11.09.2013 Views

Mekanismer for brun- og hvidmuld svampes nedbrydning af tr - Nature

Mekanismer for brun- og hvidmuld svampes nedbrydning af tr - Nature

Mekanismer for brun- og hvidmuld svampes nedbrydning af tr - Nature

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

ne d b r y d n i n g s M e k a n i s M e r n e<br />

Nedbrydningssystemerne som svampene benytter består <s<strong>tr</strong>ong>af</s<strong>tr</strong>ong> enzymer <s<strong>tr</strong>ong>og</s<strong>tr</strong>ong> me-<br />

diatorer. De enzymer som vides indgå heri er Lignin peroxidaser (Lip), Mangan<br />

peroxidaser (MnP), Versatile peroxidaser (VP), glyoxal oxidaser, superoxid dis-<br />

mutaser, aryl alcohol oxidaser, Laccaser, type B carboxyl esteraser (lipaser),<br />

Peptidaser <s<strong>tr</strong>ong>og</s<strong>tr</strong>ong> Cellulaser.<br />

CeLLuLose n e d b r y d n i n g<br />

Basidiomyceter kan nedbryde cellulose ved hjælp <s<strong>tr</strong>ong>af</s<strong>tr</strong>ong> 3 hydrolytiske enzymer,<br />

end<s<strong>tr</strong>ong>og</s<strong>tr</strong>ong>lucanase, cellobiohydrolase <s<strong>tr</strong>ong>og</s<strong>tr</strong>ong> β-glucosidase.<br />

Nedbrydning <s<strong>tr</strong>ong>af</s<strong>tr</strong>ong> cellulose <s<strong>tr</strong>ong>for</s<strong>tr</strong>ong>egår generelt ved at end<s<strong>tr</strong>ong>og</s<strong>tr</strong>ong>luconaser hydrolyserer<br />

glucosid bindinger et sted midt i polymeren, hvorved denne splittes op i mindre<br />

dele. Herefter kan type I <s<strong>tr</strong>ong>og</s<strong>tr</strong>ong> II cellobiohydrolaser fra hver deres ende <s<strong>tr</strong>ong>af</s<strong>tr</strong>ong> de min-<br />

dre poly- eller oligosaccarider, hydrolysere videre til di- eller te<strong>tr</strong>asaccarider,<br />

som β-glucosidaser kan hydrolysere til monosaccarid, glucose.<br />

Cellulolytiske enzymer er grupperet i mindst 15 ud <s<strong>tr</strong>ong>af</s<strong>tr</strong>ong> 80 kendte s<strong>tr</strong>ukturelle<br />

familier <s<strong>tr</strong>ong>af</s<strong>tr</strong>ong> glycosyl hydrolaser (tabel 4). Ud over ægte cellulaser, er 2 familier<br />

<s<strong>tr</strong>ong>af</s<strong>tr</strong>ong> <s<strong>tr</strong>ong>for</s<strong>tr</strong>ong>skelligartede xylanaser (10/F <s<strong>tr</strong>ong>og</s<strong>tr</strong>ong> 11/G) inkluderet, muligvis <s<strong>tr</strong>ong>for</s<strong>tr</strong>ong>di de ud-<br />

viser en bred specificitet <s<strong>tr</strong>ong>for</s<strong>tr</strong>ong> subs<strong>tr</strong>at. Andre enzymer i familie 11/G er medtaget<br />

selvom de er s<strong>tr</strong>engt specifikke <s<strong>tr</strong>ong>for</s<strong>tr</strong>ong> xylan. Der er <s<strong>tr</strong>ong>og</s<strong>tr</strong>ong>så eksempler på enzymer,<br />

f.eks. β-glucosyl hydrolaser som er i stand til at hydrolysere korte cellulooligo-<br />

saccarider (familie 1 <s<strong>tr</strong>ong>og</s<strong>tr</strong>ong> 3), som ikke er familiegrupperet sammen med cel-<br />

lulolytiske enzymer. Ligeledes anses familie 16 <s<strong>tr</strong>ong>og</s<strong>tr</strong>ong> 17, som inkluderer 1,3(4)-<br />

β-glucanaser, ikke <s<strong>tr</strong>ong>for</s<strong>tr</strong>ong> medlemmer <s<strong>tr</strong>ong>af</s<strong>tr</strong>ong> cellulase familierne, uanset at disse<br />

enzymer udviser samme specificitet over<s<strong>tr</strong>ong>for</s<strong>tr</strong>ong> 1,4-β-glucosid bindinger od deler<br />

tertiær s<strong>tr</strong>uktur med typiske cellulaser.<br />

Klassifikationen <s<strong>tr</strong>ong>af</s<strong>tr</strong>ong> cellulolytiske enzymer sker ud fra s<strong>tr</strong>ukturelle egenskaber i<br />

deres katalytiske domæne, baseret på hydrofobisk kloster analyse.<br />

Side 27

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!