Mekanismer for brun- og hvidmuld svampes nedbrydning af tr - Nature

Recommendations

Info

chrom) domæne, <strong>og</strong> CBQ er CDH hvor heme domænet mangler, <strong>for</strong>mentlig <strong>for</strong>årsaget <strong>af</strong> proteolytisk spaltning [Henriksson G. et al. (2000)][Baldrian P. et al. (2008)][Zamocky M. et al. (2006)]. CDH er isoleret fra flere <strong>hvidmuld</strong>s svampe, men den eneste kendte <strong>brun</strong>- mulds svamp som danner CDH er Coniophora puteana (tabel 8). CDH se ud som om det danner en slags bro mellem cellulose- <strong>og</strong> lignin nedbrydning, idet det er i stand til indirekte at danne hydroxyl radikaler, men det er værd at nævne at der i stor udstrækning er tale om spekulationer når det gælder CDH funktion in vivo. CDH er et ekstracellulært enzym som oxiderer cellobiose, cellodextrin(cellu- looligosaccarid), mannodextrin <strong>og</strong> lactose. Produktet er en lacton <strong>af</strong> det saccarid som befandt sig i den reducerende ende <strong>af</strong> disaccariden eller dextrinen. I vandige opløsninger hydrolyseres lacton til carboxylsyre (fig. 22). De to elektron-ækvivalenter fra oxidationen kan kanaliseres over til elektronacceptorer som quinoner, phenoxy funktionelle grupper, Fe(III), Cu(II) <strong>og</strong> cytocrom c, <strong>og</strong> derved restituere enzymet [Henriksson G. et al. (2000)][Baldrian P. et al. (2008)][Zamocky M. et al. (2006)]. Fig. 22 Oxidation <strong>af</strong> det reducerende C1 carbon atom i cellobiose til korrosponderende lacton, som spontant hydrolyserer til en carboxyl syre. CDH er typisk et monomer protein med en størrelse på ca. 90-110 kDa. Glu- cosyleringen ligger mellem 10 <strong>og</strong> 20% <strong>og</strong> et isoelektrisk punkt pI = ca. 4. pH optimum ligger i området pH 4-5 (tabel 8) [Baldrian P. et al. (2008)]. Side 36
Tabel 8 Udvalgte egenskaber <strong>for</strong> isolerede cellubiose dehydr<strong>og</strong>enaser [Baldrian P. et al. (2008)]. * BR = Brunmuld, P = Phytopat<strong>og</strong>en, WR = Hvidmuld † Substrat = cellobiose. ‡ Quininer som elektronacceptorer, andre acceptorer kan udvise anderledes optima. Elektron acceptoren i CDH er FAD som via saccarid oxidationen reduceres til FADH 2 . Dette domæne kaldes det katalytiske domæne, <strong>og</strong> som antydet <strong>af</strong> at man tidligere troede at dette domæne var det komplette enzym CBQ, kan FADH 2 genoxideres direkte <strong>af</strong> elektron acceptorer som f.ek. quinoner. Ofte <strong>for</strong>egår oxidationen <strong>af</strong> FADH 2 d<strong>og</strong> via 2 successive elektron overførsler fra det katalytiske domæne til cytochrom domænets Fe(III) i ferroprotoporphyrin. I første oxidation <strong>af</strong> FADH 2 til FADH, reduceres ferroprotoporphyrin, men før anden oxidation <strong>af</strong> FADH til FAD kan ske, skal ferroprotoporphyrin oxideres <strong>af</strong> en ekstramolekylær 1 elektron accepter, da der er én ferroprotoporphyrin pr. flavin i holoenzymet. CDH har via de 2 domæner <strong>og</strong> den intramolekylære elektrontransport imel- lem disse, mulighed <strong>for</strong> at katalysere redox reaktioner på et utal <strong>af</strong> måder. Der eksisterer mindst 3 <strong>for</strong>skellige katalytiske modeller, som tilsammen ser ud til at udgøre alle tænkelige kombinationer <strong>af</strong> elektronoverførsler til <strong>og</strong>/eller fra FAD, FADH, FADH 2 , Fe(II)ferroprotoporphyrin <strong>og</strong> Fe(III)ferroprotoporphyrin (fig 23). Side 37
Page 1 and 2: Me k a n i s M e r f o r b r u n- o
Page 3 and 4: En forståelse <st
Page 5 and 6: ke M i s k s t r u k t u r a f in v
Page 7 and 8: lødtræ foretræk
Page 9 and 10: Fig. 4 Polymer til polymer koblings
Page 11 and 12: Fig. 5 A: Model af
Page 13 and 14: Fig. 8 Modeller af
Page 15 and 16: Fig. 10 Gult-fluorecerende proteinm
Page 17 and 18: hø j e r e o r d e n s s t r u k t
Page 19 and 20: Fig. 14 Cellulose fibriller fra den
Page 21 and 22: Fig. 17 FESEM af c
Page 23 and 24: serverede eller deducerede, <strong
Page 25 and 26: or g a n i sM e r n e Kun en gruppe
Page 27 and 28: ne d b r y d n i n g s M e k a n i
Page 29 and 30: Tabel 4. fortsætt
Page 31 and 32: fibriller som er det naturlige subs
Page 33 and 34: al. (2008)]. Det er meget besnæren
Page 35: Tabel 7 Udvalgte egenskaber <strong
Page 39 and 40: Tabel 9 Oxidanter og</stron
Page 41 and 42: I fig. 25 ses en for</stron
Page 43 and 44: mangan (Mn) og den
Page 45 and 46: Fig. 26 3 dimensionelle struktur <s
Page 47 and 48: Fig. 29 En mekanistisk model <stron
Page 49 and 50: Fig. 31. Venstre: Veratryl alkohol
Page 51 and 52: oxidation af et gi
Page 53 and 54: [Mester T. et al. (2001)]. la c c a
Page 55 and 56: Fig 38 Laccase katalyseret oxidatio
Page 57 and 58: ko n k l u s i o n Emnet “<strong
Page 59 and 60: [Choinowski T. et al. (1999)] Thoma
Page 61 and 62: Structure of cellulose and microcry

Mekanismer for brun- og hvidmuld svampes nedbrydning af tr - Nature

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?