Kemisk Fagprojekt Hemoglobin og Myoglobin Studier af det Aktive Site

2 Generelt om proteiner
2 GENERELT OM PROTEINER
[1] Proteiner er en vigtig bestandel i enhver organisme. Disse makromolekyler
fungerer som katalysatorer (enzymer), membranmolekyler (Den aktive transport
af det polære molekyle glucose indover den upolære cellemembran,
Na + /K + -pumpen, elektrontransport, aquaporiner, cellegenkendelse), transport
rundt i kroppen af ellers hydrophope molekyler (O 2 bundet til hemoglobin).
Førnævnte processer er blot et lille udsnit af de mange funktioner proteiner
varetager i biologiske organismer.
Proteiner dannes ved hydrolyse af aminosyrer, og holdes sammen af de s˚akaldte
peptidbindinger, se figur 1.
Figur 1: Peptidsyntese af 2 aminosyrer. Carboxylenden bindes til aminoenden
ved fraspaltning af vand under forbrug af energi
Ialt findes 20 essentielle aminosyrer, som hver især har forskellige egenskaber,
afhængig af sidegrupperne, som tit inddeles efter polaritet og ladning under
fysiologiske forhold (pH ≈ 7,4), se tabel 1. En komplet oversigt er givet i
appendix B
Tabel 1: De 20 essentielle aminosyrer. Ved ladning og bindingsmuligheder forst˚as
udelukkende dem p˚a sidegruppen
Polaritet Aminosyrer Bindingsmuligheder
Neutralt Hydrofob Ala, Val, Leu, Ile, Por, Phe, Trp, Met van der Waals
Neutral Hydrofil Gly, Ser, Thr, Cys, Tyr, Asn, Gln Hydrogenbindinger
Ladet hydrofil Asp – , Glu – , Lys + , Arg + , His +
Hydrogenbindinger
Alle proteiner udgøres af en kombination af disse. Selve syntesen sker i kroppen
ved en translation af RNA, proteinsyntesen, denne vil vi dog ikke beskrive
nærmere her.
Vi vil i dette afsnit beskrive den generelle opbygning af naturlige proteiner.
Hvad der forst˚aes ved den primære, sekundære, tertiere og kvarternære
struktur, samt de indbyrdes intermolekylære kræfter vil kort blive beskrevet,
derudover vil vi kort klassificere hvad et metalloprotein er.
2