1 Menneskets genom

18209 01.fm7 Page 45 Friday, March 3, 2006 12:37 PM
sæt af tRNA-molekyler som definerer mitokondriernes
specielle variant af den genetiske
kode (Tabel 1.7); her koder UGA for tryptofan
(Trp), og AGA og AGG fungerer som supplerende
stopcodons i stedet for at kode for arginin
(Arg).
Translation og posttranslationelle
modifikationer
Et segment af en nukleotidsekvens kan læses i tre
forskellige læserammer (Figur 1.30, læserammerne
A, B og C), men kun én af dem er rigtig (A i
Figur 1.30 se dog side 32, Figur 1.23). Den defineres
oftest af den første AUG-sekvens i mR-
NA’et, som så er codon 1, og nysyntetiserede
polypeptider har, som tidligere nævnt (side 43),
Fra DNA til protein
Tabel 1.6 Den genetiske standardkode. Aminosyrerne er angivet ved deres tre- og étbogstavkode (se tabel
i Appendix, side 35). Man har konventionelt bestemt at en codon skrives med 5'-nukleotidet til venstre.
GCA
GCC
GCG
GCU
AGA
AGG
CGA
CGC
CGG
CGU AAC
AAU GAC
GAU UGC
UGU CAA
CAG GAA
GAG
GGA
GGC
GGG
GGU CAC
CAU
AUA
AUC
AUU
UUA
UUG
CUA
CUC
CUG
CUU AAA
AAG AUG UUC
UUU
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V
*) I enkelte nukleære gener fungerer UGA som codon for selenocystein.
methionin som N-terminal aminosyre. Efter
translationen undergår polypeptidet forskellige
former for kemiske ændringer, såkaldte posttranslationelle
modifikationer, som er nødvendige
for at opnå det modne slutprodukt, fx et aktive
enzym. Ud over fraspaltning af en eller flere
aminosyrer, herunder den N-terminale methionin,
kan de posttranslationelle modifikationer typisk
bestå i oxidation af cysteiner for at danne
disulfidbroer, samt i glykosylering, fosforylering
etc. Et polypeptids aminosyresekvens betegnes
dets primære struktur og er af afgørende betydning
for sekundærstrukturen, der er den tredimensionelle
form på dele af et polypeptid eksempelvis
α-helix og β-sheet. Den tertiære struktur
er den foldede form af hele polypeptidet,
Figur 1.29 Transkription og translation. A. Det første trin i gen-ekspressionen er transkription af den ene DNA-streng
med dannelse af komplementært RNA. Processen styres af mange proteiner kaldet transkriptionsfaktorer. RNA-syntesen
foregår ved hjælp af RNA-polymerase og kræver at DNA-dobbelthelix åbnes. Syntesen sker i 5' → 3'-retningen,
dvs. komplementært til 3' → 5'-retningen på den DNA-streng der fungerer som template.
Efter transkriptionen sker der en RNA-processering og -splejsning med dannelse af mRNA. B. Translationen er den
proces hvor en række af codons i mRNA oversættes til en korresponderende aminosyresekvens på ribosomerne i cytoplasmaet.
Translationen sker i en læseramme, som defineres af start-codon AUG. De enkelte codons er nummereret.
C. Man definerer tre trin under translationen: initiering, elongering og terminering. Hvert af disse trin har forskellige
proteiner som regulerer processen. De enkelte aminosyrer bringes til ribosomet af specifikke tRNA-molekyler via anticodon
som baseparrer med den rette aminosyrecodon i mRNA. Når to aminosyrer sidder tæt ved hinanden dannes der
en peptidbinding mellem dem, det næstsidst ankomne tRNA frigøres, og ribosomet bevæger sig en codon til højre, hvor
processen gentages til der optræder en stopcodon. D. Til venstre er vist tRNA på såkaldt kløverbladsform. Acceptorarmen
(3'-enden) binder den specifikke aminosyre, i dette eksempel fenylalanin, hvilket kan aflæses af anticodon. Den
tredimensionelle struktur af tRNA er vist til højre. De forskellige loops har funktioner i relation til at elongeringsprocessen
forløber uden fejl. markerer modificeret nukleotid.
CCA
CCC
CCG
CCU
AGC
AGU
UCA
UCC
UCG
UCU
ACA
ACC
ACG
ACU UGG UAC
UAU
Ala Arg Asn Asp Cys Gln Glu Gly Hls Ile Leu Lys Met Phe Pro Ser Thr Trp Tyr Val stop
GUA
GUC
GUG
GUU
UAA
UAG
UGA *
45