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900 800 700 600 500 400 300 200 100 0 Plateau Chesterfield des Chesterfield Chesterfield Bellona Nord-Ouest Bellona Nord Nova Sud Lansdowne Ile des Pins Stylaster Crypthélia Jumeau Est Eponge 91 Figure 2 : Arbre des p-distances entre les différents haplotypes (h=39) échantillonnés pour le genre Nassaria dans les régions des deux rides de monts sous-marins : Lord Howe (représentés par des carrés colorés selon la population) et Norfolk (représentés par des triangles colorés selon la population). Les valeurs des nœuds correspondent aux bootstraps supérieurs à 50%. Trois Bursidae forment le groupe extérieur. Fréquence absolue 0,02 Groupe X Groupe Y 78 67 77 0 0,004 0,008 0,012 0,016 0,02 0,024 0,028 0,032 0,036 0,04 0,044 0,048 0,052 0,056 0,06 0,064 0,068 0,072 58 62 99 67 62 54 97 55 81 69 99 NB 1098 NB 1115 50 94 99 59 A B C D Cancellopollia Figure 3 : Histogramme représentant les fréquences absolues des p-distances entre individus pour le genre Nassaria. Les distances intragroupes figurent en bleu et les distances intergroupes en mauve. p-distance 1
3 RESULTATS Le séquençage des produits d’amplification du gène COI (680 paires de bases) ont permis d’obtenir 517 séquences d’individus sur les 605 spécimens retenus préalablement pour l’analyse. Leur répartition au niveau spécifique figure dans l’annexe 1. La longueur des séquences analysées varie de 567 à 658 paires de bases selon les individus séquencés. Cette longueur dépend de la qualité des ADN extraits et de la qualité des chromatogrammes obtenus. L’alignement est non ambigu et aucun codon stop n’est observé. Comme le gène COI est codant, ce résultat indique que notre jeu de données ne contient pas de pseudogène (Bensasson, 2001) Une matrice regroupant l’ensemble des séquences du gène COI a été établie pour chaque genre (7 taxons) afin d’explorer la diversité génétique pour ce gène 3.1 Les espèces non-planctotrophes 3.1.1 Le genre Nassaria Barcode et arbres de distances L’arbre construit par la méthode de « Neighbor-Joining » sur la base des p-distances à partir de la matrice met en évidence la division du jeu de données en deux groupes majeurs d’haplotypes – Groupe X et Groupe Y, fig. 2 – soutenus par des valeurs de bootstraps de 99 et 91% respectivement. De la même façon, le diagramme (fig. 3) comprenant toutes les distances génétiques présente deux modes non chevauchants. Ce résultat indique qu’il y a deux classes de distances : les faibles correspondent en fait aux distances intraspécifiques et les fortes aux distances interspécifiques, suggérant qu’il y a au moins deux espèces dans ce jeu de données. Le premier (groupe X) est représenté par 84 individus présents sur la ride de Lord Howe et sur la partie sud de la ride de Norfolk. Aucun de ces individus n’a été échantillonné sur l’île des Pins. La distance génétique maximale entre deux individus de ce groupe est égale à 2,4 % ; ils sont caractérisés dans l’arbre par des longues branches (NB 1098 et NB 1115) (fig. 2). Étant donné le fort effectif échantillonné pour ce groupe et la présence de deux Résultats 17
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Page 65: 6 BIBLIOGRAPHIE Barton, N.H., 1998.
Page 69: Samadi, S., Bottan, L., Macpherson,
Page 73: Matériel biologique Analyse N h S

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