Rundbrief - IBO-Verein

Förderverein der
Biologieolympiade e.V.
CHRISTINA GEBLER (SCHRIFTFÜHRERIN)
Güntzstraße 22
01307 Dresden
Christina.Gebler@ibo-verein.de
Mitgliederrundbrief 04/2013
Dresden, 06.12.2013
Bericht
1. Vorstellung PD Dr. Burkhard Schroeter
2. Bericht vom Landesbeauftragtentreffen 2013 in Osnabrück
3. Bericht von der MNU-Tagung
4. Praktikumsbericht: TU Braunschweig von Jacob Wurlitzer
5. Erfahrung teilen: Studienbericht ETH Zürich von Christian Vahlensieck
6. Publikationsliste unserer Mitglieder
7. VBIO Newsletter: Paarberatung für Getreide
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Liebe Vereinsmitglieder,
das Jahr geht zu Ende und der Ein oder Andere steckt vermutlich schon im Vorweihnachtsstress. Wir
möchten Ihnen mit diesem Rundbrief ein kleines Nikolausgeschenk machen.
Auch ein Jahr voller Arbeit für den Förderverein neigt sich dem Ende zu. Vor wenigen Tagen wurde
der Preisträger des Eckhard R. Lucius Schulpreises bekannt gegeben – herzlichen Glückwunsch an das
Max-Steenbeck-Gymnasium Cottbus.
Insbesondere empfehle ich Ihnen in diesem Rundbrief die Vorstellung von PD Dr. Burkhard Schroeter,
dem neuen Geschäftsführer der IBO Deutschland. Daneben gibt es viele lesenswerte Berichte aus
allen Bereichen – ob Schülerpraktikum, Studium oder IBO-Arbeit.
Im nächsten Jahr endet die Amtszeit des derzeitigen Vorstandes und ich möchte Sie bereits jetzt dazu
ermutigen, sich zur Wahl zu stellen. Weitere Informationen erhalten Sie gesondert.
Ich wünsche Ihnen viel Freude beim Lesen des Rundbriefes und im Namen des gesamten Vorstandes
eine besinnliche Weihnachtszeit sowie einen guten Rutsch ins neue Jahr 2014.
Ihre Schriftführerin Christina Gebler
Förderverein der Biologieolympiade e.V., eingetragener Verein im Amtsregister Kiel, Vorstand:
Arne Jahn Dave Hartig Björn Schorch Christina Gebler
Vorsitzender stellv. Vorsitzender Schatzmeister Schriftführer
Holbeinstr. 157 Karl-Schmidt-Str. 7 Sautierstr. 77 Güntzstr. 22
01309 Dresden 38114 Braunschweig 79104 Freiburg 01307 Dresden
Arne.Jahn@ibo-verein.de Dave.Hartig@ibo-verein.de Bjoern.Schorch@ibo-verein.de Christina.Gebler@ibo-verein.de
Bankverbindung: HypoVereinsbank, Kontonummer 387353828, Bankleitzahl 680 201 86 (Deutschland)
Internetpräsenz: www.ibo-verein.de

1. Vorstellung PD Dr. Burkhard Schroeter
Der neue Geschäftsführer der IBO Deutschland stellt sich vor
Liebe Mitglieder des Fördervereins der Internationalen Biologie Olympiade!
Seit dem 1. Oktober 2013 habe ich die Geschäftsführung der IBO Deutschland übernommen und bin
gleichzeitig Geschäftsführer der Europäischen Science Olympiade Deutschland (EUSO), deren
Teilnehmer sich u.a. in der 3. Runde der IBO für die EUSO qualifizieren. Der Sitz der Geschäftsführung
für die IBO Deutschland ist weiterhin das Leibniz-Institut für die Pädagogik und Naturwissenschaften
und Mathematik (IPN) in Kiel, hier werden wir wie gewohnt die 3. und 4. Auswahlrunde für das
deutsche IBO-Team durchführen.
Nun zu meiner Person: Nach dem Studium der Biologie und Chemie für das Höhere Lehramt an den
Universitäten Hannover und Kiel und dem 1. Staatsexamen wechselte ich an das Institut für
Polarökologie an der Universität Kiel, wo ich 1991 mit einer Dissertation zu Photosynthese und
Wasserhaushalt von Flechten in der Antarktis promovierte. Danach folgte 1998 die Habilitation an der
Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät der Universität Kiel im Fach Botanik. In meiner
Habilitationsschrift befasste ich mich mit ökophysiologischen Untersuchungen zur Primärproduktion
von Kryptogamen mit Schwerpunkt auf den Polargebieten, die experimentellen Arbeiten führten mich
auf mehreren Expeditionen in die Antarktis und Arktis.
