Diplom - Institut für Chemie und Biochemie an der FU Berlin - Freie ...

20 KAPITEL 3. EXPERIMENTELLER TEIL
3.4 Strukturlösung und Multipolverfeinerung
Die Strukturlösung und sphärische Verfeinerung erfolgte mit dem Programm shelx.
Dabei konnte die Struktur bis zu einem R-Wert von 3.6 % verfeinert werden.
Die Multipolverfeinerung führte zu einem R-Wert von 3.0 % und einem goodness
of fit von 1.83. Auf eine Verfeinerung des Ausdehnungskoeffizienten (κ) wurde
verzichtet. Aufgrund der Symmetrie des Moleküls (D2h), die im Kristallgitter erhalten
bleibt, können nur einige Multipolpopulationen verfeinert werden. Aus diesen
Einschränkungen (Tabelle 3.4) ergibt sich ein Verhältnis von gemessenen Reflexen
zu Parametern von 16.9.
Atom Atom0 Achse Atom1 Atom2 Achse
O N X O DUM0 Y
N DUM1 Z N DUM0 Y
Tabelle 3.2: Lokales Koordinatensystem
O 0.141351 0.327516 0.000000
N 0.000000 0.386778 0.000000
DUM0 0.3000 0.386778 0.0000
DUM1 0.000000 0.613196 0.000000
Tabelle 3.3: Koordinaten der Atome
Die Orientierung der Multipolfunktionen wird vom
Programm XD vorgegeben. Durch die Bestimmung eines
lokalen Kordinatensystems für jedes Atom (Tabelle
3.2) mit Hilfe der Positionen im globalen Koordinatensystem
(Tabelle 3.3) ist es möglich die Symmetrie des
Kristallsystems bei der Verfeinerung der Multipole explizit
vorzugeben (3.4).
Die Deformationselektronendichte berechnet sich aus
der Differenz dieses Multipolmodells und eines Promoleküls,
welches auf einem sphärischen Modell basiert.
Die Deformationselektronendichtekarten sowie
die topologischen Eigenschaften wurden mit dem Programmteil
xdprop berechnet. Durch das Programm
TOPXD ist eine Analyse der atomaren Eigenschaften
der experimentellen Elektronendichte aus den so gewonnenne
Multipolpopulationen nach Bader möglich.
Parameter O N
M1 + +
M2 − −
D1+ + −
D1− + −
D0 − +
Q0 + +
Q1+ − −
Q1− − −
Q2+ + +
Q2− + −
O0 − +
O1+ + −
O1− + −
O2+ − +
O2− − −
O3+ + −
O3− + −
H0 + +
H1+ − −
H1− − −
H2+ + +
H2− + −
H3+ − −
H3− − −
H4+ + +
H4− + −
Tabelle 3.4: Multipolparameter
bei der Verfeinerung