Stage de Master 2 au Muséum National d - MAG' SITE

l’intérieur des populations (Fsc = 0,31, p-value = 0,38), ni entre les populations d’une même
ride (Fst = 0,031, p-value = 0,09). Par contre, le paramètre de différenciation génétique entre
les deux rides (Fct =0,01) était faible, mais significatif (p-value =0,02), suggérant une légère
structure génétique entre les populations des deux rides.
Afin de tester ces résultats, trois AMOVA subséquentes, à un seul facteur et plus
robustes, ont été réalisées.
Deux premières AMOVA ont été réalisées de manière indépendante sur chaque ride.
Ceci permettait de s’assurer de la réelle absence de structure génétique au sein d’une ride. En
effet, les différences génétiques inter ride, potentiellement plus importantes, pourraient
masquer les différences intra ride, plus faibles, les rendant non significatives dans l’analyse à
2 facteurs. Aucune de ces deux AMOVA ne présentait un Fst significatif (p-value(Norfolk) =
0,66, p-value(Lord Howe)=0,25) confirmant ainsi l’absence de structure au sein d’une ride.
Dans la troisième AMOVA réalisée, les populations de chaque ride ont été rassemblées en un
même groupe. Cela permet de mieux estimer la variance au sein de chaque ride grâce à un
effectif plus grand et donc de comparer la diversité génétique entre la ride de Lord Howe et la
ride de Norfolk. La structuration entre les deux rides est plus élevée que dans la première
analyse (Fst =0,031, p-value= 0,04), confirmant ainsi le résultat obtenu.
Réseau d’haplotypes
Le réseau présente un haplotype majoritaire présent dans toutes les régions (fig. 11).
Deux haplotypes secondaires bien représentés sont respectivement séparés par 1 et 8 pas
mutationnel de l’haplotype majoritaire. Aucune structure n’est mise en évidence. Une
diversité haplotypique plus importante est présente sur la ride de Lord Howe.
3.3 Les espèces lécithotrophes
3.3.1 Le genre Bolma
Barcode et arbres de distances
L’arbre construit à partir de la matrice de distance met en évidence dix groupes
majeurs d’haplotypes – Groupes A, B, C, D, E, F, G, H, I et J, fig. 12 – soutenus par des
valeurs de bootstraps comprises entre 90 et 100 %. A l’échelle des deux rides, les dix groupes
sont en sympatrie, et au sein de chaque groupe, les populations sont soit en allopatrie (sites
Résultats 23