Analiza Chimica si Instrumentala Aplicata - AcademicDirect

Lorentz JÄNTSCHI, Sorana BOLBOACĂ
Metoda Single Point determină energia totală a sistemului molecular. Pentru aceasta
foloseşte modulul de calcul MM+:
Geometry Optimization calculează structura moleculei şi alege acea structură cu energie
minimă şi forţe atomice minimale:
Molecular Dynamics simulează mişcarea moleculară şi se pot observa de aici proprietăţile la
echilibru şi cinetica moleculei. Langevin Dynamics calculează modul de mişcare a atomilor pentru
toţi atomii moleculei într-un interval de timp de ordinul picosecundelor. Monte Carlo înglobrează
mediile atomilor selectaţi sau a tuturor atomilor din moleculă şi efectuează calculele conform
modelelor de mecanică moleculară, semiempirice şi ab initio. Se salvează fişierele într-un format
recunoscut de aplicaţii RasMol şi gNMR (vezi aceste aplicaţii):
Se va folosi programul RasMol pentru vizualizarea spaţială a geometriei
(http://www.umass.edu/microbio/rasmol/) creat de un grup de cercetători din domeniul
microbiologiei din Morrill IV North, Univ Massachusetts, Amherst, USA. Se încarcă aplicaţia
folosind scurtătura acesteia după care apare meniul aplicaţiei:
Cu ajutorul meniului File se deschid fişierele create cu HyperChem:
45