Introduction au RNA-seq - Institut de Mathématiques de Toulouse
Introduction au RNA-seq - Institut de Mathématiques de Toulouse
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<strong>Introduction</strong><br />
‣ Quelques définitions<br />
Séquençage : déterminer la succession linéaire<strong>de</strong>sbasesA,C,G,T<strong>de</strong>l’ADN,lalecture<strong>de</strong><br />
cette séquence permet d’étudierd l’information biologique contenue par celle-ci<br />
Séquençage Nouvelle Génération (NGS, Next Generation Sequencing) : Séquençage à très<br />
h<strong>au</strong>t débit, génération d’un très grand nombre <strong>de</strong> séquences simultanément<br />
<strong>RNA</strong>-<strong>seq</strong> : transcriptome <strong>seq</strong>uencing. Informations sur les ARN via le séquençage <strong>de</strong> l’ADN lADN<br />
complémentaire (cDNA)<br />
Re-séquencage : séquençage d’un dunfragment d’ADN et comparaison du résultat obtenu avec<br />
une séquence <strong>de</strong> référence connue<br />
Séquencage <strong>de</strong> novo :séquençage d’un génome pour lequell il n’existe pas <strong>de</strong> séquence <strong>de</strong><br />
référence, détermination d’une séquence inconnue<br />
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