Afd. for Prydplanter og Vegetabilske Fødevarer - DCA - Nationalt ...
Afd. for Prydplanter og Vegetabilske Fødevarer - DCA - Nationalt ...
Afd. for Prydplanter og Vegetabilske Fødevarer - DCA - Nationalt ...
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Genomcentret<br />
I 2001 indviedes Genomcentret ved<br />
<strong>Afd</strong>eling <strong>for</strong> Husdyravl <strong>og</strong> Genetik<br />
med 550 m 2 nye laboratoriefaciliteter.<br />
Moderne rammer<br />
omkring ny teknol<strong>og</strong>i<br />
Centeret skal skabe rammerne <strong>for</strong> anvendelsen<br />
af en række nye teknol<strong>og</strong>ier, herunder<br />
specielt genekspressionanalyse,<br />
proteomanalyse samt storskala analyser<br />
af den genetiske variation. For at sikre<br />
optimale betingelser <strong>for</strong> nye krævende<br />
teknol<strong>og</strong>ier som microarray-/biochipanalyser<br />
<strong>og</strong> massespektrometri er der ved<br />
Genomcenteret bygget specielle renrumslaboratorier,<br />
hvori temperatur <strong>og</strong> luftfugtighed<br />
kan styres præcist. Derudover råder<br />
centeret over flere sterillaboratorier,<br />
køle-fryserum samt speciallaboratorier<br />
til PCR-analyser, sekventering, SNPanalyser<br />
<strong>og</strong> ekspressionsanalyser.<br />
Bioin<strong>for</strong>matik er en central<br />
del af centerets aktiviteter<br />
I <strong>for</strong>bindelse med centeret er der etableret<br />
en meget stærk bioin<strong>for</strong>matik aktivitet<br />
der skal gøre det muligt at udnytte den<br />
store mængde biol<strong>og</strong>iske in<strong>for</strong>mation<br />
der skabes med de nye teknol<strong>og</strong>ier. Der er<br />
bl.a. opbygget en Linux-cluster til genom<strong>og</strong><br />
ekspressionsanalyser samt en supercomputer<br />
til DNA- <strong>og</strong> proteinsekvenssammenligninger.<br />
Svinets gener<br />
skal kortlægges<br />
Centret rummer allerede et nyt stort<br />
<strong>for</strong>skningssamarbejde mellem Danmark<br />
<strong>og</strong> Kina, der skal sekventere<br />
svinets genom, som er betegnelsen <strong>for</strong><br />
arvemassen. I øjeblikket har man bl.a.<br />
sekventeret genomet hos mennesker, rotter<br />
<strong>og</strong> mus. De danske projektdeltagere<br />
er DJF, KVL, De Danske Slagterier <strong>og</strong><br />
Landsudvalget <strong>for</strong> Svin <strong>og</strong> fra kinesisk<br />
side deltager Beijing Genomics Institute<br />
<strong>og</strong> Chinese Academy of Sciences.<br />
På nuværende tidspunkt har vi i projektet<br />
sekventeret ca. 1/2 million cDNA<br />
sekvenser samt 2,5 mio. genomiske sekvenser<br />
<strong>og</strong> vi har således allerede nu tilgang<br />
til in<strong>for</strong>mation omkring en meget<br />
stor del af de gener der findes hos svin.<br />
Der er tale om meget værdifuld<br />
ny viden, som vil være af særdeles<br />
<strong>Afd</strong>. <strong>for</strong> Husdyravl <strong>og</strong> Genetik<br />
Kalve med den arvelige sygdom CVM aborteres meget ofte tidligt i graviditeten.<br />
De kalve der fødes har de<strong>for</strong>me ryghvirveler <strong>og</strong> lemmer samt<br />
en hjertedefekt <strong>og</strong> dør umiddelbart efter fødselen. Efter udviklingen af<br />
gentesten fødes der ikke længere CVM kalve I Danmark.<br />
Ved genomcenteret bliver der bl.a. lavet samlinger af husdyrenes gener i<br />
<strong>for</strong>m af cDNA biblioteker. For svin er der således etableret <strong>og</strong> karakteriseret<br />
en samling på mere end. 1 million enkelt kloner der hver især indeholder<br />
et stykke svinegen.<br />
stor betydning <strong>for</strong> den fremtidige udvikling<br />
inden <strong>for</strong> svinets avl <strong>og</strong> genetik, <strong>og</strong><br />
som vil placere de to lande meget gunstigt<br />
inden <strong>for</strong> avanceret svineavl. Målet<br />
er at fremme både produktkvalitet <strong>og</strong><br />
produktionsegenskaber hos svinene<br />
igennem avlspr<strong>og</strong>rammer, der drager<br />
<strong>for</strong>del af kendskab til den genetiske<br />
variation på DNA-niveau.<br />
Udvikling af en genetisk test<br />
<strong>for</strong> en udbredt arvelig defekt<br />
hos malkekøer<br />
Genomcentret har <strong>og</strong>så været omdrejningspunktet<br />
<strong>for</strong> udviklingen af en test<br />
<strong>for</strong> en arvelig sygdom (CVM) blandt malkekøer.<br />
Sygdommen blev først beskrevet<br />
i oktober 2000, efter at et stort antal kalve<br />
med ensartede symptomer var registreret<br />
gennem sundhedspr<strong>og</strong>rammet til undersøgelse,<br />
registrering <strong>og</strong> begrænsning af<br />
arvelige sygdomme. Sygdommen kan<br />
føres tilbage til den amerikanske elitetyr<br />
Carlin-M Ivanhoe Bell, der tidligere er anvendt<br />
i stort omfang <strong>og</strong> således har spredt<br />
sygdomsgenet til millioner af dyr over<br />
hele verden.<br />
CVM-genet blev identificeret i<br />
genomcenteret ved DJF i et bredt samarbejde<br />
med dansk kvægavl <strong>og</strong> KVL, <strong>og</strong><br />
det er således nu muligt at teste alle dyr<br />
<strong>for</strong> tilstedeværelsen af den sygdomsgivende<br />
mutation. Den nye gentest er patenteret<br />
<strong>og</strong> der er allerede i 2001 indgået<br />
licensaftale med laboratorier i 5 lande.<br />
Testen ventes udbredt i hele verden i<br />
løbet af kort tid.<br />
artikel af: Christian Bendixen<br />
21