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La Vague N.4 - A3P

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CONFERENCES<br />

Retrouvez tous les détails des conférences sur www.a3p.asso.fr<br />

4<br />

Rita Bienati<br />

rita.bienati.rb1@bayer-ag.de<br />

Microbial<br />

identification :<br />

Implementation of<br />

Biolog Microlog 3 in an<br />

industrial<br />

pharmaceutical<br />

<strong>La</strong>boratory for routine<br />

identification<br />

Dr. Bienati,<br />

Bayer S.p.A. (Italy)<br />

The purpose of the presentation<br />

is to explain the criteria used to choose, validate<br />

and make CFR 21, Part 11 compliant the<br />

Microstation TM Identification System 4.2. We were<br />

looking for a system that :<br />

- could provide an identification with a broad database<br />

of microorganisms,<br />

- could permit to create site specific database with<br />

common microorganisms specific for the site<br />

- could potentially be 21 CFR Part11 compliant<br />

The validation has been conducted according the<br />

classic steps of IQ/OQ/PQ ; in particularly has been<br />

focused the implementation of CFR 21, part 11<br />

that in the latest years has been an item of large<br />

interest, to arrive to an informatic management of<br />

analytical data as required by FDA.<br />

The presentation will outline the following areas<br />

- Microbial identification: Issue in the pharmaceutical<br />

Industry<br />

- Validation of the System: Protocols IQ/OQ/PQ<br />

- Approach to compliance CFR 21 Part 11<br />

- Benefits of the system. ■<br />

Richard Antonelli<br />

genolife@genolife.com<br />

Méthode<br />

de quantification<br />

des Legionella<br />

Dr Richard Antonelli,<br />

Société Genolife<br />

A l’heure actuelle la norme<br />

AFNOR de détection des<br />

légionelles se base sur l'utilisation<br />

de milieux sélectifs<br />

permettant la croissance<br />

de ces seules bactéries.<br />

L’inconvénient majeur de cette approche réside<br />

dans le fait qu’il faut 10 jours pour obtenir le résultat<br />

d’analyse. Pour remédier à cela, une nouvelle<br />

méthode de détection de légionelles, basée sur la<br />

technique de PCR quantitative, a été développée<br />

dans nos laboratoires.<br />

Le principe repose sur une quantification du nombre<br />

de légionelles présentes dans un échantillon<br />

par détermination du nombre de copies d'un gène<br />

(nombre de génome) spécifique de la bactérie à<br />

quantifier. Pour cela nous disposons de primers<br />

spécifiques permettant de détecter toutes les<br />

Legionella et plus particulièrement les Legionella<br />

pneumophila. L’ADN total de l’échantillon à tester<br />

est extrait puis analysé par PCR quantitative (voir<br />

la figure ci-après).<br />

Protocole spécifique d'extraction d'ADN sur des<br />

échantillons d'eau :<br />

Un protocole spécifique a été développé suivant un<br />

cahier des charges précis. Pour une récupération<br />

efficace des bactéries présentes dans 1 litre d'eau,<br />

la filtration sur membrane (0,45 µm de porosité) a<br />

été retenue. Cette première étape de récupération<br />

avec un filtre de 47 mm de diamètre implique de<br />

travailler avec des volumes de l'ordre du millilitre<br />

pour pouvoir effectuer efficacement la première<br />

étape de lyse bactérienne. Mais attention, à la fin<br />

du protocole d'extraction, le volume de la solution<br />

d'ADN récupéré doit être le plus petit possible<br />

pour éviter une diminution de la sensibilité de la<br />

détection liée à une dilution de l'ADN extrait.<br />

Notre protocole d'extraction d’ADN a été développé<br />

sur colonnes de silice qui se présentent en barrettes<br />

de 8 au format microplaque 96 positions. Ce<br />

type d'extraction sur matrice de silice permet : (i)<br />

de minimiser le volume de solution d'ADN élué<br />

