faci<strong>le</strong>ment si nécessaire par la suite. Il peut toutefois être envisagé de saisir simp<strong>le</strong>ment cesdeux types de données dans des documents Excel, <strong>le</strong> calcul des indices classiques décrivant<strong>le</strong>s peup<strong>le</strong>ments ichtyologiques (cf. partie suivante) pouvant être effectué de la même manièredans <strong>le</strong>s deux cas.Une fois <strong>le</strong>s données saisies, il s’agira d’examiner <strong>le</strong>s transects potentiel<strong>le</strong>mentinvalides ou aberrants. Dans <strong>le</strong> cas de cette méthode, la principa<strong>le</strong> source de rejet d’untransect est un manque de visibilité. Si la visibilité au moment du comptage n’a pas permis aucompteur d’observer <strong>le</strong>s poissons sur une bande de 8 m de large au fond (si c’est cette va<strong>le</strong>urde couloir qui a été initia<strong>le</strong>ment choisie), <strong>le</strong> transect ne pourra pas être pris en compte dans defutures analyses car il ne sera pas comparab<strong>le</strong> aux autres transects. La profondeur moyennesur <strong>le</strong> transect et la visibilité, évaluées sur <strong>le</strong> terrain, permettent de calcu<strong>le</strong>r la largeur de labande visib<strong>le</strong> au fond par <strong>le</strong> compteur pour chaque transect, et donc de rejeter <strong>le</strong>s transectspour <strong>le</strong>squel<strong>le</strong>s la visibilité était trop faib<strong>le</strong> pour obtenir des mesures standardisées despeup<strong>le</strong>ments de poissons.IV.3.2. Calculs des indices classiques pour <strong>le</strong>s peup<strong>le</strong>ments de poissonComme indiqué précédemment, <strong>le</strong>s données de comptage col<strong>le</strong>ctées permettent decalcu<strong>le</strong>r <strong>le</strong>s indices écologiques classiques décrivant <strong>le</strong>s peup<strong>le</strong>ments ichtyologiques. Il s’agitde l’abondance et de la densité, de la biomasse, de la tail<strong>le</strong> moyenne, et de la diversité. A titreinformatif, <strong>le</strong>s modes de calcul de ces différents paramètres sont présentés ci-dessous. Selonl’objectif et <strong>le</strong> niveau d’expertise des acteurs en charge du suivi, <strong>le</strong>s données col<strong>le</strong>ctées et cesparamètres pourront permettre de poursuivre vers différents types d’analyses statistiques, <strong>le</strong>sdonnées récoltées pouvant être analysées et utilisées de la même manière que <strong>le</strong>s données decomptages comp<strong>le</strong>ts classiques.Abondance et densitéL’abondance tota<strong>le</strong> sur un transect correspond à la somme des poissons observés sur <strong>le</strong>transect. La densité, plus communément utilisée en écologie, est l’abondance par unité desurface (nombre de poissons/m²). El<strong>le</strong> s’obtient donc en divisant l’abondance par la surfacesur laquel<strong>le</strong> ont été comptés <strong>le</strong>s poissons (dans <strong>le</strong> cas présent : 800m², mais pouvant êtredifférente selon <strong>le</strong> cas de figure). Les calculs d’abondance et de densité peuvent être effectuéspar sous-groupe (espèces, groupes trophiques, etc.) selon <strong>le</strong>s objectifs de l’analyse.BiomasseLa première étape pour <strong>le</strong> calcul de la biomasse est d’estimer <strong>le</strong> poids des individusobservés, à partir de <strong>le</strong>ur longueur. La formu<strong>le</strong> classiquement utilisée pour ce calcul est :Poids = (a × Longueur) b , où a et b sont des coefficients propres à chaque espèce ou à chaquegroupe d’espèces. Kulbicki et al. (2005a) fournit <strong>le</strong>s va<strong>le</strong>urs de ces coefficients à diversniveaux taxonomiques pour un grand nombre de poissons récifo-lagonaires de l’Indo-Pacifique. Ces coefficients peuvent éga<strong>le</strong>ment être obtenus sur <strong>le</strong> site de FishBase(www.fishbase.fr). Une fois <strong>le</strong>s poids des individus calculés, il est possib<strong>le</strong> d’obtenir en <strong>le</strong>sadditionnant la biomasse tota<strong>le</strong> sur <strong>le</strong> transect, ou par groupes d’espèces. De même que ladensité, la biomasse est classiquement exprimée par unité de surface, en g/m².32
Tail<strong>le</strong> moyenneIl s’agit de la moyenne des tail<strong>le</strong>s des poissons observés sur <strong>le</strong> transect. On peutcalcu<strong>le</strong>r la tail<strong>le</strong> moyenne généra<strong>le</strong> sur <strong>le</strong> transect ou par groupe d’espèces.DiversitéLe calcul d’un indice de diversité n’est pas nécessairement pertinent lorsque l’ontravail<strong>le</strong> à partir d’une liste restreinte d’espèces. L’utilité de son calcul dépendra donc de laliste considérée (inuti<strong>le</strong> si l’on suit une ou deux espèces par exemp<strong>le</strong>). Comme dans laprésente étude, il peut toutefois être intéressant de déterminer <strong>le</strong> nombre d’espèces observéessur un transect parmi <strong>le</strong>s espèces de la liste.33
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