Kemisk Fagprojekt Hemoglobin og Myoglobin Studier af det Aktive Site

More documents

Recommendations

Info

$LaTeX â Custom Templates$

$LATEX 2Îµ Cheat Sheet$

$Introduktion til LaTeX$

$Exercises for LaTeX introduction course spring 2008$

Resumé Denne rapport omhandler undersøgelse af metalloproteiner ved metoden EXAFS. Der er gjort rede for de forskellige niveauer af proteiner, mekanismer og klassificeringer af metalloproteiner herunder hæmproteinerne hæmoglobin og myoglobin. Endvidere er den basale teori, m˚aleteknik og databehandling omhandlende EXAFS-metoden beskrevet. Databehandlingen er illustreret ved tolkningen af eksperimentelle data omhandlende metalproteinet cytochrome c. M˚aledata ligger i omr˚adet 2,5-12,5 ˚A −1 og er opsamlet ved stuetemperatur. Ved brug af single-scattering er bindingslængderne Fe-N (porphyrinring samt Nitrogen i imidazol fra histidin) bestemt til 1,98(8)˚A og Fe-S bestemt til 2,30(0) ˚A. Disse er sammenlignet med andre studier, b˚ade EXAFS og røntgenkrystallografiske, og det er fundet bindingslængderne stemmer godt overens. Der gives udtryk for, at EXAFSdatabehandlingen stadig bygger p˚a subjektive skøn, idet splinen tilnærmes, og grænser for afskæring af data vælges. Endeligt er muligheden for forfining af bindingslængder og residualværdier under databehandlingen afhængig af hvilket computerprogram, der benyttes. i
Forord ”EXAFS undersøgelse af hæmproteiner”, Udarbejdet af David Westergaard (s093629) og Torben Schwarts (s092946), vejledt af Pernille Harris og Christian Grundahl Frankær. Arbejdet har været fordelt s˚aledes at David er ansvarlig for afsnit 2+3, og Torben for 4+5, i resten af afsnittene har arbejdet været ligeligt fordelt Rapporten er forsøgt opbygget for at opn˚a den bedst mulige forst˚aelse hos læseren. I kapitel 1 vil det basale omkring proteiner blive gennemg˚aet. Næste kapitel vil omhandle hæmproteiner, herunder hæmoglobin og myoglobin. Dernæst vil der være en kort gennemgang af XAFS, og til slut vil der foreg˚a en databehandling samt sammenligning med eksperimenter fra litteraturen. Det forventes at læseren er bekendt med simple kemiske strukturer og fysiske fænomener. Vi vil gerne sige stor tak til vores vejledere, Pernille Harris og Christian Grundahl Frankær, for kompetent vejledning, samt l˚an af data. Derudover en tak til MAX-lab, Lunds Universitet, Sverige, for at give os muligheden for at se deres synchroton. Rapporten er skrevet i L ATEX, med Knuth’s Computer Modern font, i dokumentklassen article. ii
Page 1: 26010 - Kemisk Fagprojekt EXAFS und
Page 5 and 6: Forkortelser EXAFS Extended X-ray A
Page 7 and 8: 2 Generelt om proteiner 2 GENERELT
Page 9 and 10: 2.1 Struktur 2 GENERELT OM PROTEINE
Page 11 and 12: (a) Jern(II)-svovlklynge i Aconitas
Page 13 and 14: 3.2 Proteinstruktur af hæmoglobin
Page 15 and 16: 3.4 Bohreffekten [1] 3 HÆMPROTEINE
Page 17 and 18: 4 XAFS[15] 4 XAFS[15] Til undersøg
Page 19 and 20: 4.2 Single- og multiplescattering 4
Page 21 and 22: 4.3 XAFS m˚alinger 4 XAFS[15] Figu
Page 23 and 24: 5 Databehandling 5 DATABEHANDLING I
Page 25 and 26: (a) (b) 5 DATABEHANDLING Figur 14:
Page 27 and 28: Figur 18: Trin 6, χ(k) vægtet med
Page 29 and 30: 6 RESULTATER atomer i porphyrinring
Page 31 and 32: 7 Diskussion 7.1 Bindingslængder i
Page 33 and 34: 7.3 Modellering af data 8 KONKLUSIO
Page 35 and 36: LITTERATUR LITTERATUR [10] M. F. Pe
Page 37 and 38: A Bølgetal A BØLGETAL k = 2π 2π

Kemisk Fagprojekt Hemoglobin og Myoglobin Studier af det Aktive Site

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?