Im Anschluss daran war ich als Gastprofessor an den Universitäten Salzburg und Madrid sowie als
Lehrstuhlvertreter für die Ökophysiologie der Pflanzen an der Universität Kiel tätig. Mit dem 2.
Staatsexamen für das Höhere Lehramt begann dann 2004 als Gymnasiallehrer meine zweite Karriere,
die mich jedoch schnell wieder zurück an die Universität führte: Als Lehrkraft arbeitete ich ab 2004 bei
„Chemie im Kontext“ mit und war im Anschluss daran mit einer halben Abordnung bei „Biologie im
Kontext“ für die Entwicklung kompetenzorientierter Aufgaben zuständig. Nach einem kurzen
Intermezzo bei „Naturwissenschaften im Kontext“ übernahm ich von 2008 bis 2013 am IPN in Kiel die
wissenschaftliche Koordination des Hamburger Schulversuchs „alles»könner“ und des damit
verbundenen Forschungsprogramms „komdif“. Hier wurden auf empirischer Basis Kompetenzmodelle
als Grundlage die Entwicklung von kompetenzorientiertem Unterricht entwickelt und genutzt.
Schon vor dem eigentlichen Antritt meiner Stelle als Geschäftsführer der IBO Deutschland hatte ich im
Juli 2013 Gelegenheit an der Internationalen Biologie Olympiade in Bern teilzunehmen. Die
Begeisterung und Leistungsbereitschaft der teilnehmenden Schülerinnen und Schüler aus mehr als 60
Nationen wie auch das enthusiastische Engagement der Betreuer und Sponsoren haben mich sehr
beeindruckt, nicht zuletzt auch der herausragende Medaillen-Erfolg des deutschen Schülerteams in
Bern.
Die Messlatte liegt also hoch: es sollen nicht nur über die vier Auswahlrunden die Voraussetzungen für
ein erfolgreiches deutsches Team geschaffen, sondern auch gleichzeitig die erwünschte hohe
Breitenwirkung mit vielen Teilnehmern aus vielen Schulen erreicht werden. Der neue Rekord bei den
Teilnehmerzahlen der ersten Runde der IBO 2014 ist dabei Verpflichtung und Ansporn zugleich.
Die Mitglieder des Fördervereins spielen mit ihrem vielfältigen Engagement eine besonders wichtige
Rolle. Der Erfolg der IBO und des deutschen Schülerteams ist ohne die großartige Unterstützung der
Mitglieder des Fördervereins kaum denkbar!
In diesem Sinne freue ich mich auf eine gute Zusammenarbeit!
Herzlichst
Burkhard Schroeter
PD Dr. Burkhard Schroeter
Geschäftsführer IBO/EUSO Deutschland
Leibniz-Institut für die Pädagogik der Naturwissenschaften und
Mathematik (IPN) an der Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Didaktik der Biologie
Olshausenstr. 62
D-24098 Kiel
Tel.: +49 431/880-3135
Fax.: +49 431/880-2717
Email: schroeter@ipn.uni-kiel.de
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2. Bericht vom Landesbeauftragtentreffen 2013 in Osnabrück
Einmal jährlich treffen sich die Landesbeauftragten
aller Bundesländer sowie die IBO-
Geschäftsführung, um die Aufgaben von
morgen zu entwickeln, aber auch, um über die
IBO-Auswahlrunden in ihren Bundesländern zu
sprechen und den Ablauf sowohl für Lehrer als
auch für Schüler optimal zu gestalten.
Dieses Jahr fand das Treffen vom 17.-19.11. in
Osnabrück statt, Günther Kosmann war
Ausrichter der drei sehr gelungenen Tage.
Der Startschuss fiel am Sonntagabend, als wir
uns im Advena Hotel trafen.
Noch im Laufe des Abends diskutierten wir die
ersten beiden Aufgaben für die erste
Auswahlrunde der IBO 2015, wobei hier und
da einige Formulierungen verbessert und
Unklarheiten ausgeräumt wurden. Da ich mich
als ehemalige Teilnehmerin noch gut an meine
damaligen Gedanken zu den Aufgaben
erinnern konnte, war es für mich interessant,
sowohl die Aufgabenersteller- als auch
Aufgabenlöser-Position nachvollziehen zu
können.
Der Montagmorgen begann mit der Vorstellung
von PD Dr. Burkhard Schroeter, dem neuen
IBO-Geschäftsführer, den die meisten noch
nicht persönlich kannten.