(inférieur à 100 µl),(ii) d'obtenir des rendements<br />

d'extraction égaux à certains kits commerciaux<br />

tout en étant adapté à des volumes en entrée<br />

importants, et (iii) d’éliminer de façon optimale<br />

les inhibiteurs de type ionique et protéique.<br />

Suivant le nombre d'échantillons à traiter, le format<br />

en barrettes de 8 et en plaques de 96 permet<br />

une extraction manuelle ou automatique.<br />

Protocole de quantification des Legionella spp<br />

et Legionella pneumophila :<br />

Comme dans la norme AFNOR actuelle (microbiologique),<br />

la PCR quantitative des Legionella spp<br />

peut être effectuée en premier et seuls les échantillons<br />

positifs en Legionella seront quantifiés en<br />

Legionella pneumophila par une deuxième PCR<br />

quantitative. Un contrôle interne a été incorporé à<br />

la PCR Legionella spp qui permet d’éviter le problème<br />

des faux négatifs dus à la présence d'inhibiteurs<br />

de la PCR. Ces PCR ont été validées sur plusieurs<br />

appareils de PCR quantitative, notamment<br />

le LightCycler de Roche et le SmartCycler de<br />

Cepheid. Une norme AFNOR de quantification des<br />

Legionella et Legionella pneumophila par PCR<br />

quantitative est en phase d'écriture.<br />

Bien sûr le principe de cette méthode peut être<br />

adapté pour la quantification d'autres bactéries<br />

présentes dans des échantillons environnementaux.<br />

Par exemple, nous avons développé un test<br />

de stérilité de semi-quantification des bactéries<br />

viables utilisant la RT-PCR quantitative. ■<br />

Anne-Elise Feuillet<br />

faureingenierie.controle@dial.oleane.com<br />

Faure Ingenierie<br />

Anne-Elise Feuillet<br />

Faure ingénierie est une<br />

entreprise spécialisée dans<br />

la conception, la réalisation<br />

et la validation de<br />

salle blanche. Prestataire<br />

de service dans le domaine<br />

du contrôle environnemental,<br />

Faure Ingénierie propose<br />

aujourd’hui, l’utilisation<br />

d’une technique de<br />

microbiologie alternative pour le dénombrement<br />

de la flore totale, des levures et des moisissures :<br />

le ChemScan RDI.<br />

Le principe de cette technique est le marquage<br />

individuel des micro-organismes, sans étape de<br />

mise en culture, ce qui permet une évaluation plus<br />

fiable, plus sensible et surtout plus rapide du nombre<br />

de germes réellement présents dans l’échantillon.<br />

Celle-ci s’applique parfaitement pour le contrôle<br />

des eaux de process.<br />

Exemple de missions types :<br />

- Le suivi d’un réseau d’eaux de refroidissement<br />

qui permet une nette amélioration de la maîtrise<br />

de la contamination microbienne.<br />

- <strong>La</strong> qualification d’une centrale de production<br />

d’eau ultra pure lors de sa mise en route ou après<br />

une intervention de maintenance.<br />

De plus, grâce au nouveau «Polym’Air», mis au<br />

point par Chemunex et AES <strong>La</strong>boratoire, la technique<br />

ChemScan dispose d’une application permettant<br />

de mesurer l’aérobio-contamination et<br />

bientôt la contamination de surface.<br />

Couramment utilisée depuis maintenant 2 ans<br />

dans le secteur de la microélectronique, Faure<br />

Ingénierie souhaite développer cette technique<br />

dans le domaine pharmaceutique. Pour cela, nous<br />

proposons aux entreprises de réaliser leurs analyses<br />

dans des conditions optimum (personnel expérimenté,<br />

laboratoire ultra-propre dédié à l’activité<br />

de microbiologie.)<br />

Pour finir, certifié ISO9001 version 2000 depuis<br />

mars 2001, l’activité contrôle de Faure Ingénierie<br />

sera en conformité avec la norme ISO 17025 en<br />

octobre 2003.<br />

Pour toutes informations complémentaires vous<br />

pouvez contacter :<br />

Mlle Anne-Elise FEUILLET<br />

faureingenierie.controle@dial.oleane.com. ■

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