Introduction au RNA-seq - Institut de Mathématiques de Toulouse
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Préparation ation <strong>de</strong>s librairies<br />
ies<br />
‣ Influence <strong>de</strong> la préparation <strong>de</strong>s librairies<br />
Synthèse du cDNA avec <strong>de</strong>s randoms primers:<br />
la couverture du transcript n’est pas réellement aléatoire<br />
• Spécificité <strong>de</strong> séquence <strong>de</strong> la polymérase?<br />
• Réparation <strong>de</strong>s extrémités?<br />
• %GC ?<br />
<br />
Amplification par PCR<br />
Idée: supprimer totalement la PCR : actuellement, on réduit le nombre <strong>de</strong> cycles<br />
(10 cycles <strong>au</strong> lieu <strong>de</strong> 15)<br />
http://get.genotoul.fr