Im Anschluss zeigte uns ein über Osnabrück
bestens informierter Stadtführer die schönsten
Ecken der Stadt, natürlich auch einige
Kuriositäten und wusste zu jedem Bauwerk
eine kleine Geschichte zu erzählen. Nach mehr
als zweieinhalb Stunden waren wir aber recht
durchgefroren und froh, uns in den Ratskeller
begeben zu können.
Am Nachmittag setzte sich die Diskussion der
Aufgaben fort, allerdings wurde mehr
diskutiert, denn einerseits sollten die Aufgaben
nicht zu leicht zu lösen sein, andererseits
sollten sie auch nicht unlösbar sein und
womöglich Schüler abschrecken. Doch auch
hier konnten wir die Aufgaben so anpassen,
dass alle mit der Lösung zufrieden
waren.
Dr. Christiane Mühle zeigte im
Anschluss die Auswertung der
vergangenen ersten Auswahlrunde
und ging dabei auf die von den
Schülern erreichten Punktzahlen
nach Klassenstufe, Geschlecht und
ausgewählten
Aufgaben
aufgeschlüsselt ein. Unter anderem
ging aus den Daten hervor, dass
jüngere Schüler die Aufgaben
ähnlich erfolgreich lösen konnten
wie Schüler höherer Klassenstufen.
Der Abend endete mit der
Besprechung organisatorischer
Fragen, wie dem online-Portal oder
den Terminen für das kommende
„IBO-Jahr“. Positiv entwickelt haben
sich insbesondere die Anzahlen der
teilnehmenden Schulen und der Schüler.
Der letzte Morgen wurde genutzt, um die
Entwicklung der IBO in den einzelnen
Bundesländern und die nächsten
Veranstaltungsorte
des
Landesbeauftragtentreffens zu besprechen.
Weiterhin habe ich den Förderverein
vorgestellt und allen Landesbeauftragten Hilfe
bei der Ausrichtung von Olympiaden,
Landesseminaren und Ähnlichem angeboten.
Im Anschluss machten sich alle wieder auf den
Heimweg und wir hoffen, dass uns die
Aufgaben für die kommende 1. Auswahlrunde
gelungen sind. Lasst euch überraschen.
Christina Gebler
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IBO-Verein goes MNU Bremerhaven
3. Bericht von der MNU-Tagung
Mitte November findet jedes Jahr die MNU
Tagung in Bremerhaven statt. Eine Messe und
Fortbildung für Lehrer der Mathematisch
Naturwissenschaftlichen Unterrichtsfächer.
Unter den vielen Ausstellern befand sich dieses
Jahr auch erstmals ein Stand des
Fördervereins der Biologie Olympiade. Dieser
wurde am 18. November von Mareike Erdmann
und Anna Wittek betreut.
Ein begeisterter Lehrer motiviert jedes Jahr
aufs Neue an der Biologie interessierte
Schüler. Ziel des Tagungsbesuches war es also
möglichst vielen Lehren die Biologie Olympiade
nahe zu bringen. In den ehemaligen
Teilnehmerinnen fanden die Lehrer und
Lehramt Studenten gute Ansprechpersonen in
Bezug auf den Ablauf und die Vorteile einer
Teilnahme an der IBO.
Die Gesamtbilanz des Tagungsbesuches ist
eindeutig positiv. Es konnten viele Lehrer für
die Idee der Olympiade gewonnen oder darin
bestärkt werden mit ihren Schülern weiterhin
teilzunehmen.
Mareike Erdmann (li) und Anna Wittek (re)
Anschauungsmaterial
4. Praktikumsbericht: TU Braunschweig von Jacob Wurlitzer
Bis Mitte 2013 war ich Schüler des Bertolt-
Brecht-Gymnasiums in Schwarzenberg und
legte dort erfolgreich mein Abitur ab.
Zu meinem großen Interesse an der Biologie
kam ich durch einen Lehrer und durch das
Fach Biotechnologie welches ich in der Schule
belegen durfte. Im Zuge dessen wurde ich auf
die Internationale BiologieOlympiade
aufmerksam.
Bei meiner zweiten Teilnahme am
Auswahlwettbewerb für die IBO in Bern 2013
wurde mir im Rahmen der dritten
Auswahlrunde ein Praktikum durch den
Förderverein der BiologieOlympiade e.V.
ermöglicht.
Absolvieren durfte ich diese im Institut für
Bioverfahrenstechnik in Braunschweig. Dieses
beschäftigt sich mit der Anwendung der
Bioverfahrenstechnik in der
biotechnologischen, der chemischen und
pharmazeutischen Industrie sowie der Medizin.
