Thèse Correia Daniela version de diffusion - Université de Bourgogne

permettent d’explorer le polymorphisme aux différents niveaux (genre, espèce, souche). Ces
techniques sont rapides et présentent une bonne reproductibilité.
Afin d’être le plus discriminant possible, il est nécessaire de choisir des régions cibles
d’ADN, comportant des séquences conservées chez tous les micro-organismes, avec une
variabilité spécifique pour un genre ou une espèce. Bien que l’ADNr 18S présente ces
caractéristiques et permette de différencier des champignons de groupes taxonomiques
différents, cette région ne semble pas appropriée pour une bonne différenciation des espèces
au sein du même genre (Bruns et al., 1991). La région ITS (Internal Transcribed Spacer) est
préférentiellement utilisée par les taxonomistes pour l’identification des espèces fongiques
(Bruns et al., 1991 ; Hibbett et al., 2005).
Plus récemment, d’autres régions cibles ont été utilisées pour une discrimination au
sein de genres tels que Penicillium ou Aspergillus (Samson et al., 2004a) ; notamment des
séquences du gène de la β-tubuline, riches en introns ou le taux de variabilité semble
approprié.
1. III. 2. 1. Généralités sur les tubulines
Les tubulines constituent une famille des protéines : α (alpha)-, β (beta)-, γ (gamma)-,
δ (delta)-, ε (epsilon)-, ζ (zeta)- et η (eta)-tubulines (McKean et al., 2001). Les tubulines α et
β sont les plus répandues dans les cellules eucaryotes car elles entrent dans la composition des
microtubules. Ensemble, elles ont une masse moléculaire de 110 kDa. Les deux
hétérodimères sont alignés avec une alternance αβ pour former des protofilaments (structures
de base des microtubules) (Figure 11).
Non libre de droit de diffusion
Figure 11. Structure d’un microtubule
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