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Lehrstuhl für Mikrobiologie - Helmholtz Zentrum München

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MATERIAL UND METHODEN<br />

Primäre Denaturierung 94°C 1 min<br />

45 Zyklen<br />

Denaturierung 94°C 30 s<br />

Annealing 39°C 60 s<br />

Elongation 72°C 2 min<br />

Abschließende Elongation 72°C 10 min<br />

B.1.10.4.: Standardansatz und Reaktionsprogramm <strong>für</strong> die Durchführung der PCR<br />

B.1.10.4.1.: PCR in Glaskapillaren<br />

Für die spezifische Amplifizierung von DNS wurde in der vorliegenden Arbeit unter anderem<br />

die sogenannte Kapillar-PCR-Technik (Rapid Cycler Idaho Technologies, Idaho Falls, USA)<br />

eingesetzt. Alle Reagentien und Glaskapillaren außer Primer und DNS-Polymerasen wurden<br />

von der Betreiberfirma bezogen.<br />

Standardansatz <strong>für</strong> eine Reaktion:<br />

10 x BSA 5,0 µl<br />

10 x MgCl2 (20 mM) 5,0 µl<br />

10 x Nukleotidmix (200µmol „each“) 5,0 µl<br />

15 pmol PV<br />

1,0 µl<br />

15 pmol PR<br />

1,0 µl<br />

ad H2Oreinst<br />

33<br />

50 µl<br />

Polymerase 0,3 µl<br />

DNS 100 ng<br />

Der Reaktionsansatz wurde auf Eis in ein 1,5 ml ERG pipettiert und anschließend in eine 50<br />

µl Glaskapillare überführt. Nach thermischer Versiegelung der Enden wurde die Kapillare in<br />

die Halterung des Thermocyclers eingesetzt. Nach Beendigung der Reaktion wurden die<br />

Glaskapillaren mit einem Glasschneider geöffnet und der Inhalt in ein 1, 5 ml ERG überführt.<br />

Ein Aliquot von 5 µl wurde daraufhin durch horizontale Gelelektrophorese überprüft.

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