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24 Firmenportrait
Abb. 3: Screenshot der phylogenetischen Software tree by nadicom
Mikroorganismen spezifisch sind. Anschließend werden die PCR-
Produkte kloniert und die Klone sequenziert.
Die so erhaltenen Sequenzdaten werden in der nadicom-
Datenbank analysiert und auf Wunsch in phylogenetische Stammbäume
eingerechnet. Zur quantitativen Analyse von Mikroorganismen
werden ebenfalls molekularbiologische Methoden angewandt,
wozu u.a. die quantitative Real-Time-PCR gehören.
Auftragsanalysen Proteinchemie
nadicom bietet im Bereich der Proteinchemie einen Komplettservice
für Proteine und Enzyme nach der Devise: Vom Gen bis zum Protein
– alle Schritte aus einer Hand.
Zur Expression und Charakterisierung von Proteinen aus unterschiedlichen
Organismen werden hierzu verschiedene pilzliche
Systeme eingesetzt.
Isolierung und Kultivierung von Produktionsstämmen
Seit letztem Jahr wurde ferner die Isolierung und Kultivierung von
neuen bakteriellen Produktionsstämmen in unser Programm aufgenommen.
Durch die vorhandene große Ressource an Umweltproben
aus Böden, Sedimenten und anderen Habitaten haben wir die
Möglichkeit, gezielt nach neuen Stämmen zu suchen, die neue
Eigenschaften aufweisen, bzw. in der Produktionsleistung bestehende
Stämme übertreffen.
Das nadicom-Labor ist sowohl für aerobe als auch anaerobe
Kultivierung ausgestattet. Da es sich bei den isolierten Bakterienstämmen
um noch nicht beschriebene Stämme handelt, wird eine
Patentfreiheit auf diese Stämme garantiert.
Phylogenetische Software
Neben den Dienstleistungsangeboten hat die nadicom GmbH die
phylogenetische Software tree by nadicom entwickelt. tree ist ein
Software-Paket, das die schnelle und zuverlässige Identifizierung
von kultivierten und nicht kultivierten Mikroorganismen ermöglicht.
tree basiert auf der erfolgreichen Methode der vergleichenden
Analyse ribosomaler RNA-Sequenzen. Das Basispaket umfasst die
für die Identifikation von Bakterien und Pilzen notwendigen 16S
rDNA und 18S rDNA-Datenbanken. Mittlerweile sind auch ITS-
Datenbanken erhältlich. Regelmäßige Updates der tree-Datenban-
ken durch nadicom garantieren die fortdauernde Aktualität der
Referenzen und eine Identifizierung auf höchstem Niveau. Die Software
enthält mittlerweile 35 umfangreiche Datenbanken mit über
40.000 Sequenzdaten.
tree by nadicom beinhaltet folgende Features:
• Einfacher verständlicher Aufbau der Software
für ein effizientes Arbeiten
• Alle Arbeitsschritte von den Rohdaten zum
aufgearbeiteten Baum in einem Programm
• Optimale Korrekturmöglichkeiten der Rohdaten
im Kontext der bestehenden Datenbank (Aufarbeitung
von Elektropherogrammen)
• Zuverlässige automatische Eingliederung der Sequenzen in den
Kontext des bestehenden Datenbank-Alignments
• Generierung eigener Datenbanken
• Stets reproduzierbare Berechnung
phylogenetischer Stammbäume
• Datenverwaltung für die langfristige Archivierung eigener
Sequenzen mit integrierter Datenbankfunktionalität
• Erstellung eigener DNA-basierter Datenbanken
• Export aller Ergebnisse und Daten in Standardformate
• Generierung von Daten entsprechend der GMP-Richtlinien und
der Vorgaben industrieller Kunden
• Integrierter Online-BLAST zu NCBI
• tree ist Windows®-basierend und zeichnet sich
durch seine intuitive Benutzerführung aus.
Neben der GMP-basierten Industrie-Version wird eine Universitäts-
Version angeboten, die sich durch größtmögliche Entscheidungsfreiheit
des Anwenders kennzeichnet. So wurden hier Beschränkungen
aufgehoben und gegen eine größere Eigenverantwortung des
akademischen Nutzers getauscht.
Entwicklung des Unternehmens
Die nadicom Gesellschaft für angewandte Mikrobiologie mbH wurde
im Februar 2002 von dem Biologen Dr. Bernhard Nüßlein als Spin-
Off des Max-Planck-Institutes für terrestrische Mikrobiologie in Marburg
gegründet, wo das Unternehmen auch seinen Firmensitz hat..
In den Laboren der Karlsruher Niederlassung werden sämtliche
Analysen für Kunden durchgeführt, die sich aus führenden Pharmaherstellern
und -abfüllern, Lebensmittelproduzenten, dem Kosmetik-
und Forschungsbereich in Deutschland und Europa zusammensetzen.
Seit Beginn der Vermarktung der Software tree by nadicom in
2006 konnte der Umsatz signifikant gesteigert werden. Ein Meilenstein
in der Firmengeschichte bildete die GMP-Zertifizierung im Juli
2008. Hiermit wurde dem ausgeprägten Qualitätsbewusstsein des
Unternehmens Rechnung getragen.
Literatur
Horton, T R, & Bruns, T. D. (2001). The molecular revolution in ectomycorrhizal
ecology: peeking into the black-box. Molecular Ecology, 10(8), 1855-1871
Kontakt
nadicom GmbH
Dr. Bernhard Nüßlein, CEO
Hertzstraße 16, 76187 Karlsruhe
Tel. 0721-608-4481
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