Biophysical studies of membrane proteins/peptides. Interaction with ...

Fernandes, F., Loura, L. M. S., Fedorov, A., and Prieto, M. (2006). Absence of clustering of
phosphatidylinositol-(4,5)-bisphosphate in fluid phosphatidylcholine. J. Lipid Res. 47: 1521-
1525.
Fernandes, F., Neves, P., Gameiro, P., Loura, L. M. S., and Prieto, M. Ciprofloxacin
Interactions With Bacterial Protein OmpF: Modelling of FRET from a Multi-Tryptophan
Protein Trimer (aceite para publicação).
Fernandes, F., Loura, L. M. S., Matos, A. P., Fedorov, A., and Prieto, M. Role of Helix-0 of the
N-BAR domain in membrane curvature generation. (submetido).
Uma vez que a maior parte do trabalho já foi aceite para publicação em revistas
internacionais, optou-se pela sua apresentação na forma de artigo científico e pela
redacção desta tese em língua inglesa.
Este manuscrito está dividido em nove partes. No primeiro Capítulo é feita uma
introdução às biomembranas e às interacções proteína-lípido. Na segunda parte, os
trabalhos respeitantes ao estudo da interacção da proteína principal da cápside do
baacteriófago M13 são apresentados. O Capítulo III é dedicado aos estudos de
interacção do potencial fármaco SB242784 com sistemas modelo de membranas e da
ligação de inibidores da V-ATPase a um péptido contendo um putativo local de ligação
para estes inibidores. No Capítulo IV é apresentado o trabalho respeitante aos estudos
de ligação do antibiótico ciprofloxacina à proteína membranar OmpF. Seguidamente, no
Capítulo V, os estudos da interacção do péptido N-terminal do domínio N-BAR com
sistemas modelo de membranas são introduzidos e o Capítulo VI é dedicado aos estudos
de caracterização da distribuição lateral de fosfoinositol-(4,5)-bisfosfato em liposomas
de fosfocolinas. Os Capítulos II a VI, são sempre iniciados com uma breve introdução
aos sistemas estudados.
No Capítulo VII são apresentadas as conclusões globais referentes aos estudos de
cada um dos sistemas investigados. Finalmente, o Capítulo VIII é dedicado à
apresentação de considerações finais e perspectivas futuras e o Capítulo IX compreende
a bibliografia.
Gostaria ainda de finalizar agradecendo sinceramente a todos que de uma maneira
ou outra contribuiram para a realização dos trabalhos aqui descritos:
Agradeço ao Centro de Química-Física Molecular, na pessoa do Professor José
Manuel Gaspar Martinho, pelas facilidades concedidas para a realização deste trabalho.