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Stage de Master 2 au Muséum National d - MAG' SITE

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2.3.3 Espèces non-planctotrophes lécithotrophes<br />

Le genre Bolma Risso, 1826 (Vetigasteropoda, Turbinidae)<br />

Les larves du genre Bolma sont véligères mais n’ont pas <strong>de</strong> métatroque (ban<strong>de</strong> ciliée<br />

servant à la nutrition <strong>de</strong> la larve), ce qui ne leur permet pas <strong>de</strong> se nourrir dans le plancton.<br />

Les spécimens attribués <strong>au</strong> genre Bolma (Turbinidae) dont nous disposions<br />

présentaient un éventail <strong>de</strong> formes suggérant une forte diversité spécifique. Lors d’une<br />

campagne <strong>au</strong>x îles Salomon, une forme proche morphologiquement d’<strong>au</strong> moins une <strong>de</strong>s<br />

formes récoltées sur les ri<strong>de</strong>s a été récoltée en abondance à une même station. Cet échantillon<br />

a été inclus dans la présente étu<strong>de</strong> afin d’élargir l’aire géographique échantillonnée et donc <strong>de</strong><br />

mieux cerner la question <strong>de</strong> l’endémisme potentiel <strong>de</strong>s espèces. La phylogénie <strong>de</strong>s Turbinidae<br />

est encore mal établie. Wiliam et Ozawa (2006) ont montré que cette famille était<br />

polyphylétique, pour cette raison l’arbre du genre Bolma n’a pas été enraciné. En revanche la<br />

diversité spécifique a été <strong>au</strong>gmenté par le rajout <strong>de</strong> trois espèces morphologiquement très<br />

différenciées <strong>de</strong> l’ensemble <strong>de</strong> l’échantillonnage <strong>de</strong>s Bolma afin <strong>de</strong> visualiser les distances<br />

entre chaque groupe morphologique.<br />

2.4 ANALYSES MOLECULAIRES<br />

2.4.1 Extraction <strong>de</strong>s ADN tot<strong>au</strong>x<br />

L’extraction <strong>de</strong>s ADN tot<strong>au</strong>x (ADN nucléaires et mitochondri<strong>au</strong>x) a été réalisée à<br />

partir d’un morce<strong>au</strong> (5 à 50µg) du muscle du pied <strong>de</strong>s individus. Les tissus et les protéines<br />

sont d’abord digérés dans 150 µl <strong>de</strong> NucPrep Digestion Buffer et 50 µl <strong>de</strong> NucPrep Proteinase<br />

K Solution, puis placés dans un thermomixer Eppendorf Confort pendant 12 heures à 55°C<br />

avec une agitation réglée à 500 tours par minute. L’ensemble <strong>de</strong>s opérations d’extraction se<br />

fait sur <strong>de</strong>s plaques <strong>de</strong> 96 puits adaptées <strong>au</strong> système ABI PRISM 6100 (Applied Biosystem).<br />

Les ADN tot<strong>au</strong>x sont déposés sur une membrane <strong>de</strong> silicate préalablement humidifiée <strong>au</strong><br />

NucPrep Digestion Buffer. Cette membrane chargée positivement retient l’ADN tandis que<br />

les produits <strong>de</strong> la lyse cellulaire sont filtrés trois fois avec 160 µl <strong>de</strong> solution tampon à base<br />

d’éthanol. Les ADN sont ensuite décrochés <strong>de</strong> la membrane et récupérés par variation <strong>de</strong> pH<br />

<strong>de</strong>s <strong>de</strong>ux tampons d’élution (volume totale d’élution <strong>de</strong> 160µl).<br />

Matériel et Métho<strong>de</strong>s 12

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