Introduction au RNA-seq - Institut de Mathématiques de Toulouse
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Exemples<br />
Microarray<br />
-Pas <strong>de</strong> détection d’épissage alternatifs<br />
<strong>de</strong>s transcrits s<strong>au</strong>f pour l’humain<br />
-Matériel moins coûteux que le<br />
séquenceur<br />
<strong>RNA</strong><strong>seq</strong><br />
- A comparer avec les Tiling array (son<strong>de</strong>s sur toute la longueur<br />
du génome)<br />
- Séquençage du cDNA double brin donc perte <strong>de</strong> l’information<br />
brin spécifique (<strong>RNA</strong> directionnel)<br />
- Hétérogénéité dans le recouvrement <strong>de</strong> certaines zones<br />
d’expression quand on fait du séquençage<br />
- Etu<strong>de</strong> <strong>de</strong>s transcrits faiblement exprimés<br />
Conclusion : les données issues <strong>de</strong> microarrays et séquençage sont globalement similaires, pour les transcrits présents en<br />
gran<strong>de</strong> quantité<br />
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