Introduction au RNA-seq - Institut de Mathématiques de Toulouse

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Préparation ation des librairies ies Kits Illumina TruSeq 4µg ARN total Adénylation des extrémités 3’ Purification et fragmentation a des ARNm Ligation des adaptateurs Synthèse du cDNA double brin Amplification par PCR Réparation des extrémités Vérification des librairies http://get.genotoul.fr
Préparation ation des librairies ies Purification des ARNm sur billes magnétiques poly-T (sauf pour les bactéries) Liaison billes poly-T Séparation Lavages/élution Echantillon non traité Echantillon traité Pourcentage d'élimination i i des ARNr 90% 98% 99% 99,90% ARNr 98% 83% 50% 33% 5% Autres 2% 17% 50% 67% 95% Kits Illumina TruSeq Fragmentation chimique de l’ARN (tampon alcalin) http://get.genotoul.fr
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