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Compressive Sensing system for recording of ECoG signals in-vivo

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RiassuntoIl progetto “<strong>Compressive</strong> <strong>Sens<strong>in</strong>g</strong> <strong>system</strong> <strong>for</strong> <strong>record<strong>in</strong>g</strong> <strong>of</strong> <strong>ECoG</strong> <strong>signals</strong> <strong>in</strong>-<strong>vivo</strong>” è statorealizzato attraverso una stimolante collaborazione tra il Microelectronic System Laboratory (LSM)dell'École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL, Svizzera) e il centro di ricerca sulla micro enanotecnologia, IMEC, (Leuven, Belgio). In questo modo, il contesto della tesi è stato sia,accademico che <strong>in</strong>dustriale. Per quanto riguarda l'ultima classifica dell'Università di Leiden alla f<strong>in</strong>edel 2011, l’EPFL arriva al numero dodici della classifica mondiale e <strong>in</strong> cima alla tabella come la primaistituzione non americana. EPFL e ETHZ, al 12° e 18° posto, rispettivamente, sono le due primeistituzione non americane. Per quel che riguarda IMEC, si tratta di un campus di ricerca con sede aLovanio, ma ha sedi distaccate nei Paesi Bassi, C<strong>in</strong>a, Taiwan e India, e uffici <strong>in</strong> Giappone e negliStati Uniti <strong>in</strong> Belgio. Si estende su 24.400 m² di spazio per uffici, laboratori, strutture di <strong>for</strong>mazione esale di supporto tecnico, tra cui ci sono due cleanroom di 300 nm e 200mm.Durante il periodo trascorso preso l’EPFL, la motivazione del presente progetto è stata, prima ditutto, uno studio appr<strong>of</strong>ondito dello stato dell’arte della nuova metodologia di compressione deisegnali chiamato <strong>Compressive</strong> <strong>Sens<strong>in</strong>g</strong>. In questa fase, sono state studiate le base matematiche perrealizzare la compressione, l’applicabilità del metodo e una vasta gamma di algoritmi per lasoluzione del recupero dei segnali. In questo modo, sono stati svilupatti dei modelli <strong>in</strong> Matlab eSimul<strong>in</strong>k per applicare una compressione efficace e una ricostruzione affidabile.<strong>Compressive</strong> <strong>Sens<strong>in</strong>g</strong> è diventata una tecnica di compressione rivoluzionaria per i segnali biologiciclassificati come sparsi, densa fonte di <strong>in</strong><strong>for</strong>mazioni <strong>in</strong> biosistemi di multielettrodi. Per tanto, <strong>in</strong> questoprogetto è stato studiato come applicare la nuova tecnica <strong>Compressive</strong> <strong>Sens<strong>in</strong>g</strong> <strong>in</strong> un sistemamulticanale on-chip orientato all’acquisizione di Electrocorticografia (<strong>ECoG</strong>) e Potenziali di Azione(AP). I segnali neurali ECOG e AP hanno dimostrato di adattarsi ai requisiti del <strong>Compressive</strong><strong>Sens<strong>in</strong>g</strong>.Come conclusione del periodo di LSM, la pubblicazione “Circuit-Level Implementation <strong>of</strong>Compressed <strong>Sens<strong>in</strong>g</strong> <strong>for</strong> Multi-Channel Neural Record<strong>in</strong>g” è stata presentata come il primoriferimento dello Spatial <strong>Compressive</strong> <strong>Sens<strong>in</strong>g</strong> (SCS), un nuovo metodo per la compressione deisegnali che sono distribuiti su un array di multielettrodi e sono sparsi nel dom<strong>in</strong>io spaziale. Lapossibilita di comprimere e ricostruire questi segnali è stata dimostrata mediante implementazioni <strong>in</strong>Matlab e Cadence. Nella stessa pubblicazione, un nuovo e più compatto generatore causaleparallelo basato <strong>in</strong> PRBS seriale è stato presentato.Durante il periodo <strong>in</strong> IMEC, un più pr<strong>of</strong>ondo studio della <strong>in</strong>tegrazione dei circuiti perl’implemenntazione de un sistema basato <strong>in</strong> <strong>Compressive</strong> <strong>Sens<strong>in</strong>g</strong> per l’applicazione <strong>in</strong> segnal<strong>in</strong>eurali è stato realizzato. Più <strong>in</strong> dettaglio, una nueva implementazione dei blocchi necessari pereffettuare il mix<strong>in</strong>g e l'<strong>in</strong>tegrazione dei segnali <strong>in</strong> <strong>in</strong>gresso è stato proposto secondo un approccioanalogico per la topologia di multipath.13

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