Stage de Master 2 au Muséum National d - MAG' SITE
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2.3.3 Espèces non-planctotrophes lécithotrophes<br />
Le genre Bolma Risso, 1826 (Vetigasteropoda, Turbinidae)<br />
Les larves du genre Bolma sont véligères mais n’ont pas <strong>de</strong> métatroque (ban<strong>de</strong> ciliée<br />
servant à la nutrition <strong>de</strong> la larve), ce qui ne leur permet pas <strong>de</strong> se nourrir dans le plancton.<br />
Les spécimens attribués <strong>au</strong> genre Bolma (Turbinidae) dont nous disposions<br />
présentaient un éventail <strong>de</strong> formes suggérant une forte diversité spécifique. Lors d’une<br />
campagne <strong>au</strong>x îles Salomon, une forme proche morphologiquement d’<strong>au</strong> moins une <strong>de</strong>s<br />
formes récoltées sur les ri<strong>de</strong>s a été récoltée en abondance à une même station. Cet échantillon<br />
a été inclus dans la présente étu<strong>de</strong> afin d’élargir l’aire géographique échantillonnée et donc <strong>de</strong><br />
mieux cerner la question <strong>de</strong> l’endémisme potentiel <strong>de</strong>s espèces. La phylogénie <strong>de</strong>s Turbinidae<br />
est encore mal établie. Wiliam et Ozawa (2006) ont montré que cette famille était<br />
polyphylétique, pour cette raison l’arbre du genre Bolma n’a pas été enraciné. En revanche la<br />
diversité spécifique a été <strong>au</strong>gmenté par le rajout <strong>de</strong> trois espèces morphologiquement très<br />
différenciées <strong>de</strong> l’ensemble <strong>de</strong> l’échantillonnage <strong>de</strong>s Bolma afin <strong>de</strong> visualiser les distances<br />
entre chaque groupe morphologique.<br />
2.4 ANALYSES MOLECULAIRES<br />
2.4.1 Extraction <strong>de</strong>s ADN tot<strong>au</strong>x<br />
L’extraction <strong>de</strong>s ADN tot<strong>au</strong>x (ADN nucléaires et mitochondri<strong>au</strong>x) a été réalisée à<br />
partir d’un morce<strong>au</strong> (5 à 50µg) du muscle du pied <strong>de</strong>s individus. Les tissus et les protéines<br />
sont d’abord digérés dans 150 µl <strong>de</strong> NucPrep Digestion Buffer et 50 µl <strong>de</strong> NucPrep Proteinase<br />
K Solution, puis placés dans un thermomixer Eppendorf Confort pendant 12 heures à 55°C<br />
avec une agitation réglée à 500 tours par minute. L’ensemble <strong>de</strong>s opérations d’extraction se<br />
fait sur <strong>de</strong>s plaques <strong>de</strong> 96 puits adaptées <strong>au</strong> système ABI PRISM 6100 (Applied Biosystem).<br />
Les ADN tot<strong>au</strong>x sont déposés sur une membrane <strong>de</strong> silicate préalablement humidifiée <strong>au</strong><br />
NucPrep Digestion Buffer. Cette membrane chargée positivement retient l’ADN tandis que<br />
les produits <strong>de</strong> la lyse cellulaire sont filtrés trois fois avec 160 µl <strong>de</strong> solution tampon à base<br />
d’éthanol. Les ADN sont ensuite décrochés <strong>de</strong> la membrane et récupérés par variation <strong>de</strong> pH<br />
<strong>de</strong>s <strong>de</strong>ux tampons d’élution (volume totale d’élution <strong>de</strong> 160µl).<br />
Matériel et Métho<strong>de</strong>s 12