Thése finale - Université Mentouri de Constantine

More documents

Recommendations

Info

Partie expérimentale 1. Cadre de l’étude 2. Lieu ou centre de l’étude : présentation de l’hôpital de Constantine et du laboratoire de bactériologie de l’université Louis Pasteur de Strasbourg. 3. Matériel 3.1. Souches de K.pneumoniae : Recueil des souches, hospitalières et communautaires. 3.1.1. taille de l’échantillon 3.1.2. Prélèvements pathologiques 4. Méthodes d’étude 4.1. Identification bactérienne (Etude systématique) Galerie Api 20E 4.2. Etude de la sensibilité de la souche aux antibiotiques (Antibiogramme) 4.2.1. Phénotypes de résistance aux β-lactamines 4.2.1.1. Pénicillinases de bas niveau 4.2.1.2. Pénicillinases de haut niveau 4.2.1.3. Phénotype TRI (TEM résistant aux inhibiteurs) 4.2.1.4. β-lactamase à spectre étendu (BLSE) 4.2.2. Recherche de la β-lactamase à spectre élargi 4.2.2.1. Test de synergie 4.2.2.2. Tests complémentaires - Test du double disque (test espagnol) - Test du rapprochement des disques - Test à la cloxacilline 4.2.3. Détermination du phénotype de résistance des BLSE 4.2.4. Les phénotypes rares 4.2.5. Phénotypes de résistance aux aminosides 4.2.6. Phénotypes de résistance aux quinolones. 4.3. Technique de la biologie moléculaire: 4.3.1. Electrophorèse en champs pulsé. 4.3.2. Caractérisation génétique des BLSE. 4.4. Analyse factorielle discriminante (AFD). Résultats 1. Souches bactériennes isolées. 1.1. Répartition des souches selon l’origine du prélèvement. 1.2. Distribution des souches parmi les prélèvements cliniques 1.3. Fréquence d’isolement de Klebsiella pneumoniae au CHU de Constantine parmi les prélèvements effectués en 2004 1.4. Répartition des souches de K.pneumoniae en fonction des prélèvements positifs 1.5. Répartition des souches selon l’origine et le service d'hospitalisation 1.6. Distribution selon le sexe. 2. Etude analytique en API 20 E : 2.1. Fréquence des profils numériques en API 20E (par ordre numérique) 2.2. Traduction des profils numériques de Klebsiella pneumoniae, en Caractères biochimiques 2.3. Relation profils numériques en API 20E et site d’infection 2.4. Répartition des profils par service d’hospitalisation 7
3. Etude de la sensibilité aux antibiotiques de Klebsiella pneumoniae 3.1. Profil de sensibilité globale de Klebsiella pneumoniae aux antibiotiques. 3.2. Variations chez les malades externes 3.3. Variations interservices du profil de sensibilité de K. pneumoniae aux antibiotiques 3.3.1. Variations dans les services de soins intensifs 3.3.2. Variation dans les services de chirurgie. 3.3.3. Variations dans les services de médecine. 3.3.4. Variation dans les services de pédiatrie 3.4. Distribution des résistances par service (Etude comparative) 3.5. Taux de résistance de K.p par année. 3.6. Distribution des principaux phénotypes de résistance aux antibiotiques en fonction du prélèvement. 3.7. Distribution des principaux phénotypes de résistance aux β-lactamines 3.7.1. Répartition des 105 souches de K.p productrices de BLSE en fonction des services 3.7.2. Antibiotypes de K.pneumoniae productrice de BLSE, isolée au CHU de Constantine durant la période 2002-2004. 3.7.3. CMI moyennes K. pneumoniae selon le phénotype. 3.8. Distribution des principaux phénotypes de résistance aux aminosides. 3.9. Distribution des principaux phénotypes de résistance aux quinolones. 4. Résultats de la biologie moléculaire 4.1. Electrophorèse en champ pulsé 4.2. Caractérisation génétique des BLSE. 5. Analyse statistique 6. Résultats du génotype, du biotype et de l’antibiotype Discussion 1. Fréquence d'isolement de K.p 2. Fréquence d'isolement de K.p en function du sexe 3. Distribution des profils en API 20 E 3.1. API 20 E et site d’infection. 3.2. API 20 E et service d’hospitalisation. 4. Résistance et mécanismes de résistance aux antibiotiques de K.pneumoniae. 4.1. Résistance de K.pneumoniae aux β-lactamines. 4.2. Mécanismes de résistance aux β-lactamines. 4.2.1. K.pneumoniae BLSE+ prévalence et répartition. 4.3. Résistance de K. pneumoniae aux aminosides. 4.4. Mécanisme de résistance de K. pneumoniae aux aminosides. 4.5. Résistance aux quinolones 4.6. Mécanisme de résistance aux quinolones 4.7. Variation interservices de la résistance 4.8. Variation de la résistance en fonction du prélèvement 5. Electrophorèse en champ pulsé Conclusion et perspectives Références bibliographiques Résumés 8
Page 1 and 2: République Algérienne Démocratiq
Page 3 and 4: Remerciments Une thèse est le rés
Page 5 and 6: éalisation de cette thèse. Tu res