Dazu werden verfahrens- und gentechnische
Methoden zur Optimierung maßgeschneiderter
Biokatalysatoren und Bioprozesse genutzt.
Zugeteilt war ich dabei keiner festen
Praktikumsgruppe, sondern konnte im
Durchlauf einmal das gesamte Institut
kennenlernen sowie einen Einblick in ein
großes Spektrum verschiedener Projekte und
Versuche gewinnen. So wurde ich gleichsam
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mit mikrobiologischen Versuchen wie
Kultivierung von Mikroorganismen oder
Optimierung
verschiedener
Kultivierungsverfahren konfrontiert, genauso
wie ich molekularbiologische Arbeitstechniken
wie DNA-Extraktion oder Plasmidrestiktionen
kennenlernen durfte.
Ein Projekt, an welchem ich längere Zeit
arbeiten konnte, war die Kultivierung eines
Biofilms. Biofilme sind Zellschichten welche
sich an Grenzflächen zwischen zwei Phasen
ausbilden. Dies geschieht dadurch, dass
einzelne Bakterien über chemische
Signalmoleküle die Anwesenheit vieler
Artgenossen spüren und sich niederlassen.
Biofilme begegnen einem in der der Natur sehr
häufig, so zum Beispiel in Kreisläufen wie dem
Stickstoffkreislauf, an den Zähnen als Plaque
oder in Harnwegkathetern, wo diese
Harnwegsinfektionen auslösen können.
Letzteres war Ausgangspunkt für den Versuch.
Hierbei handelte es sich um
Grundlagenforschung, bei der das Wachstum
eines Biofilms untersucht werden sollte. Dafür
wurden 6 Tage zwei verschiedene
Nährlösungen, einmal mit Glucose und einmal
mit Citrat als Kohlenstoffquelle mit Bakterien
des Stammes Pseudomonas spec. VLB 120ΔC
versetzt und durch einen Silikonschlauch
geleitet um zu bestimmen unter welchen
Bedingungen mehr Biofilm gebildet wird.
Als Ergebnis ließ sich feststellen das die
Biofilmbildung mit Citrat deutlich besser ablief
(106 mg Biomasse) im Vergleich zu Glucose
(57 mg Biomasse).
Weitere Versuche waren u.a. die Untersuchung
eines einfachen Gärversuches mit
Saccharomyces cerevisiae bezüglich der
Produktbildung mithilfe HPLC-Messungen (high
performance liquid chromatography) und das
Auftreten reaktiver Sauerstoffverbindungen
(ROS) in Bakterienzellen.
Doch nicht nur praktisch durfte ich mich
betätigen, sondern auch theoretisch in Form
von Planung verschiedener Versuche,
metabolischer Flussanalysen sowie die
Ausarbeitung eins Vortrages um mein
Praktikum dem Institut vorzustellen.
Alles in allem war dieses Praktikum eine sehr
schöne Erfahrung für mich, da ich so einen
tiefen Einblick in die biologische Forschung
werfen konnte. Weiterhin lernte ich den
Umgang im Labor sowie bestimmte Abläufe
kennen. Dieses Praktikum bestärkte mich in
dem Wunsch einmal auch in der Forschung
tätig zu sein und das Wissen welches ich
während dieser Zeit erwarb hat sich in meinem
Studium schon jetzt als nützlich erwiesen.
Deshalb möchte ich dem Förderverein der
Internationalen BiologieOlympiade e.V.
bedanken, der mir diese Möglichkeit gegeben
hat und ich hoffe, dass nach mir auch noch
viele andere Jugendliche so zur Forschung
gelangen können.
Jacob hat zu diesem Wintersemester sein
Studium der Pharmazie an der
Friedrich-Schiller-Universität Jena begonnen.
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5. Erfahrung teilen: Studienbericht von Christian Vahlensieck
Grüetzi wohl! Ich, Christian Vahlensieck,
studiere an der ETH Zürich „Interdisziplinäre
Naturwissenschaften physikalisch-chemische
Fachrichtung“. Im Folgenden möchte ich ein
bisschen erläutern, was sich hinter dem
sperrigen Namen verbirgt, wie es dazu
gekommen ist und vielleicht auch dem einen
oder anderen der aktiven Olympioniken bei der
Studienwahl ein paar Anhaltspunkte geben.
