Biophysical studies of membrane proteins/peptides. Interaction with ...

PREFÁCIO
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Biomembranas são estruturas de complexa composição química. As diversas classes
de moléculas presentes, em especial lípidos e proteínas, apresentam propriedades e
afinidades muito diferenciadas. Esta diferenciação resulta na ocorrência de
heterogeneidades na distribuição lateral dos componentes na membrana. De facto, crêse
que a célula controla certas actividades celulares operadas em biomembranas, através
da mediação da distribuição destes componentes. Um maior conhecimento acerca das
interacções estabelecidas entre os componentes de membranas biológicas é portanto de
importância crucial para a compreensão das funções celulares baseadas nestas
estruturas. Por outro lado as drogas são frequentemente dirigidas à interacção com
proteínas inseridas em biomembranas. Assim, a caracterização das interacções destas
moléculas com a bicamada lipídica e com os seus alvos proteicos é de grande relevância
no processo de desenvolvimento de fármacos.
Os estudos que compõem esta tese resultaram da aplicação de técnicas físicas,
nomeadamente metodologias de fluorescência, à caracterização de interacções entre
diversos componentes de membranas biológicas e de interacções proteína-fármacos.
Sistemas modelo mimetizadores de membranas biológicas (lipossomas) foram
utilizados de forma a trabalhar sobre uma base de estudo simplificada, mantendo ainda
as propriedades fundamentais das biomembranas.
Esta tese foi objecto dos seguintes artigos já publicados ou submetidos para
publicação:
Fernandes, F., Loura, L. M. S., Prieto, M., Koehorst, R., Spruijt, R., and Hemminga, M. (2003).
Dependence of M13 major coat protein oligomerization and lateral segregation on bilayer
composition. Biophys. J. 85: 2430-2431.
Fernandes, F., Loura, L. M. S., Koehorst, R., Spruijt, R., Hemminga, M., Fedorov, A., and
Prieto, M. (2004). Quantification of protein-lipid selectivity using FRET. Application to the
M13 major coat protein. Biophys. J. 87: 344-352.
Fernandes, F., Loura, L. M. S., Koehorst, R., Dixon, N., Kee, T. P., Hemminga, M., and Prieto,
M. (2006). Interaction of the indole class of V-ATPase inhibitors with lipid bilayers.
Biochemistry 45: 5271-5279.
Fernandes, F., Loura, L. M. S., Koehorst, R., Dixon, N., Kee, T. P., Prieto, M., and Hemminga,
M. (2006). Binding assays of inhibitors towards selected V-ATPase domains. Biochim Biophys
Acta. 1758: 1777-1786.
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