28.07.2013 Views

Kemisk Fagprojekt Hemoglobin og Myoglobin Studier af det Aktive Site

Kemisk Fagprojekt Hemoglobin og Myoglobin Studier af det Aktive Site

Kemisk Fagprojekt Hemoglobin og Myoglobin Studier af det Aktive Site

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

4.2 Single- <strong>og</strong> multiplescattering 4 XAFS[15]<br />

om de omkringliggende naboatomer - <strong>af</strong>stande <strong>og</strong> antal. Beskrivelsen gøres<br />

ud fra EXAFS-funktionen χ(E), som defineres ved følgende funktion:<br />

χ(E) =<br />

µ(E) − µ0(E)<br />

∆µ0(E)<br />

(4.2)<br />

µ0(E) betegner absorptionskoefficienten for et isoleret centralatom, <strong>og</strong> ∆µ0(E)<br />

betegner forskellen i absorptionskoefficienten omkring den kritiske værdi E0.<br />

Tælleren s˚a at sige ”fjerner”funktionen lige før <strong>og</strong> ved den kritiske energi,<br />

<strong>og</strong> nævneren normaliserer funktionen, s˚aledes at EXAFS- omr˚a<strong>det</strong> træder<br />

tydeligt frem.<br />

EXAFS beskrives traditionelt vha. bølgeegenskaberne <strong>af</strong> fluorescenslyset, s˚a<br />

derfor konverteres energien <strong>af</strong> røntgenstr˚alingen til str˚alingens bølgetal, se<br />

ligning (4.3) (Denne er udledt i appendix A).<br />

<br />

2me(E − E0)<br />

k =<br />

(4.3)<br />

hvor me betegner en elektrons masse, <strong>og</strong> E0 betegner den kritiske energi. k<br />

har enheden ˚A −1 <strong>og</strong> leder til EXAFS ligningen, se ligning (4.4)<br />

χ(k) = <br />

Hvor parametrene er følgende:<br />

j<br />

ℏ 2<br />

Njfj(k)e −2k2 σ 2 j<br />

kR 2 j<br />

sin[2kRj + δ(k)] (4.4)<br />

• Nj: Antallet <strong>af</strong> naboatomer <strong>af</strong> type j til <strong>det</strong> exciterede atom<br />

• R: Afstand til <strong>det</strong> enkelte naboatom<br />

• σ 2 : Varians i <strong>af</strong>standene givet ved R.<br />

• f(k) <strong>og</strong> δ(k): Naboatomernes spredningsfaktorer.<br />

f(k) <strong>og</strong> δ(k) <strong>af</strong>hænger <strong>af</strong> naboatomernes atomnummer, s˚a kendes disse kan<br />

naboatomernes art bestemmes.<br />

4.2 Single- <strong>og</strong> multiplescattering<br />

I takt med at kvaliteten <strong>af</strong> XAFS m˚alinger er steget de seneste ˚ar, er multiple<br />

scattering blevet mere anvendeligt <strong>og</strong> præcist.<br />

Ved single scattering forst˚as, at der under modelleringen kun inddrages de<br />

vejlængder, hvor flourouscenslyset udelukkende rejser mellem centralatomet<br />

14

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!