Kurz vor „meiner“ IBO 2012 in Singapur war
ich verzweifelt: ich hatte überhaupt keine Idee,
für welche Universität und welchen
Studiengang ich mich entscheiden sollte. Ein
Jahr vorher wäre mir diese Entscheidung noch
einfacher gefallen: Es sollte Physik an der Uni
Bonn werden. Das Fach schien interessant und
zukunftsfähig, ich hatte schon ein bisschen ins
Fach reingeschnuppert und auch ein
Forschungspraktikum in der Festkörperphysik
absolviert, was ich toll fand. Doch vorrangig
durch die IBO entdeckte ich, dass es doch
nicht das war, was mich am meisten
interessierte. Physik war interessant und ich
wollte definitiv Elemente davon im Studium
haben. Doch galt und gilt mein Interesse auch
der Molekularbiologie und Biochemie. Daneben
wollte ich umfassend Mathe lernen und nach
Möglichkeit auch noch ein paar
Chemieelemente in meinen Studiengang
einschließen. Lange dachte ich, dass es dieses
Wunschstudium nicht gibt. Die fertigen
Biophysik-Studiengänge erschienen mir zu
fokussiert. Man kann danach sicher perfekt
Biophysik, doch kann man weder Biologie,
noch Physik, so schien es mir.
Eines Tages fragte mich ein Freund, warum ich
denn nicht an die ETH nach Zürich gehe. Dort
gäbe es den Studiengang Interdisziplinäre
Naturwissenschaften und neben der
biochemisch-physikalischen Richtung die
physikalisch-chemische Fachrichtung. Etwas
skeptisch, noch nie vorher hatte ich von der
Hochschule gehört, sah ich mir den
Studiengang an, und wusste, dass ich das
Richtige gefunden hatte. Allerdings gab mir
jeder, den ich fragte, eine andere Einschätzung
zu hören: die Wahl wäre gut, die ETH sei zu
forschungsorientiert oder man könnte nachher
nichts richtig. Aller Kritik zum Trotz kann ich
nach einem Jahr ein ziemlich positives
Resümee ziehen.
Im ersten Jahr hörte ich Analysis und Lineare
Algebra mit den Mathematikern, insgesamt 15
Stunden pro Woche. Auch wenn es definitiv
das schwerste und forderndste Fach des
Studiums bisher war, muss ich sagen, dass es
wirklich Spaß gemacht hat. Das Gefühl, wenn
das erste Mal ein logischer Beweis richtig
funktioniert, ist einfach unbeschreiblich. Neben
den Standard-Chemiemodulen (wovon
Anorganische und Organische Chemie freiwillig
sind) hatten wir noch Physik mit den
Physikern. Die Fächer waren allesamt gut und
die Dozenten größtenteils wirklich sehr
motiviert und auch motivierend. In den letzten
richtigen Semesterferien ohne Prüfungen
erwartete uns Interdisziplinäre
Naturwissenschaftler physikalisch-chemischer
Fachrichtung (oder besser PC-Nler, unsere
halboffizielle Bezeichnung) ein sehr hartes
Chemiepraktikum, einen Monat lang jeden Tag
von 9 bis 19 Uhr, danach Auswertung bis nach
Mitternacht. Nach einem Jahr stand die
Basisprüfung an, die entschied, ob man
weiterstudieren darf. Nach einem
durchgelerntem Sommer stellte dies sich als
nicht so schwer heraus, wie vorher befürchtet.
Mittlerweile bin ich im dritten Semester
angekommen. Für das weitere Studium gibt es
nur noch drei Pflichtmodule. Den Rest kann
man sich komplett frei aus allen
Fachrichtungen zusammenstellen und somit
seinen Interessen freien Lauf lassen, solange
der betreuende Professor zustimmt, dass die
Kombination sinnvoll ist. Aktuell vertiefe ich
mein Wissen in der Biologie, habe noch ein
Chemiepraktikum parallel und höre Physik.
Das Umfeld hier in Zürich ist toll, es wird
einem als Student sehr viel an Lebensqualität
geboten. Ständig spielen hier bekannte Bands
und es gibt gute klassische Konzerte. Einmal
jährlich findet hier die mittlerweile größte
Technoparade der Welt statt. Der akademische
Sportverein bietet unter anderem
Entspannungsräume direkt in der Uni an, in
denen man zwischen Vorlesungen schnell eine
Runde auf Massageliegen schlafen kann und
dabei meditative Klänge wahrnehmen darf.
