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F1- Praktikum Mikrobiologie Block N: Molekulare mikrobielle Ökologie

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8.1 Restriktionsverdau<br />

Ansatz:• H 2 O bidest.<br />

• Puffer<br />

• PCR-Produkt<br />

• Hae III<br />

7 μl<br />

2 μl<br />

10 μl<br />

1 μl (2 units)<br />

Das bei der RFLP verwendete Enzym Hae III schneidet DNA immer zwischen GG<br />

und CC. Den Ansatz zunächst 2 Stunden bei 37 o C inkubieren, dann die Reaktion mit<br />

5 μl Stop-Puffer beenden. Die Proben werden auf ein 3 %iges Agarosegel<br />

aufgetragen und bei 150 V laufen gelassen. Als Marker wird ein 100 bp DNA Ladder<br />

verwendet.<br />

8.2 RFLP-Gel-Auswertung<br />

Welche Klone würden sie in gleiche OTU’S (operational taxonomic units) einordnen?<br />

Welche Klone würden Sie zur Sequenzierung wählen?<br />

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