Simulation af systemet viser, at Wnt oscillatoren er i stand til at inducere
oscillationer i Notch systemet, og at disse oscillationer har en lille
faseforskel. Dette fremg˚ar af figur 8. I det viste eksempel er de to negative
feedback loops i Notch meget svage. Ved kraftig inhibering dæmpes
Notch svingningerne betydeligt, hvilket - ihvertfald til dels - skyldes, at
dynamikken, som den beskrives af de brugte ligninger, er for hurtig. Der
mangler en forsinkelse af det negative feedback. En udvidelse eller ændring
af Notch ligningssystemet kan muligvis udbedre dette.
40
τLm