Daneben organisieren die Fachvereine der
jeweiligen Studiengänge ständig Events, wie
z.B. Partys oder Paintball. Und wer jetzt noch
nicht überzeugt ist, sollte bedenken, dass man
morgens vom zentralen Platz in Zürich mit der
Standseilbahn direkt zur Uni fahren kann oder
nachmittags schnell ein Bad im kristallklaren
Zürisee nehmen kann. Auch an das
Schweizerdeutsche gewöhnt man sich nach 2
Monaten ziemlich gut und das selbst als
sprachferner Rheinländer, so wie ich. Nur um
die Sprache selbst sprechen zu können, muss
man doch eher Experte sein.
Auf der anderen Seite ist Zürich seit neuestem
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wieder die teuerste Stadt der Welt, im
ständigen Kampf mit Oslo. Man sollte sich
daran gewöhnen, für die Mensa über 5€ zu
zahlen und nur ganz selten im Restaurant
essen zu gehen. Die Mieten sind horrend,
sollte man nicht zu den Auserwählten der
WOKO, der studentischen
Wohngenossenschaft gehören. Mit genügend
Elan findet man dann aber doch etwas
halbwegs Bezahlbares. Falls man sich aber
anpassen möchte, dann bietet das Studium
wirklich eine tolle Möglichkeit, sich das für sich
persönlich beste Studium selbst
zusammenzustellen oder sich noch etwas Zeit
zu gönnen, die spätere Richtung festzulegen.
Die Bewerbung und Zulassung für die ETH ist
deutlich einfacher, als für andere Universitäten
im Ausland. Mit einer naturwissenschaftlich
orientierten Fächerkombination und einem
guten Zweierschnitt im Abi ist man eigentlich
schon dabei. Ausgewählt wird hier eher durch
die Basisprüfung. Ich hatte damals leider Pech,
meine eher ungewöhnliche
Leistungskurskombination Biologie und Physik
wurde nicht akzeptiert, weshalb ich die
reduzierte Aufnahmeprüfung ablegen musste.
Ich hoffe, dass ich dem einen oder anderen
helfen konnte. Für Fragen aller Art wendet
euch an mich, meine Mailadresse ist in der
Ehemaligendatenbank des FBO zu finden.
Christian Vahlensieck
6. Publikationsliste unserer Mitglieder
6.1. Quantitative interaction screen of telomeric repeat-containing RNA reveals novel
TERRA regulators.
Scheibe M, Arnoult N, Kappei Dennis, Buchholz Frank, Decottignies A, Butter Falk, Mann M.
Source
Department of Proteomics and Signal Transduction, Max Planck Institute of Biochemistry, 82152
Martinsried, Germany;
Abstract
Telomeres are actively transcribed into telomeric repeat-containing RNA (TERRA), which has been
implicated in the regulation of telomere length and heterochromatin formation. Here, we applied
quantitative mass spectrometry (MS)-based proteomics to obtain a high-confidence interactome of
TERRA. Using SILAC-labeled nuclear cell lysates in an RNA pull-down experiment and two different
salt conditions, we distinguished 115 proteins binding specifically to TERRA out of a large set of
background binders. While TERRA binders identified in two previous studies showed little overlap,
using quantitative mass spectrometry we obtained many candidates reported in these two studies. To
test whether novel candidates found here are involved in TERRA regulation, we performed an esiRNAbased
interference analysis for 15 of them. Knockdown of 10 genes encoding candidate proteins
significantly affected total cellular levels of TERRA, and RNAi of five candidates perturbed TERRA
recruitment to telomeres. Notably, depletion of SRRT/ARS2, involved in miRNA processing, upregulated
both total and telomere-bound TERRA. Conversely, knockdown of MORF4L2, a component
of the NuA4 histone acetyltransferase complex, reduced TERRA levels both globally and for telomerebound
TERRA. We thus identified new proteins involved in the homeostasis and telomeric abundance
of TERRA, extending our knowledge of TERRA regulation.
PMID: 23921659
[PubMed - as supplied by publisher]
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6.2. Five-year clinical follow-up of a randomized comparison of a polymer-free sirolimuseluting
stent versus a polymer-based paclitaxel-eluting stent in patients with diabetes
mellitus (LIPSIA Yukon trial).
Stiermaier T, Heinz A, Schloma D, Kleinertz K, Dänschel W, Erbs S, Linke Axel, Boudriot E, Lauer B,
Schuler G, Thiele H, Desch S.
Source
Department of Internal Medicine - Cardiology, University of Leipzig - Heart Center, Leipzig, Germany.