Page 7: Principales familles des antibiotiq
Page 11 and 12: USI: Unités de soins intensifs VP:
Page 13 and 14: Figure 27 : Profil de sensibilité
Page 15: Tableau 25: Répartition des profil
Page 18 and 19: Ce pathogène opportuniste est isol
Page 20 and 21: Le genre Klebsiella rassemble des b
Page 22 and 23: Les principaux caractères différe
Page 24 and 25: 5/Transmission et pouvoir pathogèn
Page 26 and 27: La grande majorité des souches syn
Page 28 and 29: phylogénétiquement différente de
Page 30 and 31: Figure 1 : Nouvelles BLSE 29
Page 32 and 33: Le tableau 3: classification struct
Page 34 and 35: Il est basé essentiellement sur l
Page 36 and 37: étudiée, les différents variants
Page 38 and 39: - Identifier les isolats dont le pu
Page 40 and 41: Principales familles des antibiotiq
Page 42 and 43: - Chloramphénicol : Simple marqueu
Page 44 and 45: Résistance aux antibiotiques 1. G
Page 46 and 47: pénicilline M, macrolides, rifampi
Page 48 and 49: Les premiers plasmides de résistan
Page 50 and 51: Figure 4: Mobilisation d'un transpo
Page 52 and 53: 7.1. Diminution de la perméabilit
Page 54 and 55: Dans le cas de Streptococcus pneumo
Page 56 and 57: 8.3.1 Les β-lactamases : Depuis le
Page 58 and 59:
En l'absence d'image de synergie, l
Page 60 and 61:
Tableau 5: Phénotypes de résistan
Page 62 and 63:
Tableau 6: Phénotypes de résistan
Page 64 and 65:
même niche écologique et suscepti
Page 67 and 68:
Partie Expérimentale Matériel et
Page 69 and 70:
100.00% 90.00% 80.00% 70.00% 60.00%
Page 71 and 72:
4.2. Etude de la sensibilité des s
Page 74 and 75:
4.2.2. Lecture et interprétation:
Page 76 and 77:
La lecture du test de synergie s’
Page 78 and 79:
- Test à la cloxacilline Principe:
Page 80 and 81:
4.3.7. Phénotypes de résistance a
Page 82 and 83:
16 heures avec une température mai
Page 84:
4.4.2. Typage des BLSE: Les CMI ont
Page 87 and 88:
Souches communautaires 7,05% Souche
Page 89 and 90:
Tableau 11 : Répartition des souch
Page 91 and 92:
1.6.1. Sexe ratio par service Figur
Page 93 and 94:
80.00% 70.00% 60.00% 50.00% 40.00%
Page 95 and 96:
2.2. Traduction des profils numéri
Page 97 and 98:
2.4. Répartition des profils numé
Page 99 and 100:
Tableau 24 : Chirurgie Profil API 2
Page 101 and 102:
Tableau 26: Néonatologie Profil Ef
Page 103 and 104:
Tableau 27: Profil de sensibilité
Page 105 and 106:
100.00% 90.00% 80.00% 70.00% 60.00%
Page 107 and 108:
3.4. Variations inter services du p
Page 109 and 110:
Tableau 31 : Fréquence du profil d
Page 111 and 112:
100.00% 90.00% 80.00% 70.00% 60.00%
Page 113 and 114:
3.5. Distribution des résistances
Page 115 and 116:
2002 et 2004 est statistiquement no
Page 117 and 118:
Tableau 36 : Répartition des rési
Page 119 and 120:
3.7.1.1. Principaux phénotypes de
Page 121 and 122:
Tableau 39: Répartition des K.p BL
Page 123 and 124:
de 10%. En revanche c'est le phéno
Page 125 and 126:
4. Résultats de la biologie moléc
Page 127 and 128:
Figure 41: Dendrogramme représenta
Page 129 and 130:
clone nous signale encore une fois
Page 131 and 132:
------------- POINTS CACHES Points
Page 133 and 134:
différents, où le premier compren
Page 135 and 136:
136
Page 137 and 138:
3. Distribution des profils en API
Page 139 and 140:
BLSE (Medeïros, 2000; Midolo et al
Page 141 and 142:
souches de K.p seulement 1.23% éta
Page 143 and 144:
Dans une étude prospective de 455
Page 145 and 146:
les Entérobactéries en Pologne. P
Page 147 and 148:
ofloxacine), nos isolats restent de
Page 149 and 150:
diminution d'accumulation intracell
Page 151 and 152:
• La fréquence de la résistance
Page 153 and 154:
discrimination de ces souches, ains
Page 155 and 156:
Conclusion Les résultats de cette
Page 157 and 158:
L'ECP reste de loin le marqueur ép
Page 159 and 160:
Perspectives Cette étude nous a pe
Page 161 and 162:
Références bibliographiques 1. Ab
Page 163 and 164:
27. Bonnet R, Recule C, Baraduc R,
Page 165 and 166:
51. Coudron P, Hanson N.D, Climo M.
Page 167 and 168:
73. Foissaud V, Penier-Gros-Claude
Page 169 and 170:
Escherichia coli and Klebsiella pne
Page 171 and 172:
119. Labadene H, Messai Y, Ammari H
Page 173 and 174:
142.Melano R, Corso A, Petrani A, C
Page 175 and 176:
165.Pasteran F.G, Guerrierro L.L.O,
Page 177 and 178:
187.Quentin C, Arpin C, Dubois V, A
Page 179 and 180:
209.Sirot J, Nicolas-Chanoine M.H,
Page 181 and 182:
plasmide-mediated quinolone Resista
Page 183 and 184:
Abstract Klebsiella pneumoniae is a
Page 185 and 186:
Résumé Klebsiella pneumoniae est
show all

Thése finale - Université Mentouri de Constantine

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?