Abstract
OBJECTIVES:
The long-term performance of polymer-free stent systems in patients with diabetes mellitus has not
been investigated extensively. This study reports long-term results of the LIPSIA Yukon trial which
compared the polymer-free sirolimus-eluting Yukon Choice stent with the polymer-based paclitaxeleluting
Taxus Liberté stent in this subpopulation. At 9 months, the Yukon Choice stent failed to show
non-inferiority in terms of the primary end point late lumen loss, while no significant difference in
clinical outcome was detected.
METHODS AND RESULTS:
The LIPSIA Yukon trial randomized 240 patients with diabetes mellitus to a polymer-free sirolimus
eluting stent (Yukon Choice, Translumina) versus a polymer-based paclitaxel-eluting stent (Taxus
Liberté, Boston Scientific). Clinical follow-up was conducted with a standardized telephone follow-up
and all events were centrally adjudicated. Follow-up was available for 98.3% of patients after a
median of 5.0 years. The incidence of all-cause death (16.9% versus 14.0%, P = 0.67), respectively
definite or presumed cardiovascular death (7.6% versus 8.8%, P = 0.94) were similar in the Yukon
Choice and the Taxus Liberté group. There were no significant differences in the rates of myocardial
infarction (9.3% versus 7.9%, P = 0.88), definite stent thrombosis (0.8% versus 0.9%, P = 1.0),
target lesion revascularization (15.3% versus 15.8%, P = 1.0), target vessel revascularization (18.6%
versus 23.7%, P = 0.44), non-target vessel revascularization (18.6% versus 26.3%, P = 0.21), and
stroke (3.4% versus 4.4%, P = 0.96) between patients assigned to the Yukon Choice and the Taxus
Liberté stent.
CONCLUSION:
At 5 years of follow-up, clinical outcome was similar between the polymer-free sirolimus-eluting Yukon
Choice stent and the polymer-based paclitaxel-eluting Taxus Liberté stent. © 2013 Wiley Periodicals,
Inc.
Copyright © 2013 Wiley Periodicals, Inc.
KEYWORDS:
coronary artery disease, drug-eluting stent, paclitaxel, polymer-free, sirolimus
PMID:
23873579
[PubMed - as supplied by publisher]
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6.3. Selection-driven evolution of sex-biased genes is consistent with sexual selection in
Arabidopsis thaliana.
Gossmann Toni, Schmid MW, Grossniklaus U, Schmid KJ.
Source
Institute of Plant Breeding, Seed Science and Population Genetics, University of Hohenheim, Stuttgart,
Germany.
Abstract
Sex-biased genes are genes with a preferential or specific expression in one sex and tend to show an
accelerated rate of evolution in animals. Various hypotheses - which are not mutually exclusive - have
been put forth to explain observed patterns of rapid evolution. One possible explanation is positive
selection, but this has been shown only in few animal species and mostly for male-specific genes.
Here we present a large-scale study that investigates evolutionary patterns of sex-biased genes in the
predominantly self-fertilizing plant Arabidopsis thaliana. Unlike most animal species, A. thaliana does
not possess sex chromosomes, its flowers develop both male and female sexual organs and it is
characterized by low outcrossing rates. Using cell-specific gene expression data, we identified genes
whose expression is enriched in comparison to all other tissues in the male and female gametes
(sperm, egg, and central cell), as well as in synergids, pollen and pollen tubes, which also play an
important role in reproduction. Genes specifically expressed in gametes and synergids show higher
rates of protein evolution compared to the genome wide average and no evidence for positive
selection. In contrast, pollen and pollen tube-specific genes have lower rates of protein evolution, but
also exhibit a higher proportion of adaptive amino acid substitutions. We show that this is the result of
increased levels of purifying and positive selection among genes with pollen and pollen tube-specific
expression. The increased proportion of adaptive substitutions cannot be explained by the fact that
pollen and pollen tube-expressed genes are enriched in segmental duplications, are on average older,
or have a larger effective population size. Our observations are consistent with prezygotic sexual
selection as a result of interactions during pollination and pollen tube growth such as pollen tube
competition.
KEYWORDS:
adaptive evolution, angiosperms, pollen competition, reproduction
PMID:
24273323
[PubMed - as supplied by publisher]
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7. VBIO-Newsletter: Paarberatung für Getreide
Computertechnik und spezielles Saatgut soll Weizen-Ernte steigern
Hybridsorten verhelfen Mais, Roggen und
Zuckerrüben zur reicheren Ernte. Jetzt will sie
die Universität Hohenheim auch für Weizen
wirtschaftlich
machen
Traumpartner gesucht: Mit Biostatistik, Genund
Pflanzenstoff-Analysen untersuchen
Forscher der Universität Hohenheim
Weizenpflanzen auf deren Elternqualitäten. Ziel
ist es, ideale Elternpaare für neue Hybridsorten
schon vor der Kreuzung zu erkennen. Dies
wäre der Durchbruch für die Hybridzüchtung
bei Weizen, die noch zu teuer ist. Das
Bundesministerium für Bildung und Forschung
fördert das Projekt HYWHEAT mit 620.000
Euro. Damit gehört es zu den
Schwergewichten der Forschung an der
Universität
Hohenheim.
An der Universität Hohenheim war die
Landessaatzuchtanstalt schon bei der
Einführung der Hybridzüchtung bei Roggen
Geburtshelferin. Mit großem Erfolg:
Roggenhybriden sind deutlich leistungsstärker
und ertragsstabiler als Nicht-Hybriden.
Die bestechenden Vorteile der Hybriden will
Prof. Dr. Jochen Reif auch dem Weizen
angedeihen lassen. „Zum einen haben
Weizenhybriden im Schnitt zehn Prozent
höhere Erträge als Nicht-Hybridweizen. Zum
anderen sind Hybriden deutlich
unempfindlicher gegenüber Hitze, Dürre und
anderem Stress. Eine Eigenschaft, die wegen
des Klimawandels von entscheidender
Bedeutung
ist“.
Hybriden erzeugen ist beim Weizen sehr
aufwändig – das steigert die Kosten
Voraussetzung für Hybridweizen ist aber, dass
Züchter verschiedene Pflanzen gezielt
miteinander kreuzen können. Das Problem
beim Weizen: Bei ihm sind männliche und
weibliche Bestandteile in einer Blüte vereint.
Die Folge ist, dass jede Weizenblüte sich selbst
befruchtet. Wer kreuzen will, muss den
männlichen Blütenteil erst chemisch kastrieren.
Danach können sie den Pollen einer zweiten
Elternpflanze durch Windbestäubung
aufnehmen. Ein teures und aufwändiges
Verfahren.
Zucht gleicht einem Lotto-Spiel – die
Forschung will die Chancen erhöhen
„Die hohen Kosten sind der Grund, warum die
Hybridtechnik beim Weizen bis heute auf den
Durchbruch wartet“,
erklärt Prof. Dr. Reif.
Denn das Problem ist
die schiere Menge. „Wir
haben tausende von
Elternlinien. Das macht
Millionen
von
Kombinationsmöglichkei
ten. Von denen schafft
es nur ein Bruchteil zur
neuen Sorte – ein reines Lotteriespiel.“
Anders wäre es, wenn man die Lotterie auf
wenige Glückslose beschränken könnte. „Wenn
wir wüssten, bei welchen Paaren sich der
Aufwand lohnt, würden sich Hybriden auch
beim Weizen rechnen“, weiß der
Züchtungsforscher.
Den Weg dorthin will Prof. Dr. Reif nun ebnen
– mit Biostatistik, Gen-Profilen und
Inhaltsstoff-Analysen. „Wenn wir anhand von
Genen oder Inhaltsstoffen schon bei den Eltern
erkennen, welche die besten Nachkommen
hervorbringen, dann könnten wir der
Hybridzüchtung beim Weizen zum Durchbruch
verhelfen.“, fasst Prof. Dr. Reif zusammen.
Gen-Chip und Pflanzenstoff-Analyse ersetzen
Versuchsfelder
Die Revolution beginnt auf dem Versuchsfeld.
Dort baut die Landessaatzuchtanstalt über
1600 Hybriden und ihre Elternlinien an. Vier
international führende Weizenzüchtungsfirmen
unterstützen sie bei den Versuchen.
Die Hybriden lassen die Forscher unter
verschiedenen
Umweltbedingungen
aufwachsen. Danach prüfen sie von jeder
Sorte das Ertragspotential.
Von den Elternlinien erstellen die Forscher ein
individuelles Profil: Ein Gen-Chip bestimmt das
charakteristische Erbgut jeder Pflanze. Eine
Hochdurchsatz-Metabolit-Analyse misst die
individuellen
Inhaltsstoffe.
Diese Ergebnisse speisen die Forscher in ein
mathematisches Modell und untersuchen so
die Möglichkeit, exzellente Hybrideltern
vorherzusagen. Mit der Zeit soll die gezielte
Vorauswahl exzellenter Elternlinien der
Hybridzüchtung beim Weizen zum Durchbruch
verhelfen. Mit der entsprechenden
Ertragssteigerung: zehn Prozent plus auf
jedem Weizenfeld.
Universität Hohenheim
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